Browsing by Author "Şavur, Orçun Burak"

Now showing 1 - 3 of 3

Detection of Species Diversity of Arbuscular Mycorrhizal Fungi (AMF) by Classic and Molecular Methods From the Melon (Cucumis Melo L.) Plants in Van and Its Districts
(2008) Şavur, Orçun Burak; Demir, Semra
Doğadaki en yaygın simbiontlardan biri olan Arbusküler Mikorhizal Funguslar(AMF) gerek bitki gelişimini ve gerekse hastalıklara dayanıklılığı artırma açısındanoldukça önemli rollere sahiptirler. Dünya üzerinde bilinen kara bitkilerinin yaklaşık %80'i bu simbiontlarla ortak yaşam ilişkisindedir. AM fungusları toprak kalitesinibelirleyen en önemli faktörlerden biri olmaları dolayısıyla da en etkili rizosferkomponenetleri arasında bulunmaktadırlar. Son yıllarda yapılan çalışmaların bir kısmıbu rizosfer elemanlarının moleküler tekniklerle (PCR'a dayalı teknikler) teşhisine vekonukçu bitki-simbiont ilişkisine odaklanmıştır.Bu çalışmada Van ve çevresinde bulunan kavun ekim alanlarında AMfunguslarının tespit edilmesi, kolonizasyon oranlarının ortaya konması ve nested-PCR'adayalı moleküler yöntemlerle de tür tespitlerinin yapılması amaçlanmıştır. Fungalsimbiontları elde etmek amacıyla 2007 yılında Ağustos ayında kavun bitkilerininyoğunlukta yetiştirildiği toplam 10 lokasyonda 100 adet kavun bitkisine ait rizosferbölgesinden toprak örneği alınmıştır. Bu bitkilerin de yaklaşık %52'sinin arbuskülermikorhizalfunguslar tarafından değişen oranlarda (% 4.5 ? %37.8) kolonize olduğu vesimbiyotik yaşam ilişkisi kurabildiği tespit edilmiştir.Arbusküler mikorhizal fungusların tür teşhisleri Nested-PCR yöntemikullanılarak yapılmıştır. Söz konusu yöntem sayesinde toplam 11 adet farklı kavunbitkisinde Glomus cinsine bağlı iki tür (Glomus intraradices ve Glomus mosseae)'ünmoleküler olarak teşhisi yapılmıştır.
Prunus Yapraklarında Prunus Necrotic Ring Spot (Pnrsv) ve Apple Chlorotic Leaf Spot (Aclsv) Virüslerinin Dağılımı
(2005) Usta, Mustafa; Sipahioglu, Hikmet Murat; Ocak, Mustafa; Şavur, Orçun Burak; Polat, Bülent
Prunus necrotic ringspot virüs (PNRSV)'ü ile infekteli Prunus mahaleb ve Apple chlorotic leafspot virüs (ACLSV)'ü ile infekteli şeftali (P. persica L.) yapraklarının farklı bölgelerinden alınan doku diskleri bu virüslerin yaprak dokusundaki dağılımlarını belirlemek amacı ile sırasıyla enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) ve reverse transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR) teknikleri ile analiz edilmişlerdir. Gerçekleştirilen ELISA testleri sonucunda her iki virüsünde yaprak ayasında yaprak sapı bölgesinde daha konsantre oldukları ve konukçu yapraklarında düzensiz bir dağılım gösterdikleri tespit edilmiştir. Aynı yaprak bölgelerinin kullanıldığı RT-PCR testlerinde 'ise her iki virüsün genetik materyalinin tüm yaprak bölgeleri için birbirine yakın ölçülerde amplifikasyon ürünleri oluşturduğu belirlenmiş ve testlenen yaprak bölgeleri arasında viral konsantrasyon bakımından bariz farklılıkların olmadığı saptanmıştır. RT-PCR testi sonuçlarından elde edilen kesin, net ve dengeli teşhisi ifade eden bantlar, ACLSV ve PNRSV virüslerinin Prunus yapraklarının testlenen tüm bölgelerinde homojen bir dağılım sergilediğini göstermiştir. Her iki virüs, kullanılan test yöntemine göre konukçularında farklı dağılım sergilemişlerdir. Elde edilen bulgular ışığında PNRSV ile ACLSV'nin konukçularındaki dağılımını belirlemede ELISA testi ile PCR testi arasında bir korelasyon saptanmamıştır.
Van ve Çevresinde Gramineae Familyası Bitkilerinde Arbusküler Mikorhizaların Belirlenmesi
(2008) Şavur, Orçun Burak; Demır, Semra; Özkan, O.umut; Kaya, İlhan
Bu çalışmada Van ve çevresinde bulunan Gramineae alanlarında AM funguslarının tespit edilmesi ve bu mikroorganizmaların Gramineae familyasına ait bitkilerdeki kolonizasyon oranlarının ortaya konması amaçlanmıştır. Fungal simbiontları elde etmek amacıyla 2005 yılında Haziran-Temmuz aylarında Gramineae familyasına ait bitkilerin yoğunlukta bulunduğu toplam 24 lokasyonda 82 adet Graminae bitkisine ait rizosfer bölgesinden toprak örneği alınmıştır. Örnekleme alanlarında yapılan surveyler sonucunda Triticum aestivum L., %43.9 ile en yoğun tür olarak belirlenirken; bunu sırasıyla Secale cereale L. (% 6.09), Bromus tectorum L. (% 6.09), Lolium temulentum L. (% 4.87), Aegilops caudata Link. (% 3.65), Aegilops sp. (% 3.65) Digitaria sanguinalis (L.) Scop. (% 3.65), Phragmites communis Trin. (% 3.65), Agropyron cristatum L. (% 3.65), Taeniatheum caput-medusa subsp. crinita L. (% 2.43), Aegilops truincialis L. (% 2.43), Phalaris sp. (% 2.43), Hordeum sp. (% 2.43), Avena fatua L. (% 1.21), Alopecurus arundinaceus Poir (% 1.21), Aegilops geniculata Roth. (% 1.21), Setaria viridis (L.) P.B. (% 1.21), Poa sp. (% 1.21), Poa bulbosa L. (% 1.21), Phleum sp. (% 1.21), Hordeum bulbosum L. (% 1.21) ve Hordeum vialaceum L. (% 1.21) takip etmiştir. Bu bitkilerin de yaklaşık %55'inin arbusküler-mikorhizal funguslar tarafından değişen oranlarda (%4.16 -%47.5) kolonize olduğu ve simbiyotik yaşam ilişkisi kurabildiği tespit edilmiştir