Browsing by Author "Aras, Nurcan"

Now showing 1 - 4 of 4

Investigation of the Association Between Chronic Hepatitis B and C Infection and Interleukin 2 (-330) Gene Polymorphism
(Gazi Univ, Fac Med, 2016) Borekci, Gulay; Talin, Serap; Kandemir, Ozlem; Celik, Sevim Karakas; Berkoz, Mehmet; Aras, Nurcan
Objective: Cytokines has an important role in the immunopathogenesis of hepatitis B virus (HBV) and hepatitis C virus (HCV) infections. Interleukin-2 (IL-2) secreted by Th1 cells which plays an important role in regulating both in activation of the immune system and homeostasis, is a cytokine having a wide spectrum of effects on the immune system. Although there are many studies investigating the relationship between IL-2-330 gene polymorphism and diseases, a few studied was found to investigate the role in the immunopathogenesis of HBV and HCV infections of this cytokine polymorphisms. This study was aimed to determine the relationship between IL-2-330 gene polymorphisms and chronic hepatitis B and C infections. Methods: A total of 139 patients with chronic hepatitis B, 101 patients with hepatitis C and 87 healthy subjects as control groups were included into this study. Approximately 2 ml of blood from patients and control groups were taken into tubes containing EDTA, and genomic DNA was isolated using DNA isolation kit. Single nucleotide polypmorphsim from the obtained DNAs was investigated using the polymerase chain reaction-confronting two-pair primers (PCR-CTPP) methods. Results: The genotype frequencies of IL-2-330 TT, GT, GG were detected as 23.7%, 53.2%, 23% in patients with chronic hepatitis B and 27.6%, 50.6%, 21.8% in control groups, respectively (p>0.05). The frequencies of TT, GT, GG genotypes were found to be 34.7%, 56.4%, 8.9% in patients with chronic hepatitis C and 27.6%, 50.6%, 21.8% in control group, respectively. GG genotype frequency was significantly lower in patient groups with hepatitis C compared with the control group (p<0.05). The frequency of T allele was 50.4% in patients with chronic hepatitis B and 52.9% in control groups. The frequency of G allele in patients with chronic hepatitis B was 49.6% and 47.1% in control groups ((p>0.05). The frequencies of T and G alleles were found to be 69.4%, 30.6% in patients with chronic hepatitis C and 52.9%, 47.1% in control groups, respectively (p<0.05). Conclusion: In our study while there was no statistically significant relationship between chronic hepatitis B and IL-2-330 gene polymorphisms, significant association was found between GG genotype and chronic hepatitis C. According to our findings the GG genotype in the-330 position of IL-2 gene may be preventive effect in chronicy of hepatitis C in Turkish population, however, further research can contribute to clarify the issue.
Investigation of the Association Between Chronic Hepatitis B and C Infections and Tnf-Α( Gene Polymorphism
(Ankara Microbiology Soc, 2016) Borekci, Gulay; Aras, Nurcan; Kandemir, Ozlem; Yalin, Serap; Celik, Sevim Karakas; Berkoz, Mehmet
Cytokines and genetic factors play important roles in the pathogenesis of chronic hepatitis B (CHB) and chronic hepatitis C (CHC) infections. Variations in cytokine genes may effect the gene expression and may lead to changes in the clinical manifestations of diseases. One of the single nucleotide polymorphisms in the promoter region of tumor necrosis factor-alpha (TNF-alpha) gene is the polymorphism at -308. position which was investigated in many studies by means of its relationship between CHB and CHC infections, however their results are incompatible. Furthermore, there is no sufficient data on this subject in our country. This study was aimed to determine the relationship between TNF-a(-308) gene polymorphism with CHB and CHC infections. A total of 271 patients with chronic hepatitis and 181 healthy subjects were included in the study. Of them 167 were CHB cases (67 female, 100 male; age range 18-74 years, mean age: 40.23 +/- 13.09) and 95 controls for CHB group (46 female, 49 male; mean age: 36.41 +/- 15.0 years), while 104 were CHC cases (63 female, 41 male; age range: 25-79 years, mean age: 52.8 +/- 12.6) and 86 controls for CHC group (41 female, 45 male; mean age: 36.4 +/- 14.9 years). After the isolation of genomic DNA from blood samples of the patient and control groups, TNF-alpha(-308)G/A (rs 1800629) polymorphism was investigated by using the real-time polymerase chain reaction from the obtained DNAs. Among CHB group, TNF-alpha(-308) GG, GA, AA genotypes were detected in 126 (75.4%), 38 (22.8%) and 3 (1.8%) of the patients, respectively, while these numbers were 84 (88.4%), 11 (11.6%) and 0 (0%) in control group, respectively. Among CHC group, TNF-a(-308) GG, GA, AA genotypes were detected in 37 (35.6%), 28 (26.9%) and 39 (37.5%) of the patients, respectively, while these numbers were 38 (44.2%), 8 (9.3%) and 40 (46.5%) in control group, respectively. The frequency of GA genotype was significantly higher in both patient groups compared to the control groups (p=0.024 for CHB and p= 0.006 for CHC). When the distribution of allele frequencies of TNF-alpha(-308)G/A polymorphism was evaluated in the patients and control groups, it was noted that G allele was found to be high in CHB patients comparing with controls (94.2% vs 86.8%), however A allele was identified to be lower than controls (5.8% vs 13.2%) (p= 0.008). In contrast, there was no significant difference in terms of allele frequency compared with CHC patients and the control group (p= 0.969). In conclusion, our data in accordance with the results of many studies in literature, determined that TNF-alpha(-308) polymorphisms can influence the chronicity of hepatitis B and C infections. Further studies on this subject would contribute to the elucidation of the molecular mechanisms of chronic hepatitis B and C diseases.
Kronik Hepatit B ve C Enfeksiyonları ile TNF-?(-308) Gen Polimorfi Zmi Arasındaki İlişkinin Araştırılması
(2016) Berkoz, Mehmet; Yalın, Serap; Çelik, Sevim Karakaş; Börekçi, Gülay; Aras, Nurcan; Kandemir, Fatma Özlem
Kronik hepatit B (KHB) ve kronik hepatit C (KHC) enfeksiyonlarının patogenezinde, sitokinler ve genetik faktörler önemli rol oynamaktadır. Sitokin genlerindeki değişimler, gen ekspresyonunu etkileyerek hastalığın klinik seyrini değiştirebilmektedir. Tümör nekrozis faktör alfa (TNF-?) geninin promotor bölgesindeki tek nükleotid polimorfi zmlerinden biri olan -308 polimorfi zmi ile KHB ve KHC enfeksiyonları arasındaki ilişkiyi araştıran çeşitli çalışmalar bulunmakla birlikte, çelişkili sonuçlar bildirilmektedir. Ayrıca bu konu ile ilgili olarak ülkemizde yeterli veri bulunmamaktadır. Bu çalışmada, KHB ve KHC enfeksiyonu ile TNF-?(-308) gen polimorfi zmi arasındaki ilişkinin araştırılması amaçlanmıştır. Çalışmaya, KHB'li 167 hasta (67 kadın, 100 erkek; yaş aralığı 18-74 yıl, yaş ortalaması: 40.23 ± 13.09) ile bu grup için 95 kontrol (46 kadın, 49 erkek; yaş ortalaması: 36.41 ± 15.0 yıl) ve KHC'li 104 hasta (63 kadın, 41 erkek; yaş aralığı: 25-79 yıl, yaş ortalaması: 52.8 ± 12.6) ile bu grup için 86 kontrol (41 kadın, 45 erkek; yaş ortalaması: 36.4 ± 14.9 yıl) olmak üzere toplam 271 kronik hepatitli hasta ve 181 sağlıklı birey dahil edilmiştir. Hasta ve kontrollerden alınan kan örneklerinden genomik DNA izole edilmiş ve elde edilen DNA'larda TNF-?(-308)G/A (rs 1800629) polimorfi zmi gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu yöntemi ile araştırılmıştır. KHB'li hasta grubunda TNF-?(-308) GG, GA ve AA genotipleri sırasıyla 126 (%75.4), 38 (%22.8) ve 3 (%1.8) hastada saptanırken, kontrol grubunda bu sayılar sırasıyla 84 (%88.4), 11 (%11.6) ve 0 (%0) olarak izlenmiştir. KHC'li hasta grubunda ise TNF-?(-308) GG, GA ve AA genotipleri sırasıyla 37 (%35.6), 28 (%26.9) ve 39 (%37.5) hastada bulunmuş, kontrol grubunda bu sayılar sırasıyla 38 (%44.2), 8 (%9.3) ve 40 (%46.5) olarak belirlenmiştir. Her iki hasta grubunda da tespit edilen GA genotip sıklığı kontrol gruplarıyla karşılaştırıldığında, istatistiksel olarak anlamlı düzeyde yüksek olduğu saptanmıştır (KHB için p= 0.024, KHC için p= 0.006). Hasta ve kontrol gruplarında, TNF-?(-308)G/A polimorfi zmi alel sıklıklarının dağılımı incelendiğinde; KHB'li hastalarda G alelinin kontrollere göre yüksek (%94.2'ye karşı %86.8), A alelinin ise düşük (%5.8'e karşı %13.2) olduğu dikkati çekmiştir (p= 0.008). KHC'li hastalarda ise G ve A alellerinin sıklıkları (sırasıyla %48.8 ve %51.2), kontrol grubuna göre (sırasıyla %49 ve %51) anlamlı farklılık göstermemiştir (p= 0.969). Sonuç olarak bulgularımız, literatürdeki çoğu çalışmanın verileri ile uyumlu olarak, hepatit B ve C enfeksiyonlarında TNF-?(-308)GA genotipinin, kronikleşmede etkili olabileceğini düşündürmüştür. Bu konuda yapılacak daha ileri çalışmalar, hepatit B ve C hastalığının kronikleşmesindeki moleküler mekanizmaların aydınlatılmasına katkı sağlayabilir
Kronik Hepatit B ve C Enfeksiyonu ile İnterlökin-2 (-330) Gen Polimorfizmi Arasındaki İlişkinin Araştırılması
(2016) Yalın, Serap; Berkoz, Mehmet; Börekçi, Gülay; Karakaş, Sevim Çelik; Kandemir, Fatma Özlem; Aras, Nurcan
Amaç: Hepatit B virüs (HBV) ve hepatit C virüs (HCV) enfeksiyonlarının immunopatogenezinde sitokinler oldukça büyük öneme sahiptirler. Th1 hücreleri tarafından salgılanan interlökin-2 (IL-2) hem immun sistemin aktivasyonunda ve hem de homeostazın düzenlenmesinde önemli rol oynayan, immun sistem üzerinde oldukça geniş spektrumlu etkiye sahip olan bir sitokindir. IL-2 -330 gen polimorfizmi ile hastalık ilişkisinin araştırıldığı çok sayıda çalışmaya rağmen, bu sitokin polimorfizminin HBV ve HCV enfeksiyonlarının immunopatogenezindeki rolünü araştıran oldukça az sayıda çalışma bulunmaktadır. Bu çalışmada kronik hepatit B ve C enfeksiyonu ile IL-2 330 gen polimorfizmi arasındaki ilişkinin belirlenmesi amaçlanmıştır. Yöntem: Çalışmaya kronik hepatit B'li 139 hasta, kronik hepatit C'li 101 hasta ve kontrol grubu olarak 87 sağlıklı birey dahil edilmiştir. Hasta ve kontrol grubundaki bireylerden yaklaşık 2 ml EDTA'lı tüplere kan alınmış ve DNA izolasyon kiti kullanılarak genomik DNA izole edilmiştir. Elde edilen DNA'lardan tek nükleotid polimorfizmi (SNP) polimeraz zincir reaksiyonu-confronting twopair primers (PCR-CTPP) yöntemi ile araştırılmıştır. Bulgular: Hepatit B hasta grubunda IL-2 -330 TT, GT ve GG genotip sıklığı sırasıyla %23.7, %53.2 ve %23; kontrol grubunda ise %27.6, %50.6 ve %21.8 olarak saptanmıştır (p>0.05). Hepatit C hasta grubunda ise; TT, GT ve GG genotip sıklığı %34.7, %56.4 ve %8.9; kontrol grubunda ise %27.6, %50.6 ve %21.8 olarak saptanmış; GG genotip sıklığı kronik hepatit C hastalarında kontrol grubuna göre daha düşük bulunmuştur (p<0.05).T allel sıklığı kronik hepatit B'li hastalarda %50.4, kontrol grubunda %52.9; G alleli ise hasta grubunda %49.6, kontrol grubunda ise %47.1 idi (p>0.05). Kronik hepatit C'li hastalarda ise T allel sıklığı %69.4, kontrol grubunda ise %52.9, G alleli ise hasta grubunda %30.6, kontrol grubunda ise %47.1 olarak belirlenmiştir (p<0.05). Sonuç: Çalışmamızda kronik hepatit B ile IL-2 geninin -330 pozisyonundaki polimorfizmi arasında istatistiksel olarak anlamlı bir ilişki saptanmazken, GG genotipi ile kronik hepatit C arasında anlamlı bir ilişki bulunmuştur. Bulgularımıza göre Türk popülasyonunda IL-2 geni -330 pozisyonundaki GG genotipi ve G alleli kronik hepatit C'de koruyucu etkiye sahip olabilir, ancak daha kapsamlı çalışmalar konunun aydınlatılmasına katkı sağlayabilir.