Browsing by Author "Özok, Ömrüye"

Now showing 1 - 3 of 3

Isolation and Identification of Streptomyces Species Isolated From Forest Area (Sakarya City) and Determination the Production of Some Extracellular Enzyme
(2014) Özok, Ömrüye; Özdemir, Kerem
Bu çalışmada, Sakarya ili sınırlarında bulunan ormanlık alan topraklarından Streptomyces cinsi bakterileri izole edilerek bilgisayar yardımıyla teşhisleri yapılmış ve izolatların çeşitli enzim aktiviteleri belirlenmiştir. Yapılan renk grubu analizinde izolatlarhavasal ve misel rengi esas alınarak 4 ana gruba ayrılmıştır. Teşhisleri tamamlanan Streptomyces izolatlarının test sonuçları MVSP 3.2 bilgisayar programı ile birbirleri arasındaki benzerlik dendogramları oluşturulmuştur. Tüm izolatların fenotipik ve biyokimyasal karakterleri belirlenerek IDENTAX bilgisayar programına bu veriler aktarılmış, cins içerisindeki pozisyonları belirlenerek teşhisleri yapılmıştır. Bu teşhislere göre 80 izolattan 49 'unun Streptomyces exfoliatus, 14'ünün Streptomyces atroolivaceus, 1'i Streptomyces albidoflavus,1'i Streptomyces chromofuscus, 1'i de Streptomyces purpureus olduğu belirlenmiştir. Ayrıca tüm izolatların Proteaz, Amilaz, Lipaz, Selülaz ve Asparaginaz enzim aktiviteleri belirlenmiştir. Enzim analizleri sonucunda tüm izolatların % 15'i asparaginaz enzimi için pozitif, % 5'i proteaz enzimi için pozitif, ayrıca D0047 izolatının selülaz enzimi için pozitif olduğu belirlenmiş olup amilaz ve lipaz için pozitif sonuç görülmemiştir. Özellikle asparaginaz enziminin kemoterapi de neoplastik ajan olarak kullanılışı ve izolatlarımızın % 15'inin asparaginaz enzimi için pozitif sonuç göstermesi oldukça önemlidir.
Sakarya İli Ormanlık Alan Topraklarından Streptomyces Türlerinin İzolasyonu, Karakterizasyonu ve Bazı Ekstraselüler Enzimlerin Üretiminin Belirlenmesi
(2019) Ozdemır, Kerem; Özok, Ömrüye
Bu çalışmada, Sakarya ili sınırlarında bulunan ormanlık alan topraklarından Streptomyces cinsi bakterileri izole edilerek bilgisayaryardımıyla teşhisleri yapılmış ve izolatların amilaz, selülaz, L-asparaginaz, proteaz ve lipaz enzimlerinin aktiviteleri belirlenmiştir.Yapılan renk grubu analizinde izolatlar havasal ve misel rengi esas alınarak 4 ana gruba ayrılmıştır. Teşhisleri tamamlananStreptomyces izolatlarının test sonuçları MVSP 3.2 bilgisayar programı ile birbirleri arasındaki benzerlik dendogramlarıoluşturulmuştur. Tüm izolatların fenotipik ve biyokimyasal karakterleri belirlenerek IDENTAX bilgisayar programına bu verileraktarılmış, cins içerisindeki pozisyonları belirlenerek teşhisleri yapılmıştır. Bu teşhislere göre 80 izolattan 49’unun Streptomycesexfoliatus, 14’ünün Streptomyces atroolivaceus, 1’i Streptomyces albidoflavus,1’i Streptomyces chromofuscus, 1’i de Streptomycespurpureus olduğu belirlenmiştir. Ayrıca tüm izolatların proteaz, amilaz, lipaz, selülaz ve asparaginaz enzim aktiviteleribelirlenmiştir
Synthesis of Artemisinin-Benzothiophene Derivatives, Antimicrobial, Antioxidant Properties and Determination of Cytotoxicity Activity
(2021) Özok, Ömrüye; Kıvrak, Arif
Yüzyıllardan beri insanoğlu doğadan elde ettiği ilaçları farklı hastalıkların tedavisinde kullanmaktadır. Pelin bitkisinden (Artemisia absinthium) izole edilen doğal ürün olan artemisinin molekülü sıtma tedavisinde alternatifi olmayan bir molekül olarak karşımıza çıkmaktadır. Son yıllarda Artemisinin üzerine yapılan çalışmalarda sadece sıtma tedavisinde değil ayrıca farklı kanser türlerinin tedavisinde de etkili olduğu bulunmuştur. Bunun sonucu olarak Artemisinin ve yarı sentetik türevleri üzerine oldukça yoğun bilimsel çalışmalar başlatılmıştır. Bazı çalışmalarda artemisinin içeren hibrit moleküllerin Artemisinin etken molekülünden daha yüksek biyolojik aktivite gösterdikleri rapor edilmiştir. Özellikle yapısında Artemisinin ve biyolojik etkisi bilinen yapıların bulunduğu hibrit moleküllerin sentezi ve bunların biyolojik özellikleri üzerine literatürde farklı çalışmalar söz konusudur. Bu çalışmada, analjezik, ateş düşürücü, antibakteriyel, antiparazitik, antitümör ve antikanser aktivitelerinden dolayı ilaç uygulamaları için çok büyük öneme sahip benzotiyofen molekülleri ile artemisinin molekülü bir araya getirilerek yeni hibrit moleküller sentezlenmiştir. Geliştirdiğimiz sentetik yöntemler (Sonagashira kenetlenme tepkimesi, elektrofilik halkalaşma tepkimesi, Suzuki Miyaura kenetlenme ve Steglich esterleşme tepkimesi) kullanılarak yeni artemisinin-benzotiyofen, artesunat-benzotiyofen (34 türev) türevleri yüksek verimler ile elde edilmiştir. Sentezlenen ve izole edilen tüm moleküllerin yapısal karakterizasyonu spektroskobik yöntemler ile kesin olarak bulunmuştur. Son bölümde ise hedef moleküllerin biyolojik potansiyellerinin ortaya çıkarılması için belirli türevlerin farklı kanser hatlarında sitotoksite özellikleri test edilmiştir. Buna göre artesunate-artemisinin molekülü özellikle kolon kanseri için kullanılan Caco-2 de oldukça düşük sitotoksiteye (EC50: 83.1µM) sahiptir. Ayrıca artemisinin-benzotiyofen ve artesunate-benzotiyofenlerin (6 türev) antimikrobiyal özellikleri, antioksidant kapasiteleri araştırılmıştır. Elde edilen bulgulara göre sentezlenen türevlerin ileriki yıllarda kanser tedavisinde kullanılma potansiyelleri söz konusudur. Son basamakta ise sitotoksik etki gösteren iki türevin SARS-CoV-2 ana proteazına bağlanma potansiyeli Molecular Docking ile belirlenmiştir. Test edilen türevlerin ana proteazına yüksek bağlanma özelliği gösterdiği bulunmuştur. Bu çalışmada, 34 yeni artemisinin-benzotiyofen hibrit yapıları ilk defa sentezlenmiş ve 6 türevin sitotoksik özellikleri, anti-viral potansiyelleri, antimikrobiyal etkileri ve antioksidant kapasiteleri ortaya çıkarılmıştır.