Browsing by Author "Koçak, Metin"

Now showing 1 - 2 of 2

Molecular Characterization of Different Almond Genotypes in Van Region With Ipbs-Retrotransposer Markers
(2023) Sarman, Berna; Koçak, Metin
Badem, Türkiye'nin birçok bölgesinde yetiştirilen hem ekonomik olarak, hem de besin değerinin yüksek olması sebebiyle önemli bir meyvedir. Türkiye'nin birçok yerinde olduğu gibi Van ilinde de yetiştirilmekte ve bölgeye ait yerel çeşitleri bulunmaktadır. Bölgelere uygun çeşitlerin geliştirilmesi son derece önemlidir ve uygun çeşitlerin geliştirilmesi için de gen kaynaklarının önemli özelliklerinden yararlanmak gerekmektedir. Gen kaynaklarının önemli özelliklerinden faydalanmak için genetik çeşitliliğin araştırılması çok önemlidir. Bu tez çalışmasında Van ilindeki yerel badem genotiplerinin moleküler markır teknikleri kullanılarak moleküler karakterizasyonu yapılacaktır. Yapılacak çalışmada moleküler markır yöntemlerinden biri olan iPBS-Retrotranspozan yöntemi kullanılacaktır. iPBS-Retrotranspozan yöntemi evrensel ve oldukça etkili bir yöntem olarak, bireyler arasındaki polimorfizmleri doğrudan tespit etmek, transkripsiyon profillerindeki polimorfizmleri tespit etmek ve hızlı bir biçimde genomik DNA'dan LTR'in kopyalanmasında, LTR retrotranspozonun veri taban araştırmalarında, PBS'in (primer bağlanma yeri) korunumlu dizilerini kullanır. iPBS-Retrotranspozan yöntemi ile yapılacak olan çalışma sonucunda elde edilen verilerle, badem genotiplerinin genetik çeşitliliği analiz edilecektir.
Synthetic Seed Production and Short-Term Storage Under in Vitro Conditions in Cyclamen Coum
(2022) Kuzğun, Cansu; Yıldız, Mehtap; Koçak, Metin
Bu tez çalışmasında C. coum bitkisinden elde edilen somatik embriyolardan sentetik tohum üretimi ve bu tohumların farklı sıcaklıklarda ve farklı sürelerde depolanma potansiyeli araştırılmıştır. Denemede eksplant olarak in vitro ortamda geliştirilmiş steril C. coum bitkilerine ait yaprak sapları kullanılmıştır. Aynı olgunluğa sahip somatik embriyoların elde edilmesi için embriyojenik kalluslar MS besi ortamına 2 mg/ L, 4 mg/ L prolin ve sadece MS olmak üzere 3 farklı ortam kullanılmıştır. Sentetik tohum denemelerinde, her bir olgunlaştırma ortamından embriyolar alınarak %3 sodyum aljinat ile 100 Mm kalsiyum klorid çözeltileri kullanılarak enkapsülasyon işlemleri gerçekleştirilmiştir. Elde edilen sentetik tohumlar 0, 30, 60 ve 90 gün karanlık ortamda 4℃, 24℃ ve -20℃'de depolanarak bitkiye dönüşüm, sekonder somatik embriyo verme ve kök oluşumu bakımından değerlendirilmiştir. Yapılan gözlemler sonucunda en yüksek bitkiye dönüşüm oranının %66.6 ile 1 aylık depolama süresinde 24℃ sıcaklıkta ve prolin içermeyen MS ortamında geliştirilen embriyolardan elde edilen tohumlarda olduğu belirlenmiştir. En fazla sekonder somatik embriyo oluşumu 1 aylık depolama süresinde 24℃ sıcaklıkta bekletilen ve yine prolin içermeyen ortamlardan elde edilmiş embriyoların kullanıldığı tohumlarda olduğu tespit edilmiştir. Kök gelişiminin ise en fazla olduğu oran %53.3 ile 24℃ sıcaklıkta 2 ay depoda muhafaza edilmiş 2 mg\ L prolin ortam içeriğinde olgunlaştırılmış embriyolardan elde edilen tohumlarda olduğu belirlenmiştir. Depolama sıcaklıklarından -20℃'nin C. coum'da başarısız olduğu gözlenmiştir.