Browsing by Author "Karataş, Boran"

Now showing 1 - 4 of 4

Determination of the Genetic Diversity of Rainbow Trout (oncorhynchus Mykiss) Populations Breeding in Different Provinces in Turkey by Sequence Analysis From the Mtdna Region
(2024) Beyaz, İsmet; Karataş, Boran
Bu çalışma, Türkiye'nin farklı illerinde ticari olarak faaliyet gösteren gökkuşağı alabalığı (Oncorhynchus mykiss) popülasyonlarının mitokondriyal DNA (mtDNA) sitokrom b (cyt-b) gen bölgesine dayalı genetik çeşitliliğini ve yapısını incelemektedir. Çalışma kapsamında toplam 14 ildeki 98 bireyden alınan örneklerde 754 baz çiftlik (bp) sitokrom b geni çoğaltılmış ve hizalama sonrası 726 bp'lik dizi analiz edilmiştir. Dört nükleotidin (sitozin, timin, adenin ve guanin) ortalama frekansları sırasıyla %26.2, %24.9, %26.2 ve %22.8 olarak bulunmuş; A + T içeriğinin (%51) G + C içeriğinden (%49) daha yüksek olduğu belirlenmiştir. 14 popülasyondan toplam 645 polimorfik lokus tespit edilmiş ve 50 farklı haplotip tanımlanmıştır. Haplotip çeşitliliği (Hd) 0.91 ile 0.48 arasında, nükleotid çeşitliliği (π) ise 0.26 ile 0.00 arasında değişmiştir. En yüksek genetik çeşitlilik Tokat ve Van popülasyonlarında, en düşük ise Elazığ ve Kahramanmaraş popülasyonlarında gözlenmiştir. AMOVA analizleri, genetik çeşitliliğin %71.1'inin popülasyonlar arasında, %28.9'unun ise popülasyonlar içinde olduğunu göstermiştir. İkili FST değerleri 0.38 ile 0.99 arasında değişmiş ve ortalama FST değeri 0.71 olarak bulunmuştur, bu da popülasyonlar arasındaki genetik farklılaşmanın yüksek olduğunu göstermektedir. Filogenetik analizler, popülasyonların iki ana gruba ayrıldığını ve bu grupların kendi içinde farklı alt gruplar oluşturduğunu göstermiştir. Özellikle Kahramanmaraş ve Elazığ popülasyonlarının diğer popülasyonlardan belirgin şekilde farklılaştığı gözlenmiştir. Sonuç olarak bu bulgular, Türkiye'deki gökkuşağı alabalığı popülasyonlarının genetik çeşitliliğinin ve yapısının belirlenmesi açısından önemli bilgiler sunmaktadır. Çalışma, bu popülasyonların korunması ve sürdürülebilir yönetimi için genetik çeşitliliğin korunmasının önemini vurgulamaktadır. Ayrıca gelecekteki genetik araştırmalar ve koruma stratejileri için önemli bilgiler sunmakta ve uzun vadeli izleme programlarının gerekliliğine işaret etmektedir.
Farklı Gökkuşağı Alabalığı (Oncorhynchus Mykiss) Kuluçkahanelerindeki Damızlık Populasyonlarının Bazı Fenotipik Özellikleri ve Farklı Damızlıklardan Örneklenen Yumurtaların Aynı Çevresel Şartlarda Kalite Kriterleri
(2021) Karataş, Boran; Arabacı, Muhammed
Bu çalışmada Van ilindeki altı adet gökkuşağı alabalığı kuluçkahanesinde bulunan anaç populasyonlarının yumurta ve yumurtlamayla ilgili bazı fenotipik özellikleri ile örneklenen yumurtaların aynı çevresel şartlarda kuluçkalanmasıyla yumurta ve larva kalite kriterlerinin belirlenmesi amaçlanmıştır. Bu amaçla kuluçkahanelerde bazı su kalite kriterleri, anaçlarla ilgili kuluçkahane yönetim parametreleri, anaçların yumurta ve yumurtlama ile ilgili fenotipik özellikleri ve farklı kuluçkahanelerden örneklenen yumurtaların aynı çevresel şartlarda (10.1±0.14 °C) kuluçkalanarak yumurta ve larva kalite kriterleri belirlenmiştir.Su kalite kriterlerinin literatürde verilen aralıklarla uyumlu olduğu ve anaç refahını olumsuz etkileyecek düzeyde olmadığı görülmüştür. Kuluçkahanelerdeki toplam anaç sayısı, yaşı, boyu ağırlığı ile toplam ve nispi fekonditeleri her bir kuluçkahane için farklı olup bakım ve beslemelerinde de farklılıklar görülmüştür. Anaçların yumurtlama aralığı ve yumurtlama profili de her bir kuluçkahane için farklı olup kuluçkahanelerden birinde Kasım başında yumurtlayan anaçlar gözlenmiştir. Aynı çevresel şartlar altında yapılan deneme düzeneğinde ise yumurtaların gözlenme oranı ve larva çıkış oranı istatistiksel olarak farklı ve önemli bulunmuştur(P<0.05).Sonuç olarak tüm parametreler incelendiğinde kuluçkahaneler arasında fenotipik farklılıklar olduğu görülmüştür. Bu durumun nedeni kuluçkahanelerdeki su kalitesi ve anaç yönetim parametrelerinin farklı olması olabilir. Ancak bu farklılıkların nedeni kuluçkahanelerin bünyelerinde farklı anaç hatları bulundurmaları ve anaçlar arasında olan genotipik farklılıklar da olabilir. Bu nedenle genotipik farklılıklarla ile ilgili detaylı çalışmalara ihtiyaç vardır. Yetiştiricilik açısından ise kuluçkahanelerden sadece birisinde bulunan ve erken yumurtlayan anaçlardan, erken yumurtlayan hat elde etmek mümkündür. Daha ekonomik bir yetiştiricilik için anaçlarda yumurta sayısını ve kalitesini arttırmaya yönelik besleme yöntemleri uygulanmalıdır. Ayrıca anaç populasyonlarında homozigotluğu düşürmek için dişi erkek anaç oranı kuluçkahanelerde eşitlenmeli ve erkek anaç ihtiyacı porsiyonluk balıklardan karşılanmamalıdır.
Gas Bubble Disease in Broodstocks and Larvae in a Rainbow Trout (Oncorhynchus Mykiss)
(2020) Arabacı, Muhammed; Karataş, Boran; Akkus, Mustafa
In this study, the cause of the deaths in broodstocks and larvae in rainbow trout hatchery in Van province were investigated. Necropsy was done in broodstocks and larvae. The causative agents and symptoms were evaluated. Dissolved O2, CO2 and NH3, NO2 and NO3 concentrations in water were determined in order to evaluate the environmental factors of the disease. In addition, water temperature, pH and total hardness were also determined from other quality water criterias. At skin and gill, eye edges, fins of broodstock were seen embolus. Around the yolk sac of the larvae were determined the gas bubbles. It was also observed that larvae could not consume the yolk sac, and larval posture was reverse at water surface. The dissolved O2 saturation at the inlet of the pools were measured as 165±2,51% and at the out of broodstock pool was 147±4,16%. The morbidity of the disease in the broodstocks were 25%, the mortality rate was 10%, and the morbidity and mortality rate was 5% in the larvae. According to the findings the disease is not an infectious disease but a non-contagious, environmental gas bubble disease. As a result, the supersaturation of dissolved oxygen in water caused the gas bubble disease in broodstocks and larvae. For the solution of gas bubble disease, it may be recommended to the use of saturation column at the water inlets or aeration of water at the inlets of pools.
A Research on the Evaluation and Management of Rainbow Trout (oncorhynchus Mykiss, Walbaum, 1792) in Van Province According To Growth Hormone (gh) Gene Expression Levels, Genetic Polymorphism and Some Phenotypic Parameters
(2019) Karataş, Boran; Arabacı, Muhammed
Bu çalışmada Van ilindeki gökkuşağı alabalığı kuluçkahanelerinde bulunan anaç populasyonlarının bazı fenotipik özellikleri, mitokondrial DNA'dan (mtDNA) genotipik polimorfizmleri ve büyüme hormonu (GH-I) gen ifade seviyeleri belirlenmiştir. Çalışmada kullanılan gökkuşağı alabalığı anaçları (Oncorhynchus mykiss) Van ilinde bulunan ve resmi olarak faaliyet gösteren 6 adet gökkuşağı alabalığı kuluçkahanesinden temin edilmiştir. Gökkuşağı alabalığı kuluçkahanelerinin genotipik özellikleri göz önüne alındığında gökkuşağı alabalığı kuluçkahanelerinde bulunan anaçların 7 adet farklı gökkuşağı alabalığı hattı oluşturduğu bulunmuştur. Ayrıca kuluçkahanelerin genotipik durumlarının 'çok iyi', 'iyi' ve 'orta' seviyede olduğu görülmüştür. Çalışmada kuluçkahanelerin FIS değeri (-0.34) ̶ (0.21) arasında FIT değerleri ise (-0.05) ̶ (0.38) arasında bulunmuştur. Ayrıca FST değeri 0.21 bulunmuştur. Gökkuşağı alabalığı kuluçkahanelerdeki büyüme hormonu nispi gen ifade seviyelerine göre en yüksek büyüme hormonu (GH-I) nispi gen ifade seviyesinin sırası ile OCK ve SFA kuluçkahanelerindeki anaçlarda olduğu bulunmuştur. Sonuç olarak bu çalışmada Van ilindeki gökkuşağı alabalığı kuluçkahanelerdeki anaçlardan elde edilen genotipik ve fenotipik verilerin ayrı ayrı ve birlikte değerlendirilmesi ile sağlıklı bir kuluçkahane ve anaç yönetimi için kıyaslanabilir, değerlendirilebilir yönetim parametreleri elde edilmiştir.