Browsing by Author "Akbaba, Mustafa"

Now showing 1 - 2 of 2

Domateste Botrytis Cinerea'nın Kontrolünde Antagonistler: Olası İnhibitörlerin Moleküler Bağlanma Üzerine İn Vitro Değerlendirme ve İn Silico Tarama
(2025) Kesimci, Tuba Genc; Akbaba, Mustafa; Demirel, Serap
Bu çalışma, Botrytis cinerea patojenine karşı Clonostachys rosea, Trichoderma harzianum ve Bacillus mojavensis aday antagonistlerinin antifungal etkilerini ve aday antagonistlerinin karşılıklı etkileşimlerini, moleküler bağlanma analiziyle de in vitro ve in silico etkileşimlerini incelemek amacıyla yürütülmüştür. Çalışmada aday antagonist uygulamalarının B. cinerea M2-1 izolatının misel gelişimi üzerine etkilerine bakıldığında % 56 oranı ile en etkili izolatın T. harzianum C7-3 olduğu, bu izolatı %32 oranı ile B. mojavensis K193 ve %26 oranı ile C. rosea C6-4 izolatlarının takip ettiği belirlenmiştir. Aday antagonist izolatlarının karşılıklı etkileşimleri değerlendirildiğinde T. harzianum’un C. rosea’nın misel gelişimini kontrole oranla azalttığı belirlenmiştir. T. harzianum × B. mojavensis eşleştirilmesinde fungal antagonistin misel gelişimi bakteriyel izolat ile karşılaştıkları hatta bakteriyel izolat tarafından engellenmiştir. C. rosea × B. mojavensis eşleştirmesinde C. rosea’nın yavaş gelişimi değerlendirilen süre sonunda bakteriyel izolat ile karşılaşmamasına neden olmuştur. Çalışmada ayrıca patojen ve aday antagonistlerin domates tohumlarının (cv. Süper) kök ve sürgün uzunluğu ölçülmüş ve çimlenme yüzdeleri hesaplanmıştır. C. rosea (3,09 cm) ve B. mojavensis (3,57 cm) izolatları tohumların sürgün gelişimlerini, B. mojavensis K193 izolatı (4,02 cm) tohumların kök gelişimini, T. harzianum C7-3 izolatı ise tohumların çimlenme yüzdesini (%86,7) kontrole oranla artırmıştır. Moleküler bağlanma bulguları, T. harzianum'dan elde edilen ligandların kombinasyonunun, patojenite ve virülanslıkla ilişkili proteinleri inhibe veya modifiye ederek B. cinerea'ya karşı antifungal etkinliği sinerjik bir şekilde artırabileceğini göstermiştir. In silico çalışma sonuçları, T. harzianum kaynaklı metabolitlerin B. cinerea proteinleri üzerindeki etkilerini ve etkileşimlerini doğrulamak için daha fazla laboratuvar araştırmasına ihtiyaç olduğunu göstermiştir.
The Long-Term Colonization Dynamics of Endophytic Bacteria in Cucumber Plants, and Their Effects on Yield, Fruit Quality and Angular Leaf Spot Disease
(Elsevier, 2021) Akkopru, Ahmet; Akat, Sahika; Ozaktan, Hatice; Gul, Ayse; Akbaba, Mustafa
Endophytic bacteria (EB) are ubiquitous in most plant species and they colonize plant tissues actively and systemically. Their colonization and persistence in the plant may be crucial to plant growth, yield and suppressing diseases. In this study, the long-term population dynamics of the two EB, namely Ochrobactrum spp. strain CB36/1 and Pantoea agglomerans strain CC37/2 in cucumber plants (Cucumis sativus L. cv. Gordion F1), were monitored. Also, the potential effects of these EB on plant growth, fruit quality, and yield, as well as the influences on Angular leaf spot disease of cucumber (ALS) and the yield under the disease pressure, were investigated. Plants were grown using the soilless cultivation technique in the greenhouse. Inoculation of the EB took place twice, and their population in plant tissues were monitored periodically for 62 days. Both EB isolates survived in plant organs until the end of the growing season, but over time, population densities dropped from 10(5) to 10(3) CFU g. plant 1 with the age of the plant. The EB applications had significant effects on fruit length, color and firmness. Total yield increased by 22% with CB36/1 and 21% with CC37/2 without disease pressure. Only CC37 / 2 significantly reduced the severity of ALS disease by 41% and increased yield by 22% compared to pathogen treatment alone. In this study, it was observed that the EB strain CC37/2 might contribute to reducing the chemical input and prevent the yield losses in soilless growing systems within the integrated agricultural concept.