Browsing by Author "Eren, Hasan"

Now showing 1 - 5 of 5

Aydın Yöresinde Sığırlarda ve Kenelerde Anaplasma / Ehrlichia Türlerinin Belirlenmesi
(2015) Eren, Hasan; Bılgıc, Huseyın Bılgın; Karagenç, Tülin; Hoşgör, Murat; Bakırcı, Serkan; Ünlü, Ahmet Hakan
Amaç: Bu çalışmada, sığır ve kenelerde Anaplasma/Ehrlichia türlerinin belirlenmesi ve bu türlerin örnekleme dönemlerindeki yaygınlığı hakkında bilgi edinilmesi amaçlanmıştır. Yöntem: Aydın'a bağlı Osmanbükü, Akçaova, Dalama ve Söke'den sığırlardan toplam 679 kan ve 186 kene örneği toplanmıştır. Toplanan örneklerde Anaplasma/Ehrlichia türlerini soy düzeyinde tespit eden polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) yapılmış, ayrıca A. marginale ile A. centrale türleri, tür spesifik PZR ve A. bovis ile A. phagocytophilum türleri ise nested PZR ile belirlenmiştir. Bulgular: Söke'de sadece Eylül, Dalama ve Akçaova'da ise Mart, Haziran, Eylül ve Aralık'ta A. centrale tespit edilmiştir. A. marginale Osmanbükü'nde sadece Haziran'da, Söke'de Aralık ve Mart, Akçaova'da Haziran, Eylül ve Mart, Dalama'da ise tüm örnekleme dönemlerinde belirlenmiştir. A. phagocytophilum ise tüm bölgelerde örnekleme yapılan bütün dönemlerde tespit edilmiştir. İncelenen örneklerde A. bovis'e rastlanmamıştır. Toplam 50 kan örneğinde miks enfeksiyona rastlanmıştır. Kene havuzlarında A. marginale ve A. phagocytophilum tespit edilmiştir.Sonuç: Bu çalışmada, A. phagocytophilum türünün A. marginale ve A. centrale'ye oranla daha yüksek olarak bulunduğu belirlenmiştir. A. phagocytophilum ile A. centrale en yoğun olarak Akçaova'da tespit edilirken, A. marginale Dalama'da en yoğun olarak tespit edilmiştir. Etkenler en yoğun Eylül ve Mart'ta tespit edilmiştir. Analizler kenelerin farklı Anaplasma/Ehrlichia türleri ile enfekte olduğunu göstermiştir
Prevalence of Tick-Borne Haemoparasites in Small Ruminants in Turkey and Diagnostic Sensitivity of Single-Pcr and Rlb
(Biomed Central Ltd, 2017) Bilgic, Huseyin Bilgin; Bakirci, Serkan; Kose, Onur; Unlu, Ahmet Hakan; Hacilarlioglu, Selin; Eren, Hasan; Karagenc, Tulin
Background: Tick-borne haemoparasitic diseases (TBHDs), caused by Theileria, Babesia, Anaplasma and Ehrlichia, are common in regions of the world where the distributions of host, pathogen and vector overlap. Many of these diseases threaten livestock production and some also represent a concern to human public health. The primary aim of this study was to determine the prevalence of the above-mentioned pathogens in a large number of blood samples (n = 1979) collected from sheep (n = 1727) and goats (n = 252) in Turkey. A secondary aim was to assess the diagnostic sensitivity of a number of species-specific polymerase chain reaction (PCR) tests and the reverse line blotting (RLB) assay. DNA samples were screened using species-specific PCR for the presence of Theileria ovis, Theileria sp. MK, T. lestoquardi, T. uilenbergi, T. luwenshuni, Babesia ovis, Anaplasma ovis and A. phagocytophilum while RLB was undertaken to test for the presence of all known Theileria, Babesia, Anaplasma and Ehrlichia species. The diagnostic sensitivity of these two approaches was then compared in terms of their ability to detect single species and mixed infections. Results: Overall, 84 and 74.43% of the small ruminants sampled were identified as hosting one or more pathogen(s) by species-specific PCR and RLB respectively. The presence of Theileria sp. OT1, T. luwenshuni and T. uilenbergi in Turkey was revealed for the first time while the presence of Babesia motasi, B. crassa and T. separata in Turkish small ruminants was confirmed using molecular methods. A high prevalence of mixed infection was evident, with PCR and RLB approaches indicating that 52.24 and 35.42% of animals were co-infected with multiple species, respectively. More than 80% of the mixed infections contained T. ovis and/or A. ovis. The RLB approach was found to be capable of detecting mixed infections with species such as Theileria sp. OT1, Theileria sp. OT3, T. separata, B. crassa and Babesia spp. Conclusion: The results indicated that pathogens causing TBHDs are highly prevalent in sheep and goats in Turkey. The diagnostic sensitivity of species-specific single PCR was generally higher than that of RLB. However, the latter approach was still capable of identifying a high proportion of individuals containing mixed-species infections. The use of species-specific single PCR is recommended to accurately estimate pathogen prevalence and to identify co-infected hosts.
Rekombinasyon Sonrası Theileria Annulata Popülasyonlarında Genetik Çeşitliliğin Belirlenmesinde Kullanılacak Markerlerın Seçimi
(2017) Bılgıc, Huseyın Bılgın; Aksulu, Ayça; Bakırcı, Serkan; Karagenç, Tülin; Hacılarlıoglu, Selın; Eren, Hasan; Ünlü, Ahmet Hakan
Amaç: Theileria annulata popülasyonlarında rekombinasyon sonrası oluşacak genetik çeşitliliğin ve rekombinasyonun yoğun olduğu kromozomalbölgelerin tespit edilmesi amacıyla kullanılacak polimorfik mini ve mikrosatellite markerlerin belirlenmesidir.Yöntemler: Markerlerin belirlenmesi amacıyla Unipro UGENE programı kullanılmıştır. T. annulata’nın rastgele karıştırılmış genomik dizilimlere göregerçek DNA diziliminde 10 kat fazla tandem tekrar (TR) belirleyen skor, eşik değer olarak belirlenmiştir. Tekrarlı motif benzerliği %96-100 arasındabulunan, minimum tekrar sayısı en az üç ve minimum tandem boyutu minisatellite bölgeler için en az üç nükleotid ve mikrosatellite bölgeler için enaz altı nükleotid olan TR’ler suffix array algoritması kullanılarak tüm genom boyunca taranmıştır.Bulgular: Tarama sonrası 359 minisatellite ve 8973 mikrosatellite bölge belirlenmiştir. TR’ler tüm genom boyunca tek tek taranarak; T. annulata’nınkromozomları üzerindeki yerleşim yerlerine, motiflerin benzerliğine (>%96), tekrar sayıları ile tek bölgeyi temsil etmesine, bölgelerin uzunluklarına(<1500 bp) ve primer tasarlanmaya uygun korunmuş bölgeler içermesine bakılarak mini ve mikrosatellite bölgeler belirlenmiştir. Belirlenen bölgeleriçoğaltmada kullanılacak primerler, korunmuş bölgelerden tasarlanmış ve her bir primer, T. annulata’nın farklı izolatları kullanılarak değerlendirilmiştir.Sonuç: Bu çalışmada, T.annulata popülasyonlarındaki çeşitliliğinin belirlenmesi amacıyla daha önce belirlenen markerlere ilave olarak kullanılabile-cek, farklı kromozomlar üzerinde bulunan toplam 13 mini ve mikrosatellite marker seçilmiştir.
The Secreted Theileria Annulata Ta9 Protein Contributes To Activation of the Ap-1 Transcription Factor
(Public Library Science, 2018) Unlu, Ahmet Hakan; Tajeri, Shahin; Bilgic, Huseyin Bilgin; Eren, Hasan; Karagenc, Tulin; Langsley, Gordon
Theileria annulata is an obligate intracellular protozoan parasite of the phylum Apicomplexa. Theileria sporozoites invade bovine leukocytes and develop into a multinucleate syncytial macroschizont that causes uncontrolled proliferation and dissemination of infected and transformed leukocytes. Activator protein 1 (AP-1) is a transcription factor driving expression of genes involved in proliferation and dissemination and is therefore a key player in Theileria-induced leukocytes transformation. Ta9 possesses a signal peptide allowing it to be secreted into the infected leukocyte cytosol and be presented to CD8 T cells in the context of MHC class I. First, we confirmed that Ta9 is secreted into the infected leukocyte cytosol, and then we generated truncated versions of GFP-tagged Ta9 and tested their ability to activate AP-1 in non-infected HEK293T human kidney embryo cells. The ability to activate AP-1-driven transcription was found to reside in the C-terminal 100 amino acids of Ta9 distant to the N-terminally located epitopes recognised by CD8+ T cells. Secreted Ta9 has therefore, not only the ability to stimulate CD8+ T cells, but also the potential to activate AP-1-driven transcription and contribute to T. annulata-induced leukocyte transformation.
Van İli Civarında Görülen Helix Lucorum (Mollusca: Pulmonata)’da Dicrocoeliidae (Digenea) Larval Dönemlerinin Yaygınlığı
(2017) Bilgiç, Hüseyin Bilgin; Eren, Hasan; Karagenç, Tülin; Ünlü, Ahmet Hakan
Amaç: Bu çalışmada, Van ili civarında görülen kara salyangozu Helix lucorum’daki Dicrocoeliidae larval dönemlerinin yaygınlığının araştırıl-ması amaçlanmıştır.Yöntemler: Helix lucorum türüne ait salyangozlar, Van ili merkez ilçelerinden Edremit ve Gevaş’tan Nisan, Mayıs ve Haziran 2017 tarihlerinde,özellikle ruminantların yoğun olarak görüldüğü doğal alanlarından toplanmıştır. Toplanan salyangozlar magnezyum klorid ile uyuşturulduk-tan sonra kabuklarından çıkartılarak sindirim bezleri diseke edilmiştir. Diseke edilen parçalar mikroskop altında incelenerek larval dönemlerbelirlenmiştir.Bulgular: Helix lucorum kara salyangozunun Van civarında %22 yaygınlıkla Dicrocoeliid trematodlara ara konaklık yaptığı belirlenmiştir. Mik-roskopta saptanan larval evreler fotoğrafla ayrıntılı olarak gösterilmiştir. Parazitin larval aşamaları ile enfeksiyon sayısı Mayıs ayında en yüksekolarak tespit edilmiştir.Sonuç: Dicrocoeliid trematodlarının bazı gelişim dönemlerine ara konaklık yapan H. lucorum kara salyangozu, aynı zamanda bazı ülkelerdeinsanlar tarafından besin maddesi olarak tüketilmektedir. Bu çalışmada elde edilen bulgulara dayanarak, sert iklime sahip ve İran ile sınırı olanVan bölgesinde bu salyangozun hayvan sağlığı üzerinde önemli etkileri olacağı sonucuna varılabilir.