Browsing by Author "Boynukara, Banur"
Now showing 1 - 20 of 21
- Results Per Page
- Sort Options
Research Project Atık Yapmış Koyunların Süt ve Atık Etus Mide İçeriklerinde Brucella Melitensis'in Kültür ve Polimeraz Zincir Reaksiyonu ile Belirlenmesi(2006) Ilhan, Ziya; Solmaz, Hasan; Gülhan, Timur; Ekin, İsmail H.; Boynukara, Banur; Aksakal, Abdülbaki-Article Avian İnfluenza Tip A Virüsleri: Etiyoloji, Teşhis ve Korunma(2009) Gulhan, Timur; İlhan, Ziya; Aksakal, Abdülbaki; Boynukara, Banur; Ekin, İsmail Hakkı; Solmaz, HasanAvian influenza tip A virüs infeksiyonları Uluslararası Salgın Hastalıklar Ofisi (OIE) tarafından en tehlikeli insan ve hayvan hastalıkları grubunda sınıflandırılmaktadır. Son yüzyılda birçok infeksiyöz hastalık eradike veya kontrol edilmiş olmasına rağmen, özellikle H5N1 alt tipi başta olmak üzere avian influenza tip A virüs infeksiyonlarının 21. yüzyılın en önemli halk sağlığı problemlerinden biri olduğu kabul edilmektedir. Bu derlemede, yazılı kaynaklardaki son gelişmeler değerlendirilerek avian influenza tip A virüslerine ait bilgiler sunulmuştur.Article The Cataracterization of Protein Profiles of the Aeromonas Hydrophila and A.caviae Strains Isolated From Gull and Rainbow Trout Feces by Sds-Page(2003) Boynukara, Banur; Körkoca, HanifiBu çalışmada biri Aeromonas hydrophila ATCC 7512 olmak üzere toplam 10 hareketli aeromonas susu kullanıldı. Bu suşların beşi martılardan (bir A. hydrophila ve dört A. caviae susu), dördü alabalıklardan (üç A. hydrophila susu ve bir A. caviae susu) izole edildi. Bu suşlara ait tüm hücre protein profilleri SDS-PAGE yöntemi ile analiz edildi. Her bir susa ait protein profillerinin karşılaştırılması sonucu 45 çift oluşturuldu. Bu çiftlerin 17si (% 37,8) farklı, 18'i (% 40) şüpheli ilişkili, 10'u (% 22,2) identik bulundu. Aynı türe ait suşlar kendi içerisinde karşılaştırıldığında dört A. hydrophila susunun tamamı farklı veya şüpheli ilişkili bulunurken, beş A. caviae susunun biri dışında dördü identik bulundu. Martılardan izole edilen bir A. hydrophila susu, yine martılardan izole edilen dört A. caviae susu ile identik bulundu. Ülkemizde, A. hydrophila ve A. caviae suşlarının martı dışkılarından izolasyonunun ve SDS-PAGE yöntemiyle protein profillerinin ilk defa ortaya konulduğu bu araştırma, konuyla ilgili bundan sonra yapılacak çalışmalara katkıda bulunacaktır.Article Classical Enterotoxigenic Characteristics of Staphylococcus Aureus Strains Isolated From Bovine Subclinical Mastitis in Van, Turkey(Elsevier, 2008) Boynukara, Banur; Gulhan, Timur; Alisarli, Mustafa; Gurturk, Kemal; Solmaz, HasanThe aim of the present study was to investigate classical enterotoxigenic properties of Staphylococcus aureus strains isolated from cows with subclinical mastitis. For this purpose, 480 milk samples from cows with subclinical mastitis raised in different villages neighbouring Van city Center were collected. A total of 106 S. aureus strains were isolated. Twenty seven isolates (25.5%) were found to be enterotoxigenic by reverse passive latex agglutination (RPLA). Of these, 25 (23.6%) were positive for staphylococcal enterotoxin A (SEA), 2 (1.9%) for SEB. None of the isolates was positive for SEC or SED. This study showed that most S. aureus strains isolated from bovine subclinical mastitis produced SEA compared to other SEs. (C) 2008 Elsevier B.V. All rights reserved.Article Determination of Newcastle Disease Virus Among Wild Bird Populations in Lake Van Basin, Turkey(Tubitak Scientific & Technological Research Council Turkey, 2013) Boynukara, Banur; Gulhan, Timur; Coven, Fethiye; Kiziroglu, Ilhami; Durmus, AtillaIn this study, 540 feces samples taken from a total of 22 bird species, including transit migrant, winter visitor, migratory, and resident bird species, in Lake Van basin were examined by real-time polymerase chain reaction (RT-PCR) with respect to the Newcastle disease virus (NDV). All of the feces samples were cultured in specific pathogen-free embryonated chicken eggs (ECEs) for NDV isolation. The NDV isolates were analyzed for virulent fusion (F) protein by RT reverse transcription PCR (RRT-PCR). Of the 540 examined feces samples, 28 (5.18%) were found to be positive by RT-PCR. The same samples were cultured in ECEs and, of those, 9 (1.66%) were positive for NDV isolations. Of the isolates, 7 were obtained from the migrant waterfowls Phoenicopterus ruber, Anas clypeata, Aythya ferina, and Aythya fuligula and 2 were from the resident species Columba livia. The RRT-PCR F protein was determined in 1 isolate belonging to Aythya ferina; this strain was typed as mesogenic/velogenic avian paramyxovirus type 1 and the other 8 isolates as lentogenic. In this study, we investigated, for the first time, the presence of NDV in wild, seemingly healthy bird feces from areas in Lake Van basin, in Turkey.Article Enteric Bacteria and Some Pathogenic Properties of Enterococcus Faecalis, Enterococcus Faecium and Escherichia Coli Strains Isolated From Wild Ducks and Gulls(Parlar Scientific Publications (p S P), 2012) Gulhan, Timur; Boynukara, Banur; Durmus, Atilla; Kiziroglu, Ilhami; Sancak, Yakup CanThis study was performed to isolate enteric bacteria from the feces of wild duck and gull species in the Van Lake Basin, and to determine different virulence and pathogenic factors of the Enterococcus species and Escherichia coli. In this research, carried out for the first time on wild ducks in Turkey, a total of 357 feces samples were examined from the following animals: 126 Shoveler (Anas clypeata), 92 Common Pochard (Aythya ferina), 80 Black Headed Gull (Larus ridibundus), and 59 Yellow-Legged Gull (Larus michahellis). Forty-eight (13.5%) bacteria were isolated and identified in the feces samples in the following distribution: 23 (6.4%) Enterococcus faecium, nine(2.5%) Escherichia coli, 7 (2%) Enterococcus faecalis, 6 (1.7%) Citrobacter braakii, 1 (0.3%) Enterobacter cloacae, 1 (0.3%) Streptococcus pyogenes and 1 (0.3%) Corynebacterium diphtheria. When the virulence factors of Enterococcus isolates were evaluated: 18 of 23 (78.3%) E. faecium strains were positive for gelatinase; four (17.4%) for cytolysin; two (8.7%) for aggregation substance (AS); four of seven (57.1%) E. faecalis isolates were positive for gelatinase; four (57.1%) for cytolysin; and one (14.3%) for AS. Three of the E. faecium strains were found to be positive in both gelatinase and cytolysin, one in gelatinase and AS, one of the E. faecalis isolates was positive in gelatinase, AS and cytolysin, and one was positive in gelatinase and cytolysin. Nine E. coli strains were examined for pathogenic properties such as the O157:H7 serotype, verotoxin 1 (VT1), verotoxin 2 (VT2), stabile toxin (ST) and labile toxin (LT). Two E. coli strains (22.2%) were positive for the 0157 serotype. Positive strains belonged to the Anas clypeata and Aythya ferina duck species. All E. coli isolates were found to be negative for H7 serotype, VT1, VT2, ST and LT.Article Evolution of Slime Production by Coagulase-Negative Staphylococci and Enterotoxigenic Characteristics of Staphylococcus Aureus Strains Isolated From Various Human Clinical Specimens(Soc General Microbiology, 2007) Boynukara, Banur; Gulhan, Timur; Gurturk, Kemal; Alisarli, Mustafa; Ogun, ErdalThe present study was designed to determine the slime production of coag u lase- negative staphylococci (CoNS) and the enterotoxigenic properties of Staphylococcus aureus strains, and to evaluate the clinical importance of slime-producing CoNS and enterotoxigenic S. aureus strains isolated from various human clinical specimens. For this purpose, a total of 120 Staphylococcus strains were isolated and identified, and further characterized for their slime production and enterotoxigenicity. Of the clinical isolates, 55 (45.8 %) were found to be S. aureus, and the others (54.2 %) were identified as CoNS. Of the CoNS, 20 (116.7 %) were further identified as Staphylococcus hominis, 18 (15 %) as Staphylococcus epidermidis, six (5 %) as Staphylococcus xylosus, six (5 %) as Staphylococcus warneri, five (4.2 as Staphylococcus sciuri, four (3.3 %) as Staphylococcus haemolyticus, and two each (1. 7 as Staphylococcus simulans, Staphylococcus capitis and Staphylococcus saprophyticus, respectively. Thirty-nine (60%) of 65 CoNS were found to be slime producers. Slime production was observed in all CoNS, except S. capitis, mostly from blood (38.5 %), tracheal aspiration (20.5 %) and urine (112.8 %) specimens. In addition, of the 55 S. aureus isolates, 46 (83.6 %) were found to be enterotoxigenic, and of these S. aureus strains, 39 (84.7 %) were positive for staphylococcal enterotoxin (SE)A. The results of this study showed that the slime-producing CoNS were mostly found in clinical specimens of blood, tracheal aspirate and urine. SEA was the predominant enterotoxin type detected in S. aureus strains from human clinical specimens.Article İnsan ve Sığır Orijinli Staphylococcus Aureus Suşlarının Çeşitli Biyokimyasal Özellikleri İe Antibiyotiklere Duyarlılıklarının Karşılaştırılması(1997) Boynukara, Banur; Gulhan, TimurBu çalışmada, subklinik mastitisli sığırların sütlerinden izole ve identifiye edilen 50, insan boğaz kültürlerinden izole ve identifiye edilen 50 adet Staphylococcus aureus suşunun patojeniteyi direkt ya da dolaylı olarak belirleyen çeşitli biyokimyasal özellikleri ile antibiyotik duyarlılıkları karşılaştırıldı. Bu araştırmanın sonucunda, subklinik mastitisli sığırların sütlerinden ve insanların boğaz kültürlerinden izole edilen Staphylococcus aureus suşlarının glikoz ve mannitol'ün aerop ve anaerop fermentasyonu, clumping factor, $\\beta$ -hemolizin, tüp koagulaz, DNase ve stafilokmaz testi gibi biyokimyasal özelliklen bakımından benzer (p>0.05), sarı ve beyaz pigment, $\\alpha$ -toksin oluşturma, protein-A, lesitinaz ve kazeinaz testi gibi biyokimyasal özellikler bakımından ise farklı (p<0.05) olduğu saptandı. Sığır ve insan orijinli suşların değişik antibiyotiklere duyarlılıkları karşılaştırıldığında ise; vankomisın, basitrasın, penisilin-G, metisılın, siprofloksasın ve sefaperozon+sulbaktanva duyarlılıklarının benzer (p>0.05), novobiosin, eritromisin, ampisilin+sulbaktam'a duyarlılıklarının farklı (p<0.05) olduğu ortaya konuldu.Other İthal Kozmetik Bir Deri Kreminden Aspergillus Niger İzolasyonu(2002) Boynukara, Banur; İlhan, Ziya; Gulhan, TimurAspergillus cinsine ait mantarlar doğada yaygın olarak hemen her yerde bulunmaktadır. Bu mantarların çoğu saproßt olmakla birlikte, özellikle bazı türleri insan ve hayvanlarda allerjik reaksiyonlara, mikotoksikozislere, önemli lokal ve sistemik infeksiyonlara neden olmaktadır. Bu çalışmada, mikrobiyal üremenin görüldüğü ithal bir deri kreminden etken izolasyonu ve idenliflkasyonu amaçlandı. Bakteriyal etkenlerin izolasyonu için % 7 koyun kanlı ağara, mikotik etkenlerin izolasyonu için de Sabouraud Dextrose ağara ekimler yapıldı. Kanlı ağarda 5. günün sonunda her hangi bir bakteriyal üreme olmadı. Sabouraud Dextrose ağarda 5. günde yoğun bir üreme görüldü. Üreyen kolonilerin makroskopik (kolonilerin alttan ve üstten rengi) ve mikroskopik (konidia, vesikül, konidiafor ve metula yapıları) özelliklerinin incelenmesi sonuncunda izole edilen mantar A. niger olarak identifiye edildi. Sonuç olarak, ithal edilen krem gibi çeşitli kozmetik ürünlerin ülke içerisinde depolanma ve dağıtım koşullarının ideal şartlara getirilmesi daha doğru bir uygulama olacaktır.Article Occurrence and Antibiotic Susceptibility of Salmonella Serotypes in Apparently Healthy Slaughtered Sheep in Van, Turkey(Medwell online, 2009) Aksakal, Abdulbaki; Boynukara, Banur; Solmaz, Hasan; Ilhan, Ziya; Kutlu, Ismail; Gulhan, TimurThis study was conducted to investigate the occurrence of Salmonella sp. and to determine their susceptibility to antibiotics in apparently healthy slaughtered sheep. In this research, a total of 600 (300 rectal and 300 vaginal) swabs taken from sheep were used as materials. A total of 9 (1.5%) Salmonella sp. were isolated from samples. Of the 9 Salmonella sp., 6 (2%) were isolated from rectal swabs and 3 (1%) Salmonella serotypes from vaginal swabs. Salmonella strains were serotyped as Salmonella saintpaul. All Salmonella strains were found to be susceptible to ampicillin, enrofloxacin, tetracycline, oxytetracycline, gentamicin, neomycin, chloramphenicol, spectinomycin, cephalothin, amoxycillin/clavulanic acid, trimethoprim+ sulfamethoxazole, nalidixic acid and penicillin G (except 2 isolates) whereas, they were resistant to erythromycin and novobiocin. This is the first time, S. saintpaul was isolated in rectal and vaginal swab samples of the sheep slaughtered in abattoirs in Turkey.Master Thesis The Isolation of Motile Aeromonas Strains From the Feces of Chicken, Gull and Rainbow Trout (Oncorhyncus Mykiss), and the Determination of Their Protein Profiles by Sds-Page(2001) Körkoca, Hanifi; Boynukara, BanurBu araştırmada, tavuk, martı dışkılarından ve alabalık barsak içeriklerinden hareketli aeromonaslar izole ve identifiye edilerek, bu suşlann protein profilleri SDS- PAGE yöntemiyle tespit edildi. Herbir susun protein profilinin diğer suşlarla olan benzerlik oranlan belirlenerek sonuçlar epidemiyolojik olarak değerlendirildi. Bu amaçla 50 adet tavuk, 50 adet martı dışkısı ve 50 adet alabalık barsak içeriğinden steril svaplarla alınan toplam 150 adet svap örneği Stuart taşıma ortamı içerisinde kısa sürede mikrobiyoloji laboratuvarma ulaştırıldı. Svap örneklerini hareketli aeromonaslar yönünden zenginleştirmek için Alkali Peptonlu Su (pH: 8.4) tüplerine ekim yapıldı.Daha sonra izolasyon amacıyla Aeromonas Medium'a ekim yapıldı, izole edilen bakterilerin biyokimyasal identifikasyonlan klasik yöntemlere göre yapıldı. Araştırma sonucunda tavuklara, martılara ve alabalıklara ait toplam 150 adet dışkı numunesinden 23 (%15.3) adet Aeromonas spp. izole edilerek, bunların 5 (21.7)'i A. caviae, 4 ( %17.4)'ü A. hydrophila ve 14 (%60.9)'ü A. sobria olarak identifiye edildi. İzole ve identifiye edilen hareketli aeromonas suşlarının protein profilleri SDS-PAGE yöntemiyle tespit edildi. Herbir susun protein profili diğer suşlann protein profilleri ile karşılaştırılarak benzerlik oranlan belirlendi. 23 adet susun karşılaştırılması sonucu oluşturulan 276 çiftin 241 (%87.3)'i farklı veya şüpheli ilişkili bulunurken, 35 (%12.7)'i identik bulundu. Aynı türe ait suşlar kendi içinde karşılaştırıldığında, A caviae 'nm 5 susu ile oluşturulan 10 çiftin 4 (%40)'ü şüpheli ilişkili, 6 (%60)'sı identik bulunurken, farklı çiftlere rastlanmadı. A. hydrophila' nın 4 susu ile oluşturulan 6 çiftin 1 (%16.6)'i farklı, 4 (%66.6)'ü şüpheli ilişkili bulunurken, 1 (%16.6)'i identik bulundu. A. sobria'mn 14 susu ile oluşturulan 91 çiftin 16 (%17.6)'sı farklı, 53 (%58.2)'ü şüpheli ilişkili bulunurken, 22 (%24.2)'si identik bulundu. Aynı hayvan türünden izole edilen, aynı türe ait hareketli Aeromonas suşlan karşılaştırıldı. Martılardan izole edilen A. caviae suşlan ile oluşturulan 5 çiftin tamamı (%100) identik bulundu. Alabalıklardan izole edilen A. hydrophila suşlan ile oluşturulan 3 çiftin 2 (%66.7)'si şüpheli ilişkili, 1 (%33.3)'i identik bulunurken, farklı çiftlere rastlanmadı. Tavuklardan izole edilen A. sobria suşlan ile oluşturulan 6 çiftin 5 (%83.3)'i şüpheli ilişkili, 1 (%16.7)'i identik bulunurken, farklı çiftlere rastlanmadı. Martılardan izole edilen A. sobria suşlan ile oluşturulan 6 çiftin tamamı (%100) identik bulundu. Alabalıklardan izole edilen A. sobria suşlan ile oluşturulan 15 çiftin 4 (%26.7)'ü şüpheli ilişkili, 11 (%73.3)'i identik bulunurken, farklı çiftlere rastlanmadı. İzole edilen her bir hareketli Aeromonas türüne ait suşlar, diğer türe ait suşlarla, izole edildikleri hayvan türleri dikkate alınmaksızın karşılaştırıldı. A. caviae suşlan ile, A. hydrophila suşlannın karşılaştırılması ile oluşturulan 20 çiftin 10 (%50)'u farklı, 5 (%25)'i şüpheli ilişkili bulunurken, 5 (%25)'i identik bulundu. A. caviae suşlan ile A. sobria suşlannın karşılaştırılması ile oluşturulan 70 çiftin 11 (%15.7)'i farklı, 59 (%84.2)ru şüpheli ilişkili bulunurken, identik çiftlere rastlanmadı. A. hydrophila suşlan ile A. sobria suşlannın karşılaştırılması ile oluşturulan 56 çiftin 26 (%46.2)'sı farklı, 30 (%53.6)'u şüpheli ilişkili bulunurken, identik çiftlere rastlanmadı. Farklı hayvan türlerinden izole edilen, aynı türe ait hareketli Aeromonas suşlan karşılaştınldı. Böyle bir karşılaştırma sonucu martılardan ve alabalıklardan izole edilen A. caviae suşlan ile oluşturulan 4 çiftin tamamı (%100) identik bulundu. Martıdan ve alabalıklardan izole 39edilen A. hydrophila suşları ile oluşturulan 3 çiftin 1 (%33.3)'i farklı, 2 (%66.7)'si şüpheli ilişkili bulunurken, identik çiftlere rastlanmadı. Tavuklardan ve martılardan izole edilen A. sobria suşları ile oluşturulan 16 çiftin tamamı (%100) şüpheli ilişkili bulundu. Tavuklardan ve alabalıklardan izole edilen A. sobria suşları ile oluşturulan 24 çiftin 16 (%66.6)'sı farklı, 8 (%33.3)'i şüpheli ilişkili bulunurken, identik çiftlere rastlanmadı. Martılardan ve alabalıklardan izole edilen A. sobria suşları ile oluşturulan 24 çiftin 20 (%83.3)'si şüpheli ilişkili, 4 (%16.7)'ü identik bulunurken, farklı çiftlere rastlanmadı Bu araştırmanın sonucunda, Türkiye'de martı dışkılarından hareketli aeromonaslann izolasyonu ile tavuk, martı ve gökkuşağı alabalıklarınım dışkılarından izole edilen hareketli aeromonaslann SDS-PAGE yöntemiyle protein profillerinin tespiti ilk kez gerçekleştirildi.Doctoral Thesis The Occurance and Prevalence Salmonella Species in Faeces of Certain Fowls and Their Susceptibility To Antibiotics(2003) Aksakal, Abdulbaki; Boynukara, BanurBu çalışmada, Van yöresindeki tavuk, hindi, bıldırcın ve devekuşlarının dışkılarında Salmonella türlerinin varlığı ve yaygınlığı ile antibiyotiklere duyarlılıkları araştırıldı. Çalışmada, tavuk (400), hindi (400), bıldırcın (200) ve devekuşlarının (200) kloakalarından steril sıvaplarla alman toplam 1200 adet dışkı örneği kullanıldı. Dışkı örneklerinden Salmonella izolasyonu amacıyla Tamponlanmış Peptonlu su, Bacto Selenit Broth, Rappaport Vassiliadis Soya Broth, Salmonella Shigella Agar ve Brillant Green Phenol-red Lactose Sucrose Agar kullanıldı. Dışkı örneklerinden toplam %4.08 (49/1200) oranında Salmonella spp. izole ve identifiye edildi. Tavuk dışkılarından %7 (28/400), hindilerden %5 (20/400) ve bıldırcınlardan %0.05 (1/200) oranında Salmonella spp. izole ve identifiye edildi. Devekuşu dışkılarından ise Salmonella izole edilemedi. Dışkı örneklerinden izole edilen Salmonella türlerinin 5 farklı serogrupta (B, Cı, C3, Di, E2) ve 9 farklı serotipte olduğu belirlendi. Tavuk dışkı örneklerinden 28 (7%) Salmonella susu izole edildi. İzole edilen suşlann 10 (%35.71)'u S. gallinarum-, 10 (%35.71)'u Salmonella enteritidis, 6 (%21.43)'sı Salmonella corvallis, 1 (%3.57)'i Salmonella typhimurium ve 1 (%3.57)'i de Salmonella agona olarak serotiplendirildi. Hindi dışkı örneklerinden 20 (%5) Salmonella susu izole edildi. İzole edilen suşlann 9 (%45)'u 51 enteritidis, 4 (%20)'ü Salmonella augustenbcrg, 3 (%15)'ü Sulmonella anatum var. 015+, 2 (%10)'si S, gallinarum, 1 (%5)'i Salmonella virchow, ve 1 (%5)'i de Salmonella Cambridge olarak serotiplendirildi. Bıldırcın dışkı örneklerinden sadece bir adet S. gallinarum izole ve identifiye edildi. Tavuk, hindi ve bıldırcınlardan izole edilen 49 adet Salmonella susunun norfloksasin, danofioksasin ve streptomisine %100, fiorfenikole %97.96, oksitetrasikline %95.92, nitrofurantoin ve enrofloksasine %92.83, ampisilin ve amoksisiline %89.80, nalidiksik aside %83.67, gentamisin ve tetrasikline %67,34, trimetoprim+sulfametaksasole %51.02, penisilin G'ye %30.61 oranında duyarlı; neomisin ve eritromisine ise %100 dirençli oldukları tespit edildi. Bu çalışmanın sonucunda, tavuk dışkı örneklerinden S. corvallis; hindi dışkı örneklerinden S. enteritidis, S. augustenborg, S. anatum var. 015+, S. virchow, S. Cambridge ve bıldırcın dışkı örneklerinden S. gallinarum Türkiye'de ilk defa izole edildi.Anahtar sözcükler: Antibiyotik Duyarlılık, Dışkı, Kanatlı, Salmonella.Article Typing of Verotoxigenic Escherichia Coli Strains Isolated From Animal and Human Sources(Kafkas Univ, veteriner Fakultesi dergisi, 2009) Gulhan, Timur; Boynukara, Banur; Alisarli, MustafaIn this study, the verotoxin types of 73 E. coli strains, 58 animal origin and 15 human origin, were examined by Vero cell culture technique. Typing was performed using Duopath verotoxin GLISA test tool. Of them 67 (91.8%) strains were typed; 31 (42.5%) were VT1, 20 (27.4%) were VT2 and 16 (21.9%) were VT1+VT2. 1 animal origin and 5 human origin totally 6 (8.2%) strains could not be typed. It was seen that this technique used in determining the verotoxin types of human and food origin E. coli strains of can also be used as practical test in determining the verotoxin types of animal origin E. coli strains.Research Project Van Bölgesinde Sığır Tüberkülozunun Polimeraz Zincir Reaksiyonu Yöntemi ile Saptanması(2006) Gülhan, Timur; Solmaz, Hasan; Ilhan, Ziya; Ekin, İsmail Hakkı; Aksakal, Abdülbaki; Boynukara, Banur-Doctoral Thesis Van Gölü Çevresinde Yaşayan Martıların (Larus Argentatus Pontoppidan) Dışkılarında İzole Edilen Salmonella, Shigella, Escherichia Coli ve Citrabakter'lerin Biyokimyasal, Serolojik ve Bazı Patojenite Özellikleri ile Çeşitleri(1998) Öğün, Erdal; Boynukara, BanurBu araştırmada, Van Gölü çevresinde yaşayan martılara (Larus argentatııs ) ait 100 adet taze dışkı örneği alınarak, Salmonella, Shigella, Escherichia coli ve Citrobacter cinsi mikroorganizmaların izolasyonu ve İdentifikasyonuna çalışıldı. Araştırma sonucunda 100 adet dışkı numunesinden sırasıyla; % 3 oranında Salmonella hvittingfoss serotipi, % 3 oranında Shigella ( 1 adet S. dysenteria, 1 adet S. flexneri ve 1 adt S. sonnei serotipi ), % 37 oranında K coli ve % 10 oranında Citrobacter freundii türleri izole ve identifiye edildi. İzole ve idetifiye edilen 37 adet E. coli susunun sırasıyla; mannoz sensitiv hemaglütinasyon oram % 37.83, mannoz rezistan hemaglütinasyon oranı % 8.10 ve negatif hemaglütinasyon veren suşlarm oram ise % 54.07 olarak belirlendi. Tavşan ince barsak lup testi ile bu suşlann % 32.43 'ünün enteropatojenik suş olduğu belirlendi. İzole ve idetifiye edilen E coli şuşlanmn 12, Salmonella, Shigella ve Citrobacter suşlanmn ise 8 farklı antibiyotiğe duyarlılıkları disk difüzyon yöntemiyle test edildi. Bu araştırma sonucunda; Van Gölü çevresinde yaşayan martıların (Lanıs argentatııs) dışkılarından Shigella sonnei hariç patojen ve nonpatojen E coli, Salmonella hvittingfoss, Shigella dysenteria, Shigella flexneri, ve Citrobacter freundii türü bakterilerin Türkiyede ilk defa izolasyon ve identifikasyonu gerçekleştirildi.Other Van Gölünün Mikrobiyolojik Kirliliği ve Halk Sağlığı Açısından Değerlendirilmesi(1995) Sancak, Y. Can; Baydaş, Burhaneddin; Berktaş, Mustafa; Sancak, Hakan; Boynukara, BanurBu çalışmada Van gölünün mikrobiyolojik kirliliğini belirlemek amacıyla yapıldı. Araştırmada, 1993 yılının Nisan-Ekim aylarında gölün değişik kesimlerinden alınan toplam 210 adet su numunesi incelendi. Yerleşim yeri niteliğinde olan bölgelerde genel olarak kirliliğin olduğu, yerleşim yeri niteFığinde olmayan bölgelerde ise henüz fazla bir kirlenmenin olmadığı ancak, kirlenmeyi önleyecek acil önlemlerin alınması gerektiği saptandı.Article Van ve Yöresindeki İneklerde Subklinik Mastitisin Etiyolojisi Üzerine Bir Çalışma(1998) Boynukara, Banur; Ekin, İsmail Hakkı; Gürtürk, Kemal; Gulhan, TimurBu çalışmada, Van ve yöresindeki çeşitli işletmelerde yetiştirilen toplam 650 sağmal inekten alınan 2550 süt numunesi, California Mastitis Test (CMT) ile subklinik mastitis yönünden incelendi. CMT pozitif bulunan 200 süt örneğinden yapılan bakteriyolojik incelemelerde, süt numunelerinin 162 (%81)'sinde mikroorganizma izole edilirken, 38 (%19)'inde ise mikroorganizma izole edilemedi. İzole edilen toplam 256 mikroorganizmadan 105 (%41) 'i Stafılokok, 92 (%35,9) 'si Streptokok ve 59 (%23,1) 'u diğer mikroorganizmalar olarak identifiye edildi. İzole edilen Stafilokoklardan 65 (%23.39) 'i koagulaz pozitif Staphylococcus aureus, 9 (%3.51)'u Staphylococcus haemolyticus 8 (%3.12)'i koagulaz pozitif Staphylococcus intermedius, ve 8 (%3.12) 'i ayrı ayrı Staphylococcus warnei ve Staphylococcus saprophyticus, 7 (%2.73)'si Staphylococcus epidermidis olarak identifiye edildi. İzole edilen Streptokoklardan ise, 17 (%6.64) 'si grup C, 15 (%5.85) 'i grup B (Streptococcus agalactiae), 2 (%0.78) 'si grup F, 1 (%0.39J 'i grup D olarak serogruplandırılırken 57 (%22.26) 'si serogruplandırılamadı. İzole edilen diğer mikroorganizmalar ise sırasıyla; 21 (%8.2) 'i Stomatococcus, 18 (%7.03) 'i E. coli, 9 (%3.51) 'u Corynebacterium pyogenes, 6 (%2.34)'sı Bacillus spp., 1 (%0.39)'er adet Brucella spp., Proteus spp., Micrococcus spp. ve 2 (%0.78)'si de Maya olarak identifiye edildi.Article Van Yöresinde Sağlıklı Görülen Süt Sığırcılığı İşletmelerinde Rotavirus, Esherichia Coli K 99 ve 0157:h7'nin Varlığı Üzerine Araştırmalar(2001) Boynukara, Banur; Gulhan, Timur; Ekin, İ. Hakkı; Çabalar, MehmetA survey was conducted to determine the prevalence of rotavirus, Escherichia coli K99 and O157:H7 in healthy dairy cattle herds in Van and environs, Turkey. Some of the cattle herds had a history of recurrent neonatal diarrhoea for previous years, and even while sampling was being done, some newborn calves were diarrhoeic. Three hundred and twelve faecal specimens from dairy cattle farms free of clinically apparent diarrhoea were tested both for the presence of rotaviruses by PAGE silver staining and for Escherichia coli K99 and O157:H7 by latex agglutination using specific antisera after the growth of each colony. The enteropathogenic characteristic of K99 and O157:H7 isolates was determined by rabbit ileal loop test. No rotavirus was detected from clinically normal cows, heifers or calves. Only 1 of 9 diarrhoeic calves was found to be positive for rotavirus. Out of the 235 E. coli isolates from non-diarrhoeic animals, 28 were positive for K99 and 4 for O157:H7. While 14 of 28 K99 isolates were found to be positive for enteropathogenic Escherichia coli (EPEC), 2 of 4 O157:H7 isolates were also positive for EPEC. An in vitro antibiotic sensitivity test of K99 and O157:H7 isolates indicated that the most sensitive antibiotics were enrofloxacin and danofloxacin.Article Virulence Factors of Enterococcus Faecium and Enterococcus Faecalis Strains Isolated From Humans and Pets(Tubitak Scientific & Technological Research Council Turkey, 2006) Gulhan, Timur; Aksakal, Abdulbaki; Ekin, Ismail Hakki; Savasan, Serap; Boynukara, BanurThe virulence factors of 146 Enterococcus faecium and 32 Enterococcus faecalis strains isolated from faecal samples of humans, dogs, and cats were investigated. In total, 178 strains were examined by gelatinase (GeIE), aggregation substance (AS), cytolysin, and slide haemagglutination tests. The results of detected virulence factors of E. faecium and E. faecalis strains were: GeIE: 17.1% vs. 37.5%; AS: 13% vs. 12.5%; cytolysin: 7.5% vs. 12.5%; haemagglutination activities with rabbit erythrocytes: 9.6% vs. 9.4%; haemagglutination activities with human erythrocytes: 17.1 % vs. 21.9%, respectively.Article Yaban Kuşlarında İnfluenza A Virüsleri(2009) Durmuş, Atilla; Adızel, Özdemir; Boynukara, Banur; İlhan, Ziya; Aksakal, AbdülbakiAvian influenza virüsleri insan, domuz, at, vizon, kedi, su memelileri ve evcil kanatlıların çoğunun içinde olduğu birçok türden izole edilmiştir. Özellikle ördek, kaz ve kuğu gibi su kuşları başta olmak üzere diğer bazı yabani kanatlılar, gerek yüksek patojen avian influenza (HPAI) ve gerekse düşük patojen avian influenza (LPAI) virüslerinin endemik taşıyıcılarıdır. Çok sayıda araştırıcı, Anseriformes takımında bulunan Anatidae familyası ile Charadriiformes takımında bulunan yabani kuşların, influenza A virüslerinin doğal konakçıları olduğunu belirtmektedir. Bu çalışmada, yaban kuşlarında influenza A virüs infeksiyonlarına ait yazılı kaynaklardan derlenen bilgiler sunulmuştur.