YYÜ GCRIS Basic veritabanının içerik oluşturulması ve kurulumu Research Ecosystems (https://www.researchecosystems.com) tarafından devam etmektedir. Bu süreçte gördüğünüz verilerde eksikler olabilir.

Browsing by Author "Hassan, Nawzad Omer"

Filter results by typing the first few letters
Now showing 1 - 2 of 2
  • Thumbnail Image
    Article
    The Incidence of Barley Yellow Dwarf Viruses (Bydvs) in Wheat Crops in Diyarbakir (Turkey) and Sequence Characterization of Bydv-Pav
    (2018) Güller, Abdullah; Al-maaroof, Emad M.; Usta, Mustafa; Hassan, Nawzad Omer
    To ascertain the presence of Barley/Cereal yellow dwarf viruses (BYDV-PAV, MAV, SGV, RMV,and CYDV-RPV), a total of 365 wheat leaf samples were randomly collected from wheat cultivation fields ofDiyarbakir province in 2016 and were screened by using multiplex RT-PCR and RT-PCR methods. As a resultof PCR tests the wheat samples were found to be infected by BYDV-PAV, BYDV-SGV and CYDV-RPV withthe percentage of 3.5%, 2.4% and 1.3%, respectively. Detected mix infections of BYDV-PAV+BYDV-SGV,BYDV-PAV+CYDV-RPV, BYDV-SGV+CYDV-RPV, and BYDV-PAV+BYDV-SGV+CYDV-RPV were2.2%, 0.8%, 0.8%, and 0.8%, respectively. A BYDV-PAV Diyarbakir isolate was chosen randomly, and itscomplete coat protein gene was characterized. The coat protein gene of BYDV-PAV virus (Genbank accessionno. KX774424) was molecularly cloned and sequenced with the universal primers. The CP nucleotide sequenceof BYDV-PAV Diyarbakir isolate was showed 81.4 - 98.3% identities with the other 21 world isolates. Thepresent study is the first report for documentation of BYDV-PAV, BYDV-SGV and CYDV-RPV viruses inwheat fields of Diyarbakir province (Turkey).
  • Thumbnail Image
    Master Thesis
    Investigation and Molecular Characterization of Barley Yellow Dwarf Viruses in Wheat Fields (triticum Aestivum L.) of Diyarbakir Province by Multiplex Rt-Pcr
    (2018) Hassan, Nawzad Omer; Usta, Mustafa; Maaroof, Emad M. Al-
    Diyarbakır ili buğday alanlarında Arpa sarı cücelik virüslerini (Barley/Cereal yellow dwarf viruses: BYDV-PAV, MAV, SGV, RMV ve CYDV-RPV) belirlemek amacı ile 2016 yılında survey çalışmaları yürütülmüştür. BYDV (PAV, MAV, SGV, RMV) ve CYDV-RPV'nin varlığını araştırmak için multipleks RT-PCR ve RT-PCR yöntemleri kullanılmıştır. Diyarbakır ilinde varlığı tespit edilen virüslerde BYDVPAV'ın kılıf protein geninin moleküler karakterizasyonuda da gerçekleştirilmiştir. Bölgedeki buğday tarlalarından rastgele 365 adet buğday yaprak örneği toplanmıştır. Testlenen 365 buğday örneğinden 13' ünün BYDV-PAV (% 3.5), 9'unun BYDV-SGV (% 2.4), 5'inin CYDV-RPV (% 1.3) ile bulaşık oldukları tespit edilmiştir. Tespit edilen BYDV-PAV virüs türünden bir izolat rasgele seçilerek kılıf protein geni karakterize edilmiştir. BYDV-PAV (Gen bankası Ulaşım No. KX774424) virüsünün kılıf protein geninin tamamı klonlanarak üniversal primerler ile DNA dizilemesi gerçekleştirilmiştir. BYDV-PAV Diyarbakır izolatının dünyadaki 21 farklı izolatın nükleik asitleri ile % 81.43-98.2 % arasında değişen oranlarda benzerlik gösterdiği belirlenmiştir. Bu çalışma ile BYDV-PAV, BYDV-SGV, CYDV-RPV virüsleri Diyarbakır ilindeki buğday alanlarında ilk defa rapor edilmiştir