YYÜ GCRIS Basic veritabanının içerik oluşturulması ve kurulumu Research Ecosystems (https://www.researchecosystems.com) tarafından devam etmektedir. Bu süreçte gördüğünüz verilerde eksikler olabilir.

Browsing by Author "Duran, Seren"

Filter results by typing the first few letters
Now showing 1 - 2 of 2
  • Thumbnail Image
    Article
    Association of Insulin-Like Growth Factor Binding Protein-7 Promoter Methylation With Esophageal Cancer in Peripheral Blood
    (Springer, 2022) Kaya, Zehra; Almal, Necat; Sahin, Elif Sena; Duran, Seren; Gorgisen, Gokhan; Ates, Can
    Background The insulin-like growth factor (IGF) signaling pathway has an important role in many cancers, including esophageal cancer (EC). IGF-binding protein 7 (IGFBP7) is one of the proteins in this signaling pathway, and its role in cancer has not yet been fully clarified. In the present study, we evaluated the clinical relevance of IGFBP7 methylation status and mRNA expression in EC patients compared to healthy controls. We also investigated whether IGFBP7 methylation status affects mRNA expression. Methods The study comprised 100 EC patients and 105 healthy controls. Methylation specific PCR (MSP) was used to examine IGFBP7's promoter methylation and real-time quantitative reverse transcription PCR (qRT-PCR) was used to assess IGFBP7 mRNA expression. Results The IGFBP7 promoter methylation was significantly higher in controls than in EC patients (p < 0.05). IGFBP7 mRNA expression was significantly lower in EC patients compared to controls, especially in those over 55 years old (p < 0.0001). The globulin level and reflux were significantly higher in IGFBP7-unmethylated patients compared to IGFBP7 methylated patients (p = 0.01). In EC patients, however, there was no significant relationship between IGFBP7 mRNA expression and methylation in the peripheral blood (p = 0.33). In addition, neither IGFBP7 mRNA expression nor methylation were shown to be linked with survival (p > 0.05). Conclusion Our study indicated that promoter unmethylation and mRNA expression of the IGFBP7 promoter in peripheral blood could be different biomarkers for EC. Furthermore, unmethylation of the IGFBP7 promoter in EC patients was associated with reflux and elevated globulin levels. More studies with a larger number of cases is needed to confirm this association.
  • Thumbnail Image
    Master Thesis
    The Relationship Between Idiopathic Pulmonary Fibrosis (ipf) and Platelet-Derived Growth Factor Receptor Β (pdgfr-Β) Polymorphisms
    (2021) Duran, Seren; Kaya, Zehra
    İdiyopatik pulmoner fibrozis (İPF) nedeni bilinmeyen kötü prognoz ile karakterize olan kronik ve ilerleyici bir interstisyel akciğer hastalığıdır. İPF değişik klinik fenotiplerde ortaya çıkan heterojen bir hastalık olup, çeşitli risk faktörleri ve komorbiditelerden etkilenmektedir. İPF'in 5 yıllık sağkalım oranı %20'dir ve erkeklerde daha fazla görülmektedir. Ülkemizde İPF görülme sıklığı az olup, bu oran 5/100.000 olarak bildirilmiştir. Platelet kökenli büyüme faktörleri (PDGF) kan damarı oluşumunda rol oynayan büyüme faktörleridir. PDGF'ler akciğer fibroblastlarının büyümesini ve göçünü uyararak pulmoner fibroziste önemli rol oynar. PDGF reseptörü-β (PDGFR-β) tümör mikroçevresinde artan bir reseptör tirozin kinazdır. PDGFR'lerinin inhibe edilmesinin İPF ilerlemesini yavaşlatabileceği bildirilmiştir. Bununla birlikte İPF ve PDGFR-β polimorfizmleri arasındaki ilişkiyi gösteren bir çalışmaya rastlanılmamıştır. Çalışmamızın amacı, Türkiye'nin Doğu Anadolu Bölgesi popülasyonunda İPF hastalarında PDGFR-β polimorfizmlerinin (rs246395, rs3828610, rs138008832, rs2302273) allel ve genotip frekanslarını belirlemek ve bu polimorfizmlerin İPF hastalığı yatkınlığı ile ilişkisini tanımlamaktır. Bu çalışma 2020-2021 yılları arasında 11 İPF hastası ve 12 kontrol grubundan toplanan kan örnekleri üzerinde gerçekleştirilmiştir. Kan örneklerinden izole edilen DNA'dan Gerçek Zamanlı PZR (qPZR) kullanılarak Taqman yöntemi ile genotipleme yapılmıştır. Hasta ve kontrol grubu arasında PDGFR-β polimorfizmleri allel ve genotip frekansları (rs3828610 hariç) ve klinik/demografik özellikler istatistiksel olarak anlamlı değildi (p>0.05). rs3828610 için hasta ve kontroller arasında A alleli taşımayanlar (CC) A-alleli taşıyanlara göre anlamlı şekilde yüksekti (p=0.03). Sonuç olarak rs3828610 CC genotipi İPF için bir risk faktörü olabilir, ancak PDGFR-β polimorfizmlerinin hastalığa yatkınlığının belirlenebilmesi için daha fazla çalışmaya ihtiyaç vardır