Browsing by Author "Ocak, Mustafa"

Now showing 1 - 4 of 4

Prunus Yapraklarında Prunus Necrotic Ring Spot (Pnrsv) ve Apple Chlorotic Leaf Spot (Aclsv) Virüslerinin Dağılımı
(2005) Usta, Mustafa; Sipahioglu, Hikmet Murat; Ocak, Mustafa; Şavur, Orçun Burak; Polat, Bülent
Prunus necrotic ringspot virüs (PNRSV)'ü ile infekteli Prunus mahaleb ve Apple chlorotic leafspot virüs (ACLSV)'ü ile infekteli şeftali (P. persica L.) yapraklarının farklı bölgelerinden alınan doku diskleri bu virüslerin yaprak dokusundaki dağılımlarını belirlemek amacı ile sırasıyla enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) ve reverse transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR) teknikleri ile analiz edilmişlerdir. Gerçekleştirilen ELISA testleri sonucunda her iki virüsünde yaprak ayasında yaprak sapı bölgesinde daha konsantre oldukları ve konukçu yapraklarında düzensiz bir dağılım gösterdikleri tespit edilmiştir. Aynı yaprak bölgelerinin kullanıldığı RT-PCR testlerinde 'ise her iki virüsün genetik materyalinin tüm yaprak bölgeleri için birbirine yakın ölçülerde amplifikasyon ürünleri oluşturduğu belirlenmiş ve testlenen yaprak bölgeleri arasında viral konsantrasyon bakımından bariz farklılıkların olmadığı saptanmıştır. RT-PCR testi sonuçlarından elde edilen kesin, net ve dengeli teşhisi ifade eden bantlar, ACLSV ve PNRSV virüslerinin Prunus yapraklarının testlenen tüm bölgelerinde homojen bir dağılım sergilediğini göstermiştir. Her iki virüs, kullanılan test yöntemine göre konukçularında farklı dağılım sergilemişlerdir. Elde edilen bulgular ışığında PNRSV ile ACLSV'nin konukçularındaki dağılımını belirlemede ELISA testi ile PCR testi arasında bir korelasyon saptanmamıştır.
Use of Dried High-Phenolic Laden Host Leaves for Virus and Viroid Preservation and Detection by Pcr Methods
(Elsevier, 2006) Sipahioglu, Hikmet Murat; Usta, Mustafa; Ocak, Mustafa
The efficiency of RNA extraction for Apricot latent virus (ApLV), Plum bark necrosis stem pitting associated virus (PBNSPaV), Prunus necrotic ring spot virus (PNRSV), Potato virus Y (PVY), and Apple scar skin viroid (ASSVd) from infected hosts is of great importance for molecular diagnosis by the polymerase chain reaction (PCR). A method is described for drying tissue to overcome phenolic inhibitors of viral RNA. This study showed that the infected host leaves, dried at 65 degrees C for 2 days and conserved at 4 degrees C in air proof conditions, serve as good sources for detection of viral and viroid pathogens by PCR methods. Preliminary results suggest that ApLV, PNRSV, PVY, and ASSVd were detected easily by reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR) and PBNSPaV by nested-RT-PCR with high amplification yields. No significant difference was observed between ethidium bromide-stained band profiles of dried compared to fresh leaves of infected samples. The RNA derived from dry leaf samples was suitable for detection studies. This simple and inexpensive method has proved very effective for long term conservation of virus and viroid isolates. (c) 2006 Elsevier B.V. All rights reserved.
Van Gölü Havzası Ceviz (Junglas Regis L.) Yetiştiricilik Alanlarındaki Viral Hastalıkların Serolojik ve Moleküler Yöntemlerle Belirlenmesi
(2008) Ocak, Mustafa; Öztürk, M.ömer; Sipahioğlu, H. Murat
-
Virüsten Ari Sert Çekirdekli Meyve Fidanı Üretimi
(2007) Usta, Mustafa; Sipahioğlu, H. Murat; Ocak, Mustafa
-