Browsing by Author "Öztürk, Cihat"

Now showing 1 - 3 of 3

Investigation of Antimicrobial Susceptibility and Resistance Genes in Mannheimia Haemolytica Isolates Obtained from Respiratory Tracts
(2025) Ekın, Ismail Hakki; Öztürk, Cihat
The potential transfer of antimicrobial agent residues and resistance genes in foods between bacteria creates a significant risk for public health. This research was objectived to investigate the susceptibility of Mannheimia haemolytica isolates from the respiratory tract of animals to antibiotics and antibiotic resistance genes. In the study, 48 Mannheimia haemolytica isolates were cultured by conventional methods. The susceptibilities of the isolates to antimicrobial agents were investigated comparatively by disk diffusion and e-test methods. The presence of antibiotic resistance genes in isolates found to be resistant to various antimicrobial agents was investigated by Real-Time PCR method. In this research, 66.6% of the 9 isolates detected to be resistant to antibiotics were resistant to more than one antibiotic. The macrolide resistance genes (erm42, mphE, msrE) were detected in 6 (66.6%) isolates found resistant by E test. The aminoglycoside resistance gene (strA) was also found in 5 of these 6 isolates, while none of the blaROB-1, tetH and sulII genes were detected in these isolates. Isolates resistant to macrolide group antibiotics had at least one of the erm42, mphE and msrE genes, while all isolates resistant to aminoglycoside group antibiotics had the strA gene. Furthermore, MIC values were higher in isolates with resistance genes. In conclusion, this study showed that macrolide and aminoglycoside resistance genes are responsible for the phenotypic resistance of Mannheimia haemolytica to these antibiotic groups. Furthermore, tetH, blaROB-1 and sulII genes are thought to be transported via extrachromosomal genetic elements. With this study, it was concluded that a broad perspective approach is required in the management of infections caused by Mannheimia haemolytica, in the protection of public health and in the fight against antibiotic resistance, and that it is important to conduct new studies to investigate alternative resistance mechanisms.
Solunum Sisteminden İzole Edilen Mannheimia Haemolytica İzolatlarının Tiplendirilmesi ve Virulens Genlerinin Araştırılması
(2024) Öztürk, Cihat; Ekın, Ismail Hakki
Bu çalışmada, hasta/sağlıklı sığır ve koyunların solunum yollarından izole edilen Mannheimia haemolytica izolatlarının biyokimyasal özellikleri, önemli virülens genlerinin dağılımı tespit edilmesi amaçlandı. Nazo-farengiyal ve trake-bronşiyal svap örneklerinden Real-Time PCR ile 48 (%87.3) adet Mannheimia haemolytica izolatı kullanıldı. İncelenen izolatlarda, hastalık ve virülens genleri ile ilişkili biyokimyasal özelliklerin arginin ve sorbitol testlerindeki farklılıklara göre 4 farklı biyokimyasal profil belirlendi. Real Time-PCR yöntemiyle virülens genleri incelenen izolatlarda, %37.5’i I, %33.3’ü III ve %12.5’i II olmak üzere 3 farklı virülens gen profili tespit edildi. Virülens gen profil II’ye sahip izolatlarda virülens ile ilişkili genlerin tamamı belirlenirken, profil I’e sahip izolatlarda nmaA, profil III’e sahip izolatlarda ise nmaA ve tbpB genlerinin bulunmadığı tespit edildi. Bununla birlikte biyokimyasal profil II’nin hastalık olguları ile ilişkili ve bunun arginin negatiflik ile ilişkili olduğu belirlendi. Ayrıca virülens gen profil I özelliğine sahip izolatların sadece biyokimyasal profil I ile ilişkili olduğu ve bunun arginin negatiflikten kaynaklandığı belirlenirken, arginin pozitif izolatlar ile virülens gen profil III arasındaki ilişkinin önemli olduğu gözlendi. Sonuç olarak; arginin negatiflik ile gcp, gs60, tbpB, lktC, adh pozitif, nmaA negatif izolatların kommensal ve patojen Mannheimia haemolytica izolatlarının ayrımında kullanılabilecek epidemiyolojik kriter olabileceği ve konu ile ilgili yeni çalışmaların yapılması gerektiği düşünülmektedir.
Typing and Investigation of Some Virulence Genes With Antimicrobial Susceptibility of Mannheimia Haemolytica Strains Isolated From Respiratory Tracts
(2020) Öztürk, Cihat; Ekin, İsmail Hakkı
Bu çalışmada, hasta ve sağlıklı sığır ve koyunların solunum yollarından izole edilen Mannheimia (M.) haemolytica izolatlarının biyokimyasal özellikleri, önemli virülens genlerinin dağılımı, antimikrobiyal maddelere duyarlılıkları ve direnç genlerinin tespit edilmesi amaçlandı. Nazo-farengiyal ve trake-bronşiyal sıvap örneklerinden kültürü yapılan M. haemolytica şüpheli 55 izolatın 48 (%87.3)'i Real Time PCR ile M. haemolytica olarak identifiye edildi. İncelenen izolatlarda, hastalık ve virülens genleri ile ilişkili biyokimyasal özelliklerin arginin-arginin ve sorbitol testlerindeki farklılıklara göre 4 farklı biyokimyasal profil belirlendi. Real Time-PCR yöntemiyle virülens genleri incelenen izolatlarda 3 virülens gen profili tespit edildi. İzolatların %37.5'i I, %33.3'ü III ve %12.5'i II olarak belirlendi. Virülens gen profil II'ye sahip izolatlarda virülens ile ilişkili genlerin tamamı belirlenirken, profil I'e sahip izolatlarda nmaA, profil III'e sahip izolatlarda ise nmaA ve tbpB genlerinin bulunmadığı tespit edildi. Bununla birlikte biyokimyasal profil II'nin hastalık olguları ile ilişkili ve bunun arginin-arginin negatiflik ile ilişkili olduğu belirlendi. Ayrıca virülens gen profil I özelliğine sahip izolatların sadece biyokimyasal profil I ile ilişkili olduğu ve bunun arginin-arginin negatiflikten kaynaklandığı belirlenirken, arginin-arginin pozitif izolatlar ile virülens gen profil III arasındaki ilişkinin önemli olduğu gözlendi. Ayrıca, epsilometer test (E-test) ile antimikrobiyal duyarlılıkları ve minimal inhibitör konsantrasyon (MİK) değerleri incelenen izolatların 9 (%18.75)'unda antimikrobiyal direnç belirlendi. E test ile dirençli bulunan izolatların 1'i sadece eritromisine, 2'si sadece penisiline, 1'i tilmikosin ve penisiline, 1'i tilmikosin, streptomisin ve penisiline, 1'i eritromisin, tilmikosin, streptomisin ve tetrasikline, 3'ü eritromisin, tilmikosin, streptomisin, tetrasiklin, penisilin ve ampisiline dirençli olduğu tespit edildi. Dirençli bulunan izolatların büyük çoğunluğunda (%66.6) çoklu direnç olduğu gözlendi. E test ile dirençli olduğu belirlenen 9 izolatın 6 (%66.6)'sında makrolid erm42, mphE, msrE genleri ve bu izolatların da 5 (%55.5)'inde aminoglikozid direnç geni strA tespit edildi. Sonuç olarak; arginin-arginin negatiflik ile gcp, gs60, tbpB, lktC, adh pozitif, nmaA negatif izolatların kommensal ve patojen M. haemolytica izolatlarının ayrımında kullanılabilecek epidemiyolojik kriter olabileceği ve konu ile ilgili yeni çalışmaların yapılması gerektiği, ayrıca M. haemolytica izolatlarında erm42, mphE, msrE genlerinin makrolid, strA geninin de aminoglikozid direncinden sorumlu genler olduğu ve total DNA'da tespit edilebildiği, tetH ve blaROB-1 genlerinin total DNA'da tespit edilemediği ve bu genlerin plazmid ve transpozon gibi ekstrakromozamal DNA'da belirlenebileceği, bundan dolayı antimikrobiyal direnç geni ile ilgili başka mekanizmaların araştırılmasına yönelik yeni çalışmaların yapılması gerekliliği sonucuna varıldı.