Browsing by Author "Dostbil, Nursel"

Now showing 1 - 12 of 12

Accumulation of Heavy Metals on Bacillus Cereus and Pseudomonas Aeruginosa Strains Isolates From the Van Regional Soils in Turkey
(Asian Journal of Chemistry, 2007) Dostbil, Nursel
This investigation was conducted in order to determine the overall intracellular accumulation of Co2+, Cd2+ and Pb2+ on Bacillus cereus and Pseudonzonas aeruginosa which isolated from the soil samples collected from Van region. According to the results of the investigation, intracellular accumulation was observed to increase in wild type strains of B. cereus T 124 and P aeruginosa N 48 through the applications of Co2+, Cd2+ and Pb2+ (0.25, 0.5, 1, 2 and 4 mM). However, both the type of bacteria and the effect of various heavy metals caused different accumulation in two bacteria. In the three of the heavy metals put into application, B. cereus T 124 was found to have much more accumulation than P. aeruginosa N 48. The intracellular accumulation of Cd and Co metal was observed to be greater in B. cereus T 124 strain whereas the intracellular accumulation Pb2+ metal was seen to be much greater in P aeruginosa strain. The highest amount of accumulation was observed for Pb2+.
Antibacterial Activity of Some Species of Umbelliferae
(Asian Journal of Chemistry, 2007) Akkoyun, H. Turan; Dostbil, Nursel
In this work, the antimicrobial activities of some species of Umbelliferae (Anethum graveolens L., Petroselinum crispum, Coriandrum sativum L.) have been studied. For this purpose herb extracts which were prepared in diethyl-ether were tested to bacteria strains, P. aeruginosa ATCC 25853, E. coli ATCC 11239, K. pneumoniae FML 5, M. luteus ATCC 9345, E. faecalis ATCC 29212, B. megaterium DSM 32 and S. aureus ATCC 25923 with disk diffusion method as in vitro. It is determined that herbs which were investigated show different levels of inhibitory activity to test strains, dill affects all of the bacteria, parsley and coriander have minimum antimicrobial activity.
The Antibacterial Efficiency of Some Herbs Used in Herby Cheese
(2005) Alemdar, Süleyman; Dostbil, Nursel; Ağaoğlu, Sema
Bu çalışmada, otlu peynire katılan otlardan sirmo, mendo, heliz, sov ve siyabu’nun bazı patojen bakteriler üzerindeki inhibitör etkinliği araştırıldı. Örneklerin dietil eter ekstraktları Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa, Enterococcus faecalis ve Staphylococcus aureus üzerinde disk difüzyon yöntemi ile in vitro olarak denendi. Sonuç olarak; sirmo’nun test suşlarının tümü üzerinde değişik düzeylerde olmak üzere inhibitör bir etkiye sahip olduğu tespit edildi. Mendo K. pneumoniae, P. aeruginosa ve S. aureus üzerinde etkili olurken, heliz’in P. aeruginosa, E. faecalis ve S. aureus üzerinde inhibitör etki gösterdiği belirlendi. En zayıf inhibitör aktivite sov ve siyabu’da gözlendi.
Antimicrobial Activity of Black Mustard Seed (Brassica Nigra L.)
(Asian Journal of Chemistry, 2007) Akkoyun, H. Turan; Dostbil, Nursel; Kiran, Oezlem
This study was made to determine the antimicrobial activity of mustard (Brassica nigra L.). For this purpose extract of mustard which was prepared in diethyl ether tested on test strains of P. aeruginosa ATCC 25853, E. coli ATCC 11239, K. pneumoniae FML 5, M. luteus ATCC 9345, E. faecalis ATCC 29212, B. megaterium DSM 32 And S. aureus ATCC 25923 with disk diffusion method as in vitro. The present investigation shows the different levels of inhibitory activity to test strains while the mustard has inhibitory activity on the all test strains.
Antimicrobial Activity of Some Spices Used in the Meat Industry
(Natl veterinary Research inst, 2007) Agaoglu, Sema; Dostbil, Nursel; Alemdar, Sueleyman
The antimicrobial activity of some food additives used in meat products such as cumin, cinnamon, cloves, crushed red pepper, fennel, and anise against some microorganisms was investigated. For this purpose, the diethyl ether-treated extracts of spice samples were tested in vitro with Staphylococcus aureus ATCC 25923, Klebsiella pneumoniae FML 5, Pseudomonas aeruginosa ATCC 27853, Escherichia coli ATCC 25922, Enterococcus faecalis ATCC 15753, Mycobacterium smegmatis CCM 2067, Micrococcus luteus A 2971, and Candida albicans ATCC 60192 as test strains. The disc diffusion method was applied in the trial. Cinnamon was found to be the most effective spice against tested microorganisms. The weakest antimicrobial activity was displayed by fennel. Crushed red pepper and anise were found to be ineffective against the test strains.
Antimicrobial Effect of Seed Extract of Cardamom (Elettaria Cardamomum Maton)
(2005) Dostbil, Nursel; Alemdar, Süleyman; Ağaoğlu, Sema
Bu çalışmada, kakule tohumunun (Elettaria cardamomum Maton) bazı mikroorganizmalar üzerindeki inhibitör etkinliği araştırıldı. Bu amaçla kakule tohumunun dietil eterde hazırlanmış ekstraktı P. aeruginosa, M. smegmatis, K. pneumoniae, S. aureus, E. coli, E. faecalis, S. typhimurium, M. luteus ve C. albicans üzerinde disk difüzyon metodu kullanılarak in vitro olarak denendi. Sonuç olarak; kakule tohumundan elde edilen ekstrenin test suşlarından M. smegmatis, K. pneumoniae, S. aureus, E. coli, E. faecalis, M. luteus ve C. albicans üzerinde farklı düzeylerde inhibitör aktivite gösterdiği, ancak P. aeruginosa üzerinde benzer etkinin oluşmadığı tespit edildi. Kakuleye karşı en hassas suşun S. aureus olduğu belirlenirken, en zayıf inhibitör etki E. coli’de gözlendi.
An Investigation of Antimicrobial Activity of Celery (Apium Graveolensis L.)
(Asian Journal of Chemistry, 2007) Dostbil, Nursel
In this study, the antimicrobial activity of celery (Apium graveolensis L.) has been reported. The extract of celery were prepared in diethyl ether and tested against P. aeruginosa ATCC 27853, E coli ATCC 25922, K. pneumonia FML 5, S. aureus ATCC 25923, M. smegmatis CCM 2067, M. lutcus A 2971 ve C. albicans ATCC 60192 with the disc diffusion method. Celery had inhibitory activity on K. pneumoniae FML 5, M. sinegmatis CCM 2067, M luteus A 297 1, S. aureus ATCC 25923 and C albicans ATCC 60192 but has no inhibitory activity against other bacteria strains.
Research of Gelatinase Enzyme Activities and Characterization in Halotolerant Bacterium Isolated From Salinated Skins of Sheeps
(2011) Seçkin, Hamdullah; Dostbil, Nursel
Bu çalışmada tuzlanarak muhafaza edilmiş koyun derilerinden halofilik bakteri izolasyonu yapıldı. İzolatlarda jelatinaz enzim prodüksiyonu belirlendi. Buna bağlı olarak enzimin optimal sıcaklık stabilitesi, optimum tuz konsantrasyonu ve plasmid kodlu dirençlilik konumu araştırıldı. Deri örneklerinden izole edilen halofilik bakterilerin çoğaltılmasında, periyodik olarak gittikçe artan oranlarda (%5, %10, %15, %20, %25 ve %30) tuz konsantrasyonu içeren besi ortamları kullanıldı.Çalışmada Bergey's Manuel of Determinative Bacteriology'e göre izolasyonu yapılan 280 bakteri suşu üzerinde çalışıldı. Jelatinaz enzim aktivitesi denemelerinde pozitif sonuç veren suşların Streptococcus spp. ve Staphyllococcus spp. olduğu tespit edildi ve izolatların optimal olarak %10 tuz konsantrasyonu içeren besi ortamında 30 oC'de 3 gün inkübasyon koşullarında en iyi çoğalma yeteneğine sahip olduğu, tuz konsantrasyonunun arttırılması durumunda bakteri çoğalmasının yavaşladığı gözlendi. Jelatinaz enzim aktivitesinin tanımlanmasında ise % 1, % 1.5, %2 ve % 3 oranlarında jelatin içeren besi ortamı kullanılarak optimal enzim aktivitesinin %1.5 jelatin içeren besi ortamlarında olduğu tespit edilmiştir. Koyun derilerinden izole edilen halofilik bakterilerin ancak % 2.8'inde pozitif jelatinaz aktivitesi tespit edildi. Plasmid kodlu jelatinaz enzim aktivitesi gösteren halofil suşa rastlanmamıştır.Anahtar Kelimeler: Koyun derisi, Halofilik bakteri, Jelatinaz enzimi, Plasmid, Antibiyogram testi
Research of Possibility the Transformation and the Sensitive of Antibiotic at Some Gram Negative Microorganisms in Belonging of Enterobacteriaceae Groups Isolated From Seawer Waters
(2009) Acar, Zeki; Dostbil, Nursel
Bu çalışmada Kampüs alanındaki kanalizasyon sularından izole edilenEnterobacteriaceae üyelerine ait bazı Gram negatif bakterilerden Escherichia coli,Pseudomonas aeruginosa, Klebsiella spp. ve Enterobacter spp. suşlarına disk diffüzyonmetoduyla antibiyogram testi yapıldı. İmipenem, amphicillin, sulbactam amphicillin,ceftazidime, chloramphenicol, nitrofurantoin, streptomycin, tetracycline ve metronidazoleantibiyotikleri denendi.Çalışmada Bergey's Manuel of Determinative Bacteriology'e göre izolasyonu yapılantoplam 235 bakteri üzerinde çalışıldı. Pseudomonas aeruginosa, Klebsiella spp. veEnterobacter spp. suşlarının tümünde denenen antibiyotiklerden imipeneme karşı yüksekseviyede duyarlılık gözlendi. Ayrıca en yüksek antibiyotik dirençliliği Escherichia coli'deamphicillin, Pseudomonas aeruginosa, Klebsiella spp. ve Enterobacter spp. suşlarında isemetronidazol olduğu test edildi. Transformasyon testlerinde verici olarak Escherichia coliZPC21 suşu, alıcı olarak ise Escherichia coli ZPC37 suşu kullanıldı. Transformasyondenemesi sonucunda 105 transformant elde edildi.Anahtar kelimeler: Antibiyogram testi, Disk difüzyon metotudu, Escherichia coli,Enterobacter spp., Klebsiella spp., Pseudomonas spp., Elektroporasyon.
The Accumulation and Resistance of Heavy Metal Originated Plasmide at the Alkalifilic Aeromonas Spp. Strains Isolated From Natural Environment
(2014) Temel, Sema; Dostbil, Nursel
Bu çalışmada, doğal ortamlardan izole edilen Vibrionaceae üyelerinden Aeromonas spp. suşlarına bazı ağır metal bileşiklerinin inhibitör etkisi, plasmid kodlu dirençlilik fenomeni ve akümülasyonu araştırıldı. Test suşlarına ağır metal bileşikleri (kadmiyum, kobalt, kurşun ve çinko) 0.5- 4 mM konsantrasyonlarda denendi. Aeromonas spp. suşlarının 0.5 mM denenen ağır metal bileşiklerini içeren besi yerlerinde çoğaldığı gözlenirken 1, 2, 3 ve 4 mM konsantrasyonlarda ise konsantrasyon artışına paralel olarak çoğalma eğiliminin azaldığı belirlendi. İzolatlar arasında 1 mM kobalt, çinko ve kurşun içeren besi yerinde bakteri çoğalmasının yoğun olduğu gözlenirken kadmiyum içeren besiyerinde ise çoğalmanın zayıfladığı gözlendi. 2 mM kobalt ve kurşun içeren besiyerlerinde bakteri çoğalmasının yoğun olduğu kadmiyum ve çinko içeren besiyerlerinde ise zayıf olduğu gözlendi. 3 mM kobalt, çinko ve kurşun içeren besiyerlerinde bakteri çoğalmasında azalma gözlenirken kadmium metalini içeren besiyerinde herhangi bir çoğalma gözlenmedi. 4 mM konsantrasyonda çinko ve kurşun içeren besiyerinde oldukça zayıf bakteri çoğalmasının olduğu gözlenirken kadmiyum ve kobalt metalini içeren besiyerinde herhangi bir çoğalma gözlenmedi. Çalışmada Aeromonas spp. suşlarının denenen metal bileşiklerinin konsantrasyonu arttıkça % de hassasiyet durumlarının da arttığı gözlendi. Ancak denenen metal bileşiklerine karşı dirençlilik fenomeninin hem kromozomal DNA hemde plazmid kodlu olduğu belirlendi ve bakteri akümülasyonu ölçüldü. Anahtar kelimeler: Aeromonas spp., Plasmid, Ağır metal
The Transformation of Alkalophilic Xylanase Gene From Bacillus Sp. Origins To Gr(+) Bacteria by Using the Protoplast Transformation Method and Searching Its Expression Level
(2002) Kaval, Elif; Dostbil, Nursel
ÖZET PROTOPLAST TRANSFORMASYON METODU KULLANILARAK ALKALİFİLİK Bacillus sp. KÖKENLİ KSİLANAZ GENİNİN Gr (+) BAKTERİLERE TRANSFERİ ve EKSPRESYON DÜZEYİNİN ARAŞTIRILMASI KAVAL, Elif Yüksek Lisans Tezi, Biyoloji Anabilim Dalı Tez Danışmanı: Yrd. Doç. Dr. Nursel DOSTBİL Temmuz 2002, 52 Sayfa Bu çalışmada Van gölü çevresindeki suyu çekilmiş alanlardan alınan topraklardan alkalifilik Bacillus sp. izolasyonu yapılmıştır. Bu suşlar pH 9-11 aralıklarındaki besi ortamlarında üreme karakteri göstermiştir. Alkalifilik Bacillus sp. suşlarında plasmide bağlı ksilanaz üretme yeteneği gösteren geni araştırılmıştır. Denenen suşlarda ksilanaz üretme yeteneği pozitif olanlar acridine orange ile muamele edilerek plasmid eliminasyonu yapılmıştır. Bu aktiviteyi sağlayan plasmide bağlı gen Bacillus sp. X151 suşunda bulunmuştur. Bu sustan plasmid izolasyonu yapılarak bu plasmidlerin protoplast transformasyon tekniği kullanılarak Bacillus cereus P109 suşuna gen aktarımı yapılmış ve ekspresyon düzeyi araştırılmıştır. Anahtar Kelimeler: Alkalifilik Bacillus sp., Ksilanaz, Protoplast Transformasyonu, Ekspresyon
Türkiye' de Kan Grubu Araştırmaları
(2003) Akın, Galip; Dostbil, Nursel
Türkiye'de ilk kan grubu oranlarıyla ilgili araştırma 1918 yılında yapılmış ve 1958 yılına kadar bir çok araştırıcı da çalışmıştır. Yapılan çalışmalardaki denek sayısının azlığı ve genellikle de verilerin yorumlanmasında istatistiki yöntemlerin kullanılmayışı veya uygun kullanılmayışı nedeniyle, Türkiye genelini kapsayacak nitelikte görülmemiştir. Van İli Sağlık Müdürlüğü'nün, Van il merkezinde yaptığı genel sağlık taraması esnasında isteyen kişilerin kan gruplarını da tespit etmiştir. Araştırmamızın materyalini sağlık taraması sırasında tespit edilen bu kan grupları oluşturmaktadır. Araştırmada 6982 kişinin ABO ve Rh kan gruplarının fenotip oranlan ve gen frekansları saptanmıştır. Buna göre % 39.99 oranında A, % 17.09 oranında B, % 14.66 oranında AB ve % 28.26 oranında O kan grubu tespit edilmiştir. A geninin frekansı 0.2945, B geninin frekansı 0.1738 ve Ö geninin frekansı 0.5315 olarak hesaplanmıştır. Ayrıca % 89.49 oranında Rh (+), % 10.51 oranında Rh (-) kan grupları saptanmıştır. Araştırmamızda Türkiye genelini kapsayacak nitelikte görülen 8 araştırma ve bölgesel nitelikte Diyarbakır (Albayrak, 1989), Trakya (Akbay ve ark., 1989) ile Adana, Kayseri, Trabzon illerinde (3 il birlikte) yapılmış 4 araştırma ele alınarak incelenmiştir. Bu araştırmaların incelenmesiyle elde edilen veriler, Van'da yaptığımız araştırma verileriyle karşılaştırılmıştır. Buna göre A kan grubu ve A geni frekansı ülkemizin batısından doğusuna doğru gidildikçe, yavaş bir şekilde azalma göstermektedir. B kan grubu ve B geni frekansı ise ülkemizin batısından doğusuna doğru gidildikçe fazlalaşmaktadır. O kan grubu ve O geni frekansı da ülkemizin batısından doğusuna doğru gidildikçe yavaş yavaş azalmaktadır.