Browsing by Author "Körkoca, Hanifi"

Now showing 1 - 9 of 9

The Cataracterization of Protein Profiles of the Aeromonas Hydrophila and A.caviae Strains Isolated From Gull and Rainbow Trout Feces by Sds-Page
(2003) Boynukara, Banur; Körkoca, Hanifi
Bu çalışmada biri Aeromonas hydrophila ATCC 7512 olmak üzere toplam 10 hareketli aeromonas susu kullanıldı. Bu suşların beşi martılardan (bir A. hydrophila ve dört A. caviae susu), dördü alabalıklardan (üç A. hydrophila susu ve bir A. caviae susu) izole edildi. Bu suşlara ait tüm hücre protein profilleri SDS-PAGE yöntemi ile analiz edildi. Her bir susa ait protein profillerinin karşılaştırılması sonucu 45 çift oluşturuldu. Bu çiftlerin 17si (% 37,8) farklı, 18'i (% 40) şüpheli ilişkili, 10'u (% 22,2) identik bulundu. Aynı türe ait suşlar kendi içerisinde karşılaştırıldığında dört A. hydrophila susunun tamamı farklı veya şüpheli ilişkili bulunurken, beş A. caviae susunun biri dışında dördü identik bulundu. Martılardan izole edilen bir A. hydrophila susu, yine martılardan izole edilen dört A. caviae susu ile identik bulundu. Ülkemizde, A. hydrophila ve A. caviae suşlarının martı dışkılarından izolasyonunun ve SDS-PAGE yöntemiyle protein profillerinin ilk defa ortaya konulduğu bu araştırma, konuyla ilgili bundan sonra yapılacak çalışmalara katkıda bulunacaktır.
Comparison of Dna Profiles of Motile Aeromonas Strains Isolated From Human, Animal and Drinking Water
(2006) Körkoca, Hanifi; Berktaş, Mustafa
Hareketli Aeromonas' lar başlıca su ortamlarında olmak üzere doğada yaygın olarak bulunmakta, insan ve hayvanlarda enfeksiyonlara neden olmaktadırlar. Bu çalışmayla hareketli Aeromonas'ların bölgemiz içme sularından izolasyonunu gerçekleştirmek, insan, hayvan ve içme sularından izole edilen Aeromonas'ların PFGE profillerini ortaya koymak ve izolatlar arasında baskın bir klon olup olmadığını tespit etmek, ayrıca bölgemizden izole edilen bakteriler için fenotipik ve moleküler tipleme sonuçlarını karşılaştırmak amaçlanmıştır. Çalışmada 52 Aeromonas suşu çalışmanın materyalini oluşturmuştur. Çalışmada daha önce izole edilen 14 suşun dışında, 38 suş yeni bir çalışmasıyla izole edilmiştir. İdentifikasyon işlemleri BD phoenixTM (Becton, Dickinson and Company, Sparks, Maryland 21152 USA) cihazında gerçekleştirilmiştir. Toplam 52 adet suşun DNA paternleri Pulsed-field gel electrophoresis'le ortaya konulmuştur. Yedi suşa ait DNA profili elde edilememiştir. İnsanlardan izole edilen bir suşla sığırlardan izole edilen bir suş, iki balık suşu; martı suşu ile içme suyu suşu ve martı izolatı ile sığır izolatının klonal ilişkili olduğu tespit edilmiştir. Sonuç olarak; bu çalışmada insanlarda ve çevresel kaynaklarda baskın bir klon tespit edilememiştir. Ayrıca bu çalışmada bölgemizde içme suyu ile insan gastroenteriti arasında klonal ilişki tespit edilememiş, bununla birlikte daha önce hayvanlarda Aeromonas'ların varlığı insanlar için potansiyel bir risk olarak düşünülmesine rağmen çalışmamızda bu yönde genotiplendirme seviyesinde pozitif bir bulgu elde edilmiştir. Ayrıca bir martı izolatı ile içme suyu izolatı arasında klonal ilişkinin tespit edilmesiyle, kuş gribinin de görüldüğü bölgemizde, içme suyu kaynaklarının güvenliği açısından gerekli tedbirlerin alınması gereği, bununla birlikte Aeromonas'ların epidemiyolojisinin aydınlatılmasına ve özellikle çevresel izolatların biyokimyasal identifikasyonuna yönelik daha kapsamlı çalışmaların yapılması gereği ortaya konulmuştur. Anahtar Sözcükler: Aeromonas spp., insan, içme suyu, hayvan, PFGE.
Helicobacter Pylori Stool Antigen Feco-Prevalence in Food Workers in Van,turkey
(2015) Bayram, İrfan; Bayram, Yasemın; Körkoca, Hanifi; Berktaş, Mustafa; Dıcle, Yalçın
Amaç: Helicobacter pylori peptik ülser ve kanserin patogenezinde rol almakta, ayrıca ekstragastrik infeksiyonlara neden olabilmektedir. Bu bakteri infekte insanlar vasıtasıyla fekal-oral, oral-oral ve gastro-oral yolla bulaşabilmektedir. Bu çalışmayla, gıda sektöründe çalışan işçilerinin gaitalarında H.pylori antijenlerinin varlığını araştırmak amaçlanmıştır. Yöntemler: Gıda sektöründe çalışan kişilerin dışkılarında H.pylori dışkı antijeninin varlığı, dışkı antijen testi ile araştırıldı. Bulgular: Bu çalışmada yer alan 154 kişinin 74'ünde (%48.05) H.pylori dışkı antijeni tespit edildi. H.pylori dışkı antijeni varlığı ile iş kolları arasında istatistiksel bir fark tespit edilmedi.Sonuç: Gıda sektöründe çalışan işçilerde %48.05 oranında H.pylori dışkı antijeni tespit edilmiş olması, bu kişilerin H.pylori infeksiyonları açısından potansiyel önemini ve bu konuda daha detaylı çalışmaların yapılması gereğini ortaya koymaktadır
The Isolation of Motile Aeromonas Strains From the Feces of Chicken, Gull and Rainbow Trout (Oncorhyncus Mykiss), and the Determination of Their Protein Profiles by Sds-Page
(2001) Körkoca, Hanifi; Boynukara, Banur
Bu araştırmada, tavuk, martı dışkılarından ve alabalık barsak içeriklerinden hareketli aeromonaslar izole ve identifiye edilerek, bu suşlann protein profilleri SDS- PAGE yöntemiyle tespit edildi. Herbir susun protein profilinin diğer suşlarla olan benzerlik oranlan belirlenerek sonuçlar epidemiyolojik olarak değerlendirildi. Bu amaçla 50 adet tavuk, 50 adet martı dışkısı ve 50 adet alabalık barsak içeriğinden steril svaplarla alınan toplam 150 adet svap örneği Stuart taşıma ortamı içerisinde kısa sürede mikrobiyoloji laboratuvarma ulaştırıldı. Svap örneklerini hareketli aeromonaslar yönünden zenginleştirmek için Alkali Peptonlu Su (pH: 8.4) tüplerine ekim yapıldı.Daha sonra izolasyon amacıyla Aeromonas Medium'a ekim yapıldı, izole edilen bakterilerin biyokimyasal identifikasyonlan klasik yöntemlere göre yapıldı. Araştırma sonucunda tavuklara, martılara ve alabalıklara ait toplam 150 adet dışkı numunesinden 23 (%15.3) adet Aeromonas spp. izole edilerek, bunların 5 (21.7)'i A. caviae, 4 ( %17.4)'ü A. hydrophila ve 14 (%60.9)'ü A. sobria olarak identifiye edildi. İzole ve identifiye edilen hareketli aeromonas suşlarının protein profilleri SDS-PAGE yöntemiyle tespit edildi. Herbir susun protein profili diğer suşlann protein profilleri ile karşılaştırılarak benzerlik oranlan belirlendi. 23 adet susun karşılaştırılması sonucu oluşturulan 276 çiftin 241 (%87.3)'i farklı veya şüpheli ilişkili bulunurken, 35 (%12.7)'i identik bulundu. Aynı türe ait suşlar kendi içinde karşılaştırıldığında, A caviae 'nm 5 susu ile oluşturulan 10 çiftin 4 (%40)'ü şüpheli ilişkili, 6 (%60)'sı identik bulunurken, farklı çiftlere rastlanmadı. A. hydrophila' nın 4 susu ile oluşturulan 6 çiftin 1 (%16.6)'i farklı, 4 (%66.6)'ü şüpheli ilişkili bulunurken, 1 (%16.6)'i identik bulundu. A. sobria'mn 14 susu ile oluşturulan 91 çiftin 16 (%17.6)'sı farklı, 53 (%58.2)'ü şüpheli ilişkili bulunurken, 22 (%24.2)'si identik bulundu. Aynı hayvan türünden izole edilen, aynı türe ait hareketli Aeromonas suşlan karşılaştırıldı. Martılardan izole edilen A. caviae suşlan ile oluşturulan 5 çiftin tamamı (%100) identik bulundu. Alabalıklardan izole edilen A. hydrophila suşlan ile oluşturulan 3 çiftin 2 (%66.7)'si şüpheli ilişkili, 1 (%33.3)'i identik bulunurken, farklı çiftlere rastlanmadı. Tavuklardan izole edilen A. sobria suşlan ile oluşturulan 6 çiftin 5 (%83.3)'i şüpheli ilişkili, 1 (%16.7)'i identik bulunurken, farklı çiftlere rastlanmadı. Martılardan izole edilen A. sobria suşlan ile oluşturulan 6 çiftin tamamı (%100) identik bulundu. Alabalıklardan izole edilen A. sobria suşlan ile oluşturulan 15 çiftin 4 (%26.7)'ü şüpheli ilişkili, 11 (%73.3)'i identik bulunurken, farklı çiftlere rastlanmadı. İzole edilen her bir hareketli Aeromonas türüne ait suşlar, diğer türe ait suşlarla, izole edildikleri hayvan türleri dikkate alınmaksızın karşılaştırıldı. A. caviae suşlan ile, A. hydrophila suşlannın karşılaştırılması ile oluşturulan 20 çiftin 10 (%50)'u farklı, 5 (%25)'i şüpheli ilişkili bulunurken, 5 (%25)'i identik bulundu. A. caviae suşlan ile A. sobria suşlannın karşılaştırılması ile oluşturulan 70 çiftin 11 (%15.7)'i farklı, 59 (%84.2)ru şüpheli ilişkili bulunurken, identik çiftlere rastlanmadı. A. hydrophila suşlan ile A. sobria suşlannın karşılaştırılması ile oluşturulan 56 çiftin 26 (%46.2)'sı farklı, 30 (%53.6)'u şüpheli ilişkili bulunurken, identik çiftlere rastlanmadı. Farklı hayvan türlerinden izole edilen, aynı türe ait hareketli Aeromonas suşlan karşılaştınldı. Böyle bir karşılaştırma sonucu martılardan ve alabalıklardan izole edilen A. caviae suşlan ile oluşturulan 4 çiftin tamamı (%100) identik bulundu. Martıdan ve alabalıklardan izole 39edilen A. hydrophila suşları ile oluşturulan 3 çiftin 1 (%33.3)'i farklı, 2 (%66.7)'si şüpheli ilişkili bulunurken, identik çiftlere rastlanmadı. Tavuklardan ve martılardan izole edilen A. sobria suşları ile oluşturulan 16 çiftin tamamı (%100) şüpheli ilişkili bulundu. Tavuklardan ve alabalıklardan izole edilen A. sobria suşları ile oluşturulan 24 çiftin 16 (%66.6)'sı farklı, 8 (%33.3)'i şüpheli ilişkili bulunurken, identik çiftlere rastlanmadı. Martılardan ve alabalıklardan izole edilen A. sobria suşları ile oluşturulan 24 çiftin 20 (%83.3)'si şüpheli ilişkili, 4 (%16.7)'ü identik bulunurken, farklı çiftlere rastlanmadı Bu araştırmanın sonucunda, Türkiye'de martı dışkılarından hareketli aeromonaslann izolasyonu ile tavuk, martı ve gökkuşağı alabalıklarınım dışkılarından izole edilen hareketli aeromonaslann SDS-PAGE yöntemiyle protein profillerinin tespiti ilk kez gerçekleştirildi.
Van Bölgesinde Sifiliz Reaginik Antikor Seropozitifliğinin Araştırılması
(2005) Hamza, Bozkurt; Akdeniz, Necmettin; Körkoca, Hanifi; Aygül, Kumru; Berktaş, Mustafa; Çiftçi, İ. Hakkı; Guducuoglu, Huseyin
Sifilizin etkeni olan Treponema pallidum, organizmada infeksiyon yaptıktan sonra reajinik antikor olarak adlandırılan, nonspesifık antikorların oluşmasına sebep olmaktadır. Çalışmamızda T. pallidum'a karşı oluşan nonspesifik antikorların varlığını araştırmak ve dolayısıyla sifilizin Van ve yöresinde seroprevalansının tespiti amaçlanmıştır. Bu amaçla 226 (%49)'sı kadın, 234 (%51)'ü erkek olmak üzere toplam 460 kişiden, Van'daki son Genel Nüfus Sayımı'nda yerleşim yerlerinin nüfusa oranı dikkate alınarak Van merkezden. 185 (% 40), Bahçesaray'dan 9 (% 1.95), Başkale'den 30 (% 6.52), Çaldıran'dan 32 (%6.95), Çatak'tan 12 (%2.61), Edremit'ten 11 (%2.39), Erciş'ten 77 (% 16.73), Gevaş'tan 14 (% 3.04), Gürpınar'dan 19 (%4,.13), Muradiye'den 29 (%6.3), Özalp'tan 31 (%7), Saray'dan. 11 (%2.39) serum örneği toplanarak, toplanan serum örnekleri çalışma yapılıncaya kadar -20°C'de saklanmış, çalışmada RPR-nosticon® II, Biomerjeux- France kitleri kullanılmıştır. Bu çalışmanın sonucunda Van ve yöresinden T. pallidum'a karşı oluşan ve nönspesifik antikor plan reaginik antikor veya VDRL pozitifliği % 0 olarak saptanmıştır. Daha kapsamlı çalışmalar yapılması uygun olacağı kanaatine varılmıştır.
Van İli İçme Sularının Cryptosporidium Spp. Ookistleri Yönünden İncelenmesi
(2011) Akkaş, Önder; Çiçek, Mutalip; Körkoca, Hanifi
İçme suyu ile bulaşan ve insanlarda salgın hastalıklara sebep olan birçok mikroorganizma vardır. Bunlardan biri olan Cryptosporidium spp. kontamine sularla bulaşarak enterite neden olan bir protozoondur. İnsan ve hayvan dışkısıyla atılan bu parazitin ookistleri sanitasyonu kötü çevrelerde içme suyu kaynaklarının kontaminasyonuna yol açmaktadır. Ookistler çevre şartlarına ve bakterileri etkisiz hale getirecek konsantrasyondaki dezenfektanlara dirençlidir. Su ortamında uzun süre canlı kalabilmeleri ve dezenfeksiyona dayanıklı olmaları su arıtma işlemlerinde önemli sorunlar oluşturmaktadır. Bu çalışmada Cryptosporidium’un yöremiz içme sularındaki yaygınlığının belirlenmesi amaçlanmıştır. Yöntem: İçme suyu olarak kullanılan toplam 440 kaynaktan su örnekleri alınmış ve beşer litrelik temiz plastik bidonlara alınarak laboratuvara getirilmiştir. Su örnekleri 0,45 μm’lik selüloz asetat membran filtresi bulunan vakum pompalı filtrasyon cihazından süzülmüştür. Filtre üzerindeki partikülat aynı su örneğinin 20 ml’si içinde yıkanarak santrifüj edilmiş ve çökelti lam üzerine bırakılmıştır. Hazırlanan preparatlar filtrasyon cihazından süzüldükten sonra modifiye asit-fast yöntemiyle boyanarak incelenmiştir. Her bir örnek için üçer preparat hazırlanmıştır. Bulgular: Toplam 440 su örneğinin %1,13’ünde Cryptosporidium spp. ookistleri saptanmıştır. İçme suyu olarak kullanılan 191 yüzeysel kaynak suyunun %1,57’sinde, şehir merkezi ve ilçelerden temin edilen 241 şebeke içme suyunun %0,82’sinde ookistler görülmüştür. Su örneklerinin 193’ü kırsal alanlardan elde edilen içme suları olup bunların %1,55’inde, şehir ve ilçe merkezlerinde içme suyu olarak kullanılan 247 suyun ise %0,80’inde pozitiflik saptanmıştır. Sonuç: Cryptosporidium su ile bulaşan patojen protozoonlardan biridir. Bu yüzden su analizlerinin yapıldığı laboratuvarlarda Cyrptosporidium rutin analizler içine alınmalı ve bu laboratuvarlar bu parazitin teşhisine yönelik donanımlı hale getirilmelidir. Suyla bulaşan bu protozoonun bulaşma riskini azaltmak için klasik su arıtma yöntemleri ile birlikte ultraviyole, ozonloma ve monitoring sistem gibi modern su arıtma tekniklerinin kullanılmasının halk sağlığı tehditlerini ortadan kaldırabileceği kanaatindeyiz.
Van İlinde Kan Gruplarının Dağılımı
(2004) Hamza, Bozkurt; Guducuoglu, Huseyin; Çıftcı, Ihsan Hakkı; Önder, Erol; Kurtoğlu, M. Güzel; Körkoca, Hanifi
Çalışmada Van Devlet Hastanesi Kan Merkezi'ne 1997-2002 yılları arasında çeşitli nedenlerle kan grubu tayini amacıyla başvuran 18.308 kişinin kan gruplarının dağılımı araştırılmıştır. Çalışma sonucunda incelenmeye alınan 18.308 kişinin % 45.05 A, % 16.14 B, % 30.65 O ve % 8.16 AB kan gruplarından olduğu saptanmış, bölgemizde Rh pozitiflik oranı ise % 90.37 olarak tespit edilmiştir.
Van Yöresinde Gıda Sektörü Çalışanlarında Bağırsak Parazitlerinin Yaygınlığı
(2007) Cengiz, Taş Zeynep; Körkoca, Hanifi; Çiçek, Mutalip; Kurtoğlu, Muhammet Güzel
Van İl Sağlık Müdürlüğü Halk Sağlığı Laboratuvar’ına portör muayenesi yaptırmak için başvuran ve gıda sektöründe çalışan 739 kişiden parazitolojik muayene için gaita ve sellofan-bant preparatları alındı. Numuneleri incelenen 739 işçinin 131’inde (%17,71) parazit saptandı. Bunlardan 95’inde bir tür, 30’unda iki tür, 5’inde 3 tür ve 1’inde ise 4 tür parazit görüldü. Çalışmamızda saptanan parazitlerin %19,08’i helmint, %80,91’i ise protozoon olarak bulunmuştur. Bu araştırmada; Ascaris lumbricoides %1,21, Enterobius vermicularis %0,81, Hymenolepis nana %0,67, Trichuris trichiura %0,40, Taenia saginata %0,27, Blastocystis hominis %4,87, Entamoeba coli %3,24, Giardia intestinalis %2,84, Iodamoeba bütschlii %2,02, Endolimax nana %0,67, Entamoeba histolytica/Entamoeba dispar %0,27, Chilomastix mesnili %0,27, Entamoeba hartmanni %0,13 oranında saptanmıştır
Van Yöresinde Kanserli Hastalarda Toksoplazmoz Seroprevalansı
(2003) Bayram, Yasemın; Körkoca, Hanifi; Berktaş, Mustafa; Çıftcı, Ihsan Hakkı; Guducuoglu, Huseyin; Hamza, Bozkurt
Çalışmada Van yöresinde kanserli hastalarda toksoplasmoz seroprevalansının ortaya konulması amaçlanmıştır. Bu amaçla hastanemize başvuran 55 kanserli hastadan kan alınarak serumların 1/16-1/256 oranlarında dilttsyonları yapılmış ve indirekt hemaglutinasyon (IHA) yöntemi ile anti-toksoplasma antikorları araştırılmıştır. Çalışmada Toxocell IHA kiti (Biokit, sa, Spain) kullanılmıştır. Çalışma sonucunda 55 kanserli hastanın 41(%74.5)' inde çeşitli dilüsyonlarda antikor saptanmıştır.