Browsing by Author "Demir, Murat"

Now showing 1 - 20 of 31

46 Xx Testiküler Bozukluk Sendromu Olgusu
(2019) Eryılmaz, Recep; Demir, Murat; Aslan, Rahmi
‘’46 XX testiküler bozukluk’’ hastalığı genotip olarak 46 XX olup fenotip olarak erkekolan hastaları tanımlamaktadır. Bu hastalardanormal genital yapıdan ambiguus genitalyayakadar uzanan genital yapı farklılığı ile kendinigösterebilir. Bu olgumuzda infertilite nedeniyle tarafımıza başvuran 46 XX testiküler bozukluk sendromu olgusunu sunmayı amaçladık.
Acute Segmental Testicular Infarction Caused by Covid-19 Disease: a Case Report and Current Literature Review
(Galenos Yayincilik, 2022) Demir, Murat; Dundar, Ilyas
Coronavirus disease-2019 (COVID-19) is known to cause sepsis-associated hypercoagulopathy. Thromboembolic complications affecting many systems associated with COVID-19 disease have been described in the literature. The direct effect of this virus on male urogenital organs and possible testicular damage is still being evaluated. Follow-up studies in recovering male patients are necessary to investigate the possibility of testicular damage. In this article, we aimed to present a 30-year-old patient who presented with acute testicular pain and was diagnosed with testicular infarction due to COVID-19 with ultrasonography and contrast-enhanced magnetic resonance imaging findings.
Benign ve Malign Böbrek Kitlelerinin Enflamasyon Markerlarıyla Ayrımı
(2021) Taken, Kerem; Ertaş, Kasım; Aslan, Rahmi; Eryılmaz, Recep; Demir, Murat
Amaç: Görüntüleme yöntemlerindeki son gelişmelere rağmen, böbrek kitlelerinin patolojisini tahmin etmede hala %10-20 oranı yetersizdir. Bu nedenle, hematolojik enflamatuvar belirteçlerin patoloji sonucunu tahmin etmede yararlı olup olmadığını incelemeyi amaçladık. Yöntem: Ocak 2010 ile Ekim 2020 tarihleri arasında böbrek kitlesi nedeniyle opere edilen 116 hasta çalışmaya dahil edildi. Retrospektif olarak preoperatif trombosit, nötrofiller, lenfosit sayıları ve oranları patoloji sonuçları ile karşılaştırıldı. Bulgular: Çalışmaya alınan 116 hastanın yaş ortalaması 55,36±13,93 yıl idi. Yirmi altı (%22,4) hastanın patoloji sonuçları benign iken 90’ı (%77,6) malign idi. Nötrofil sayısı ve nötrofil lenfosit oranı benign grupta anlamlı olarak daha düşüktü. Renal hücreli karsinomlu hastalarda yüksek Fuhrman derecelerinde trombosit sayısı ve trombosit lenfosit oranı daha yüksek iken lenfosit sayısı ise daha düşüktü. Sonuç: Hematolojik enflamatuvar belirteçler, ameliyattan öncesi böbrek kitlelerinin patoloji sonucunu tahmin etmede yararlıdır
Comparison of Smp and Eswl Technique in Renal Stones Between 10-20 Mm in Children
(2022) Sevim, Mehmet; Demir, Murat
Giriş ve Amaç: Üriner sistem taş hastalığı bilinen eski hastalıklardan birisidir. Türkiye taş hastalığı konusunda endemik bir bölge olarak kabul edilmektedir. Biz bu çalışmada, çocuklarda 10-20 mm arası böbrek taşları tedavisinde kullanılabilen ESWL ve SMP (Süper Mini-Perkütan Nefrolitotomi) yöntemlerinin etkinlik ve güvenirliğini retrospektif olarak değerlendirmeyi amaçladık. Materyal ve Metod: Bu çalışmaya Van Yüzüncü Yıl Üniversitesi İlaç Dışı Klinik Uygulamalar Etik Kurulu tarafından izin varildi (Tarih: 10/09/2021 Karar No: 2021/10-01). Çalışmaya etik kurul izni aldıktan sonra Van YYÜ Dursun Odabaş Tıp Merkezi Üroloji Anabilim dalı tarafından Ocak 2017-Haziran 2021 tarihleri arasında 10-20 mm arası böbrek taşlarına Süper Mini-PNL ve ESWL yapılan hastaların verilerinin istatistiksel analizi planlandı. Araştırmaya 77 Süper Mini-PNL ve 82 ESWL yapılan hastaların verilerinin karşılaştırılması amaçlandı. Tedavi ile ilgili tüm parametreler (taşsızlık oranları, seans sayısı, tedavi süresi, hastanede yatış, kalıntı fragmanların varlığı, komplikasyonlar ve ek müdahale ihtiyacı) not edildi ve iki grup karşılaştırmalı olarak değerlendirildi. Bulgular: Bu çalışma retrospektif olarak incelenmiş olup dışlanma kriterleri sonrası ESWL grubunda 82 SMP grubunda ise 77 olmak üzere toplam 159 hasta çalışmaya dahil edildi. Hastalar 1-17 yaşları arasındaydı. Hastaların 91'ü (%57.2) erkek ve 68'si (%42.8) kadın idi. ESWL yapılan 82 hastanın, 47'si (%57.3) erkek, 35'si (%42.7) kadındı. PNL yapılan 77 hastanın, 44'si (%57.1) erkek, 33'ü (%42.9) kadındı. Gruplar arasındaki cinsiyet farklılığı karşılaştırıldığında anlamlı farklılık görülmedi (p= 0,87). ESWL yapılan grupta ortalama yaş 6,72±3,71, SMP grubunda ortalama yaş 6,63±3,59(1-17) olarak hesaplandı. Gruplar arasında yaş dağılımı açısından istatistiksel olarak anlamlı farklılık yoktu (p=0,87). ESWL grubunun VKİ'sinin ortalama değeri 20.10±2,01 olarak hesaplanırken, SMP grubunda 20.23±2,05 olarak hesaplandı. ESWL ve PNL grubu karşılaştırıldığında VKİ açısından iki grup arasında istatistiksel olarak farklılık saptanmadı (p=0.68). Süper Mini-PNL yapılan grupta taşa uygulanan işlem yönüne bakıldığında, 42 hastada sağ (%54.54), 35 hastada (%45.46) sol tarafa işlem uygulandı. ESWL yapılan grupta ise 38 hastada (%46,35) sağ, 44 hastada (%53,65) sol tarafa işlem uygulandı. Gruplar arasında taraf yönü açısından istatistiksel olarak anlamlı farklılık saptanmadı (p>0.05). ESWL grubunun taş boyutu ortalama mm cinsinden 13.74±1,91(10-20mm), daha doğru sonuç verebilecek mm² cinsinden ise 149,75±45,46 olarak hesaplanırken, SMP grubunun ise ortalama değeri 14.064±2,6(10-20mm), mm² cinsinden ise 150,879±50,34 olarak hesaplandı. Gruplar arasında taş ortalaması açısından istatistiksel olarak anlamlı farklılık saptanmadı (p=(mm)=0,37 p=(mm² )=0.88). PNL ve ESWL grubunun taş lokalizayon dağılımı çoğunlukla pelviste mevcut olup gruplar arasında istatistiksel olarak fark izlenmedi (p>0,05). Eritrosit süspansiyonu replesmanına ESWL grubunda ihtiyaç duyulmazken, SMP grubundan 2 hastaya (5cc/kg) ihtiyaç duyuldu (p>0,005). SMP'nin erken dönem taşsızlık oranı %88,3 iken geç dönem taşsızlık oranı %91 olarak bulundu. ESWL grubunda ise erken dönem taşsızlık oranı %61 iken geç dönem taşsızlık oranı %70,73 olarak bulundu. SMP ve ESWL grubunun taşsızlık oranının kıyaslamasında hem erken hem de geç dönemde istatistiksel olarak anlamlı fark izlendi. SMP ve ESWL kendi grupları içinde erken ve geç dönemleri kıyaslandığında istatistiksel olarak fark izlenmedi (Pnl kısa-uzun dönem p>0,005 ESWL kısa-uzun dönem p>0,005). SMP ve ESWL grubundaki Clavien verileri karşılaştırıldığında istatistiksel olarak farklılık izlenmedi (P>0,005). SMP grubunda ortalama yatış 60,0125±12,6 saat bulunurken, ESWL grubu ortalama işlem süresi 40 dk+4 saat takip sonrası taburcu edildi. ESWL grubunda sadece 1 hastada solunum arresti geliştiği için 24 saat takip edildi. SMP ort ameliyat süresi 55,18±21,5 dk bulunurken, ESWL işlem süresi tek seans ortalama 40 dk sürmektedir. Sonuç: ESWL güvenli ve non-invaziv doğası ile pediatrik böbrek taşlarının çoğunda halen tercih edilen ilk tedavi yöntemi olmasına rağmen, SMP modalitesi ile tek seansta elde edilen yüksek taşsızlık oranları ve düşük komplikasyon oranları ile 10-20 mm arası böbrek taşı olan çocuk hasta popülasyonunda güvenli ve etkili bir tedavi alternatifi olarak uygulanabilir.
Covid-19 Diagnosis on Ct Images With Bayes Optimization-Based Deep Neural Networks and Machine Learning Algorithms
(Springer London Ltd, 2022) Canayaz, Murat; Sehribanoglu, Sanem; Ozdag, Recep; Demir, Murat
Early diagnosis of COVID-19, the new coronavirus disease, is considered important for the treatment and control of this disease. The diagnosis of COVID-19 is based on two basic approaches of laboratory and chest radiography, and there has been a significant increase in studies performed in recent months by using chest computed tomography (CT) scans and artificial intelligence techniques. Classification of patient CT scans results in a serious loss of radiology professionals' valuable time. Considering the rapid increase in COVID-19 infections, in order to automate the analysis of CT scans and minimize this loss of time, in this paper a new method is proposed using BO (BO)-based MobilNetv2, ResNet-50 models, SVM and kNN machine learning algorithms. In this method, an accuracy of 99.37% was achieved with an average precision of 99.38%, 99.36% recall and 99.37% F-score on datasets containing COVID and non-COVID classes. When we examine the performance results of the proposed method, it is predicted that it can be used as a decision support mechanism with high classification success for the diagnosis of COVID-19 with CT scans.
Current Si̇tuati̇on Analysi̇s of Beykoz Monument Trees
(2021) Demir, Murat; Alp, Şevket
Doğal ve kültürel mirasın bir öğesi olan anıt ağaçlar; yaşam sürecinde, temsil ettikleri tür ve bulundukları yetişme ortamının özelliklerine göre, büyüyüp gelişen, zaman içinde farklı yaş ve boyutlara ulaşarak, alışılmışın ötesinde uzun süre yaşayarak, kültürümüzde ve tarihimizde özel yeri bulunan, geçmiş, günümüz ve gelecek arasında iletişim sağlayabilecek uzunlukta doğal ömre sahip ağaçlar 'anıt ağaç' niteliği kazananlardır. Anıt ağaçlar, bilimsel olduğu kadar, manevi özellikleri açısından da değerlidirler. İstanbul ili Beykoz ilçesinde, geçmişten gelen heybetleri ve hikâyeleri ile dikkat çeken anıtlaşmış anıt ağacı bulunmaktadır. Çalışmada belediye tarafından kayıt altına alınan ağaçların mevcut durumu incelendikten sonra bu ağaçların bölgedeki kentlinin belleğindeki yeri belirlenmiştir. Sahip oldukları farklı boyutları ve görkemi ile kişiyi psikolojik olarak etkileyen bu ağaçlar zaman zaman etrafına neden oldukları tehlikelerden dolayı kesilerek tahrip edilmekte veya yanlış kullanım ve bakım nedeniyle kurumaktadırlar.Kent belleğinde yeri belirlenen anıt ağaçların mevcut durumuna yönelik koruma politikaları önerirmiştir. Yaprak ve toprak örneği alınarak eksik makro ve mikro elementler belirlenmiştir. Bu çalışma genetik materyal olduğu kadar kültürel bir materyal olan bölgenin anıtlaşmış ağaçlarına sahip çıkmak, korumak ve gelecek nesillere aktarmak doğa sevgisinin, çevre bilincinin oluşmasına hizmet edecektir
The Diagnostic Value of Ischemia-Modified Albumin in Prostate Cancer
(Galenos Yayincilik, 2020) Aslan, Rahmi; Eryilmaz, Recep; Sevim, Mehmet; Demir, Murat; Taken, Kerem
Aim: The aim of this study was to investigate whether serum ischemia-modified albumin (IMA) levels have a diagnostic value in prostate cancer (Pca). Methods: Thirty primary Pca patients and 30 age-matched healthy male subjects were included in this prospective case-control study. The patients were selected from the urology clinic of a tertiary university hospital. Healthy men included in the control group were selected from hospital staff and patient relatives. Patients with severe chronic diseases and other malignancies were excluded. Serum IMA level was measured using the colorimetric method. The results were reported in absorbance unit (ABSU). Results: Serum IMA levels were significantly higher in the study group when compared to the control group (0.843 +/- 0.76 and 0.443 +/- 0.49 ABSU, respectively; p=0.002). The mean IMA value in patients with a Gleason score >= 7 (1.08 +/- 0.053 ABSU) was significantly higher than in patients with Gleason score <= 6 (IMA 0.418 +/- 0.64 ABSU). According to the receiving operating characteristic (ROC) analysis, when the cut-off value was ABSU=0.57, the sensitivity and specificity were 80% and 56.7%, respectively. Conclusion: Serum concentrations of IMA are significantly elevated especially in clinically significant Pca patients. Its high sensitivity (80%) in ROC analysis suggests that IMA can be used an ancillary biomarker in diagnosis.
Does Tamsulosin Use Before Ureteroscopy Increase the Success of the Operation
(Coll Physicians & Surgeons Pakistan, 2022) Demir, Murat; Ertas, Kasim; Aslan, Rahmi; Eryilmaz, Recep; Sevim, Mehmet; Taken, Kerem
Objective: To investigate the effect of preoperative tamsulosin use on the success and complications rates of ureteroscopy for ureteral stone removal. Study Design: A randomised clinical trial. Place and Duration of Study: Department of Urology, Dursun Odabas Medical Center, Van Yuzuncu Yil University, Turkey, from December 2020 to June 2021. Methodology: Patients were scheduled for ureteroscopy due to ureteral stones, and were randomly divided into two groups; 67 patients preoperatively were given 0.4 mg tamsulosin for 7 days and 70 patients were not given tamsulosin. Each patient's intraoperative surgical complications, preoperative and postoperative pain, postoperative fever, need for analgesia, stone-free rate, and double J ureteral stent (DJ) insertion rates were recorded and evaluated. Results: A total of 137 patients, 103 (75.1%) males, and 34 (24.8%) females, were included. In 70 (51.1%) of these patients, the stone was on the right side, while in 67 (48.9%) the stone was on the left side. The stone was in the distal ureter in 47 (34.3%) patients, in the middle in 38 (27.7%) patients, and the proximal in 52 (37.9%) patients. The patients who were given tamsulosin had lower preoperative visual analog scale (p=0.02), operation time (p=0.003), post-ureteroscopic lesion scale (p=0.01), postoperative 24th-hour visual analog scale (p=0.03), fever (p=0.02), and analgesic need (p=0.04), while their rate of accessing the stone (p=0.02); and their stone-free rates (p=0.02) was higher. Conclusion: Preoperative tamsulosin use increases the success of the operation and reduces complications.
Effect of Combined Use of Tolterodine and Continuous Positive Airway Pressure Vs Continuous Positive Airway Pressure Only Treatment on Overactive Bladder Symptoms in Women With Moderate-To Obstructive Sleep Apnea Syndrome: a Randomized Clinical Trial
(Springer London Ltd, 2022) Ertas, Kasim; Yildiz, Hanifi; Demir, Murat; Aslan, Rahmi; Eryilmaz, Recep; Kirmizitoprak, Sevder; Taken, Kerem
Introduction and hypothesis Obstructive sleep apnea syndrome is associated with urological symptoms, including overactive bladder (OAB). This study aims to determine whether combined tolterodine and CPAP therapies are more effective for patients with OSAS than CPAP treatment only. Methods Women who underwent polysomnography test and were diagnosed with moderate-to-severe OSAS with apnea-hypopnea index (AHI) were included in the study. Data were collected on AHI, OAB awareness-8-item tool (OAB-V8), incontinence questionnaire-urinary incontinence short form (ICIQ-UI-SF), total daily urine volume (DUV), and the Benefit, satisfaction with treatment and willingness (BSW) tool. Eligible patients were randomized to receive either CPAP treatment only or combined CPAP and tolterodine treatment for 3 months. Results Among 103 participants, a total of 60 were included. Patients in both treatment arms showed significant improvements in OAB-V8, ICIQ-UI-SF, and total DUV compared to their baseline. The mean OAB-V8 was 15.7 at baseline and 5.6 at 3 months for the combined treatment arm and 16.6 and 7.6 at 3 months for the CPAP group only (mean baseline-adjusted between-group difference -1.1 [95% CI, -12.3 to -7.4]; p < 0.001). The improvement in the mean ICIQ-UI-SF was also statistically more significant in the combined therapy group than in the CPAP only arm (mean baseline-adjusted between-group difference -3.27 [95% CI, -4.6 to -1.59]; p < 0.001). No statistical significance was found in the improvement of total DUV between the groups. Conclusions In this study, combined use of tolterodine with CPAP provides beneficial effects to CPAP treatment only regarding OAB symptoms. Further research is required to confirm these findings in a large cohort.
Enürezis Nokturnalı Çocuklarda Başvuru Yaşını Etkileyen Faktörler: Türkiye’nin Doğusundan Multisentrik Çalışma
(2021) Avci, Veli; Demir, Murat
Amaç: Çocukluk çağında sık görülen enürezis nokturna tedavi edilmez ise önemli psikososyal sorunlara neden olabilir. Bu çalışmada enürezis nokturnalı çocukların polikliniğe başvuru yaşını etkileyen faktörlerin incelenmesi amaçlandı. Materyal ve Metot: Çalışmaya beş ayrı merkezden hastalar dahil edildi. Hastaların yaşı, cinsiyeti, aile yapısı, yaşadıkları yer, annenin mesleki durumu, ebeveynlerin eğitim düzeyi ve gelir durumları hastane kayıtlarından ve telefonla ailelere ulaşılarak öğrenildi. Bulgular: Çalışmaya dahil edilen 162 hastanın ortalama yaşı 9,41±3,24 yıl olup, 94’ü erkekti. Ebeveynlerinin eğitim düzeyi ve gelir düzeyi arttıkça hastaların polikliniğe başvuru yaşının anlamlı bir şekilde azaldığı tespit edildi. Ayrıca kentsel bölgede yaşayan hastaların kırsala nazaran daha erken dönemde hastaneye başvurdukları görüldü. Sonuç: Ebeveynlerin eğitim düzeyi, yerleşim yeri ve gelir düzeyi gibi faktörler enürezis nokturnalı hastaların polikliniğe başvuru zamanı açısından önemlidir.
Fournier's Gangrene: Causes, Presentation and Survival of Sixty-Five Patients
(Professional Medical Publications, 2016) Taken, Kerem; Oncu, Mehmet Resit; Ergun, Muslum; Eryilmaz, Recep; Demir, Canser Yilmaz; Demir, Murat; Gunes, Mustafa
Objective: To report our experience with Fournier's Gangrene (FG) over the past eight years and evaluate the predisposing factors which affect the mortality. Methods: Sixty-five patients who were admitted to emergency surgical unit of our institution presenting with FG between January 2006 and August 2014 were included. The anatomical site of infective gangrene, predisposing factors, etiological factors, and outcomes were retrospectively reviewed. Results: Our cases included 8 women and 57 men. The average age of men was 51 +/- 13.9 (range 19-75) and the average age of women was 63 +/- 10.5 (range 52-76). Average hospitalization time was 9.2 +/- 6.6 days (range 5-25) days. The most frequent comorbid disease was diabetes mellitus and the most frequent etiology was perianal abscess. Colostomy was performed in 11 patients, orchidectomy in two patients, cystostomy in two patients. Notably, all of the 8 (12.3%) patients who died from FG had diabetes and low socioeconomic status. A total of six patients who died required more than one surgical debridement. Conclusions: Fournier's gangrene is a severe surgical emergency, with a high mortality rate. Low socioeconomic status, diabetes and more than one debridement play a major role in mortality and morbidity.
An Innovative Approach To Lifelong Delayed Ejaculation: Does Attachment Style Play a Role
(Springer, 2022) Demir, Murat; Isik, Mesut; Araz, Seyhmuz; Ozveren, Huseyin; Kirli, Umut; Ertas, Kasim
Purpose To examine whether there is a correlation between attachment styles, which is a developmental psychology theory, and lifelong DE. Methods The research was planned as prospective, multi-centric and cross-sectional study. Thirty patients who were consecutively admitted to the urology outpatient clinic and diagnosed with lifelong DE and 30 age-matched healthy controls were included in the study. All participants gave a detailed medical history and underwent a complete physical examination, and their laboratory and endocrine (prolactin and testosterone) results were evaluated. Additionally, all patients had to fill out socio-demographic information form, the Experiences in Close Relationships-Revised (ECR-R) Questionnaire, Arizona Sexual Experiences Scale (ASEX), Beck Anxiety Inventory (BAI), and Beck Depression Inventory (BDI). Results The mean age of the DE patients was 33.5 +/- 7.5 years. In the DE group, insecure attachment (both anxious and avoidant attachment), anxiety and depression scores were found to be significantly higher (p < 0.001, effect size medium or large) than the control group. Ejaculation times (both for vaginal intercourse and masturbation) were correlated with both insecure (anxious and avoidant) attachment types, as well as their anxiety and depression scores (p < 0.001). The ASEX satisfaction, ejaculation and total scores were found to be higher in DE patients (higher scores indicating greater sexual dysfunction) than in the control group. Conclusion The large and significant relationships found between lifelong DE and attachment insecurities point to childhood developmental processes. The findings may help us better understand lifelong DE. There is a need for further extensive research on this subject.
Küresel Bir Sorun Olarak Kadın Sünneti Üzerine Youtube Videolarının Bir Analizi
(2022) Demir, Murat; Avci, Veli
Amaç: Kadın sünneti, tüm dünyada yaygın olarak uygulanan, tıbbi olmayan nedenlerle kadın genital organının çıkarılmasıdır. Kadın sünneti genellikle kapalı toplumlarda uygulandığından bilim dünyası için karanlık bir konudur. Bu çalışmada kadın sünnetinin önlenmesinde YouTube videolarının rolünü değerlendirmeyi amaçladık.Gereç ve Yöntemler: Bu kesitsel çalışmada YouTube.com web sayfasında 1 Mayıs 2021 tarihinde “female genital mutilation” ve “female circumcision” anahtar kelimeleri kullanılarak net önbellek ve son güncellemeler içeren bir web tarayıcısında internet araması yapılmıştır. Arama sonuçları, yükleyicilerin demografik özellikleri, videoların kalitesi ve güvenilirliği açısından değerlendirildi.Bulgular: Videoların çoğu kadınlar tarafından paylaşıldı. Kadınların ve sağlık çalışanlarının paylaştığı videolar, erkekler ve din görevlileri tarafından yüklenen videolara göre daha kaliteli ve daha güvenilirdi.Sonuç: YouTube.com videoları kadın sünnetinin önlenmesi için faydalı olabilir ancak özellikle sağlık çalışanları tarafından bu konuya daha fazla dikkat edilmeli ve daha güvenilir ve daha kaliteli videolar paylaşılmalıdır.
Mesane Kanseri Hastalarında de Ritis Oranının Önemi
(2020) Demir, Murat; Aslan, Rahmi; Taken, Kerem; Eryılmaz, Recep; Ertaş, Kasım
Amaç:Çoksayıdaçalışmadabelirtildiğiüzere,serumaspartattransaminaz/alanin transaminaz (AST/ALT) oranı (De Ritis Oranı) ile kanser olguları arasında ilişki bulunmaktadır. Ancak araştırmacıların elde ettikleri sonuçlar tartışmalıdır ve çoğu bilimsel makalede farklı sonuçlar bulunmaktadır. Ürotelyal karsinoma hastalarında De Ritis oranının arttığını gösterenaraştırmalarmevcuttur.Buçalışmadadiğeraraştırmalarlabenzer bir biçimde De Ritis oranı ile mesane kanseri arasındaki ilişki araştırılmıştır. Yöntem: Bu çalışma hastanemizin 20/07/2018 tarihli ve 2018/12 belge no’luetikkuruluonayımüsaadesincegerçekleştirilmiştir.Çalışmayamesane kanserinden ameliyat edilen 172 hasta ve 68 sağlıklı bireyden oluşan kontrol grubu dahil edilmiştir. Bu hastaların AST/ALT değerleri ile tümör evreleri, patolojileri arasında bir ilişki olup olmadığı değerlendirilmiş, ayrıca De Ritis oranının sağlıklı ve hasta bireyler arasında farklılık gösterip göstermediği retrospektif olarak araştırılmıştır.Bulgular: Yüz yetmiş iki hasta ve 68 kontrol grubu olmak üzere toplamda 240 kişinin değerlendirildiği bu çalışmada, AST/ALT oranı ile tümör evresi, tümör patolojisi, ultrason bulguları, tümör boyutu arasında herhangi bir istatistiksel anlamlılık gözlenmemiş, buna karşın kontrol grubu ile mesane kanseri hastaları arasında AST/ALT oranı bakımından istatistiksel olarak farklılık gözlenmiştir. Mesane kanseri hastalarında De Ritis oranı (AST/ALT) kontrol grubuna göre yüksek bulunmuştur (ortalama: 1,18/0,91). Sonuç: Bu çalışmanın bulgularına göre, mesane tümörü hastalarında AST/ALT oranı kontrol grubu ile karşılaştırıldığında farklılık göstermektedir. Bu nedenle, De Ritis oranının bu hastaların değerlendirilmesind
A Meta-Heuristic Algorithm-Based Feature Selection Approach To Improve Prediction Success for Salmonella Occurrence in Agricultural Waters
(Ankara Univ, Fac Agriculture, 2024) Demir, Murat; Canayaz, Murat; Topalcengiz, Zeynal
The presence of Salmonella in agricultural waters may be a source of produce contamination. Recently, the performances of various algorithms have been tested for the prediction of indicator bacteria population and pathogen occurrence in agricultural water sources. The purpose of this study was to evaluate the performance of meta -heuristic optimization algorithms for feature selection to increase the Salmonella occurrence prediction success of commonly used algorithms in agricultural waters. Previously collected datasets from six agricultural ponds in Central Florida included the population of indicator microorganisms, physicochemical water attributes, and weather station measurements. Salmonella presence was also reported with PCR-confirmed method in data set. Features were selected by using binary meta -heuristic optimization methods including differential evolution optimization (DEO), grey wolf optimization (GWO), Harris hawks optimization (HHO) and particle swarm optimization (PSO). Each meta -heuristic method was run 100 times for the extraction of features before classification analysis. Selected features after optimization were used in the K -nearest neighbor algorithm (kNN), support vector machine (SVM) and decision tree (DT) classification methods. Microbiological indicators were ranked as the first or second features by all optimization algorithms. Generic Escherichia coli was selected as the first feature 81 and 91 times out of 100 using GWO and DEO, respectively. The meta -heuristic optimization algorithms for the feature selection process followed by machine learning classification methods yielded a prediction accuracy between 93.57 and 95.55%. Meta -heuristic optimization algorithms had a positive effect on improving Salmonella prediction success in agricultural waters despite spatio-temporal variations. This study indicates that the development of computer -based tools with improved meta -heuristic optimization algorithms can help growers to assess risk of Salmonella occurrence in specific agricultural water sources with the increased prediction success.
Ortalama ve Maksimum Üreter Duvar Kalınlığı Üreteroskopi Sonuçları için Öngörücüfaktör Müdür
(2022) Durmaz, Fatma; Ertaş, Kasım; Aslan, Rahmi; Taken, Kerem; Demir, Murat; Dündar, İlyas; Sevim, Mehmet
Amaç: Çalışmamızın amacı operasyon öncesi bilgisayarlı tomografi ile ölçülen ortalama ve maksimum üreter duvar kalınlıklarının üreteroskopi sonuçları üzerindeki etkisini araştırmaktır.Materyal ve Metot: Bu prospektif çalışma Temmuz-Aralık 2021 tarihleri arasında üreter taşı nedeniyle üreteroskopi yapılan 103 hasta ile yapılmıştır. Kontrastsız bilgisayarlı tomografi ile üreter taşının olduğu bölgedeki maksimum üreter duvar kalınlığı ve 3-6-9-12 hizalarından ölçülen üreter duvar kalınlıkları ortalaması alındı. Ortalama üreter duvar kalınlığı ve maksimum duvar kalınlığına göre operasyon süresi, rezidü taş ve double j takılma durumu ve intraoperative komplikasyon durumu incelendi.Bulgular: Çalışmaya dahil edilen 103 hastanın 77’si erkek, 26’sı kadındı. Hastaların yaş ortalaması 43,83±15,11 yıl idi. Ortalama taş uzunluğu 10,76±3,84 mm idi. Maksimum üreter duvar kalınlığı 4,9±1,8 mm iken ortalama üreter duvar kalınlığı 3,81±1,24 mm idi. Maksimum ve ortalama üreter duvar kalınlığı artıkça operasyon süresi, rezidü taş ve double takılma oranı, post üreteroskopik lezyon skala derecesinin arttığı görüldü (p<0,05).Sonuç: Maksimum ve ortalama üreter duvar kalınlıkları üreteroskopi sonuçlarını öngörmede prediktif faktörlerdir.
Oxidative Dna Damage To Sperm Cells and Peripheral Blood Leukocytes in Infertile Men
(int Scientific Literature, inc, 2016) Taken, Kerem; Alp, Hamit Hakan; Eryilmaz, Recep; Donmez, Muhammet Irfan; Demir, Murat; Gunes, Mustafa; Sekeroglu, Mehmet Ramazan
Background: Oxidative DNA damage is associated with male infertility. The aim of this study was to evaluate the oxidative DNA damage of sperm cells and blood leukocytes and to determine the levels of MDA and NO levels in seminal and blood plasma of idiopathic infertile men. Material/Methods: The study enrolled 52 patients, including 30 infertile and 22 fertile men. MDA, NO, and 8-OHdG/10(6)dG were estimated using spectrophotometry and high-pressure liquid chromatography ( HPLC)-based methods in seminal and blood plasma. The association with the sperm parameters was assessed, particularly sperm counts and motility. Results: The mean sperm concentration and sperm motility of the fertile men were significantly higher than that of the infertile men. The mean MDA and NO concentration in the seminal and blood samples of the infertile men were higher than that of fertile men. Also, the mean numbers of sperm cells and leukocytes 8-OHdG/10(6)dG of the infertile men were significantly higher than that of fertile men (p=0.04 and p<0.001, respectively). Sperm motility and sperm count were negatively correlated with leukocyte and sperm cell 8-OHdG/10(6)dG ratio. However, progressive motility was significantly negatively correlated with sperm cell and leukocyte 8-OHdG/10(6)dG ratio (R=-0.357, p=0.026; R=-0.388, p=0.024, respectively). Conclusions: Oxidative stress is an important factor in male infertility. Therefore, biochemical detection of 8-OHdG/10(6)dG in sperm cells and blood leukocytes may be an additional tool in the diagnosis of male infertility.
Oxidative Stress Has a Negative Effect on the Development and Progression of Bladder Cancer
(Kare Publ, 2022) Demir, Murat; Demir, Canan
OBJECTIVE In this study, we aimed to investigate the oxidant-antioxidant capacity in bladder cancer according to invasion and degree. METHODS Forty-six patients with bladder cancer and 50 healthy volunteers were included in the study. After 12 h of fasting, 4cc of blood venous blood was taken from these patients. Then, after centrifugation at 5000 rpms for 10 min, the serum portion of the study was completed. The activities of arylesterase (ARE), paraoxanase-1 (PON-1), glutathione reductase (GR), glutathione-S transferase, and protein carbonyl (PC) in serum were measured spectrophotometrically. RESULTS Antioxidant parameters in the serum of patients with bladder tumors were found lower than control group (p=0.001). In addition, PC was found to be higher in the bladder cancer group than in the control group (p=0.001); on the other hand, ARE, PON-1, and GR levels were found to be lower in both high-grade tumors and invasive tumors (p <=.0.05). CONCLUSION Oxidative stress is effective in the development and progression of bladder tumors.
Prostat Biyopsisi Yapılan Hastalarda, Histopatolojik ve Klinik Özellikler ile Yaş Faktörü Arasındaki İlişki
(2020) Ertaş, Kasım; Sevim, Mehmet; Aslan, Rahmi; Eryılmaz, Recep; Taken, Kerem; Demir, Murat
Amaç: Prostat biyopsisi yapılan hastaların klinik ve histopatolojik verilerini karşılaştırarak yaş faktörü ile biyopsi sonuçları arasındaki ilişkiyi analiz etmeyi amaçladık.Gereç ve Yöntem: Kliniğimizde Ocak 2013-Şubat 2019 yılları arasında prostat kanseri ön tanısıyla prostat biyopsisi yapılan 1213 hastanın dosyası geriye dönük olarak incelendi. Toplam 309 hasta çalışmaya alındı. PSA>2.5 ng/dl ve/veya anormal parmakla rektal muayene bulguları olan hastalara biyopsi yapıldı. Grup 1’e 50 yaşından küçük (n=96) hastalar, grup-2’ye 70 yaşından büyük (n=213) hastalar alındı. Tüm hastaların klinik ve demografik verileri kaydedildi. Tüm hastalara 12 kor biyopsi protokolü uygulandı ve tek patolog tarafından incelendi. Daha önce prostat biyopsi öyküsü olan, dosyalarında yetersiz veri olan, bilinen üriner ya da genital malignensi, kanama diyatezi, aktif üriner sistem enfeksiyonu olan hastalar ile şiddetli ağrı ve benzeri nedenler ile işlemin erken sonlandırıldığı hastalar çalışma dışı bırakıldı.Bulgular: Ortalama PSA, prostat hacmi ve UPSS verileri Grup 1'de (<50 yaş hastalar) Grup 2'ye (>70 yaş arası) göre anlamlı olarak düşüktü. Ancak, Ortalama VAS skoru Grup 1'de Grup 2'den anlamlı olarak yüksekti. Biyopsi sonuçlarında Prostat kanseri tanısı alan hasta oranı Grup 2'de Grup 1'den anlamlı olarak yüksekti. Yine Gleason skoru ≤ 6 olan hasta sayısının Grup 1'de Grup 2'den anlamlı oranda yüksek olduğunu belirledik. Öte yandan, Grup 2'de Gleason skoru ≥7 olan hasta oranın Grup 1'den anlamlı derecede daha fazla olduğunu tespit ettik.Sonuç: Genç erişkin hastalarda görülen prostat kanserlerinin daha olumlu patolojik özelliklere (düşük gleason skoru) sahip olduğu görülmektedir. Bundan dolayı yaş faktörün bu hastalar için tedaviye karar verirken önemli bir parametre olduğunu düşünüyoruz.
Radiological Evidence of Testicular Damage in Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 Infection: a Sonoelastography's Potential Role
(Lippincott Williams & Wilkins, 2023) Dundar, Ilyas; Ozkacmaz, Sercan; Demir, Murat; Ozgokce, Mesut; Durmaz, Fatma; Ozkacmaz, Ayse; Goya, Cemil
This preliminary study aimed to evaluate the possible damage to the male reproductive system that the severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 virus causes by quantitatively measuring and comparing the tissue stiffness of the testis and epididymis with acoustic radiation force impulse sonoelastography in patients who have COVID-19 with a healthy control group. This prospective study was conducted between February and July 2021 with 65 cases. We used sonoelastography to evaluate male patients 18 years or older, who had applied to the urology clinic with nontesticular complaints, and were found to not have any underlying testicular pathology after a clinical-laboratory evaluation. The clinical-laboratory imaging findings and reverse transcription-polymerase chain reaction test results of all patients diagnosed with COVID-19 were reviewed from the hospital database. We measured the shear wave velocity values of the epididymis and the testes of 31 proven severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 patients and 34 healthy subjects and compared them with an independent t test. For the patient and control group subjects, the mean age was 37.55 & PLUSMN; 13.08 (23-71) and 40.5 & PLUSMN; 16.25 (18-81) years, respectively. The mean shear wave velocity values of the left-right and bilateral testes and epididymis of the patient group were statistically substantially higher (P < 0.05) than in the control group. In the receiver operating characteristic analysis, when the cutoff values for the bilateral testes and epididymis were determined as 1.39 and 1.64 m/s, respectively, the AUC was 77% to 73.4%, the sensitivity was 87% to 74%, and the specificity was 65% to 62%. Our findings show that testicular and epididymal tissue stiffness increased in patients with COVID-19. We recommend adding sonoelastography to urogenital examinations of male reproductive system in patients who are recovering from COVID-19.