Browsing by Author "Ertaş, Metin"

Now showing 1 - 4 of 4

Aras Nehrinin Belirli Noktalarından Alınan Sediment Örneklerinden Streptomyces Bakterilerinin İzolasyonu Teşhisi ve Moleküler Karakterizasyonu
(2023) Ertaş, Metin; Önalan, Şükrü; Seçkin, Hamdullah; Ozdemır, Kerem; Ogün, Erdal
Aras Nehri coğrafik ve ekolojik anlamda çok önemli bir yere sahiptir. Aras Nehrindeki Streptomyces çeşitliliğinin tespit edilmesi, izolasyonu, teşhisi ve karakterizasyonunun, mikrobiyolojik ve moleküler biyoloji ve genetik alanlarında bilim dünyasına katkı sağlayacağı düşünülmektedir. Streptomyces türleri bilim dünyası için çok önemli bir yere sahiptir, çünkü bu bakteri türlerinin ürettiği başta antibiyotikler olmak üzere birçok önemli madde bulunmaktadır. Aras Nehrinin geçtiği Erzurum Horasan, Kars Karakurt ve Iğdır Tuzluca bölgelerinden alınan numuneler Streptomyces çeşitliliği bakımından incelendi. Belirlenen lokalitelerden alınan sediment örneklerinin pH ve nem oranları tespit edildi. Bennet’s Agar ve M65 besiyerleri kullanılarak izolasyon, saflaştırma ve renk grubu belirleme çalışması yapıldı. Bu bakteri gruplarının teşhisi amacıyla biyokimyasal, fenotipik ve moleküler testler uygulandı. Renk grubuna göre belirlenen izolatların Spor zincir morfolojisi görüntülendi (SEM). Mikrobiyolojik olarak izole edilecek bakterilerin 16 S rDNA gen bölgelerinin sekans analizi gerçekleştirildi. Bu işlemin ardından elde edilen diziler Genbank verileri ile karşılaştırılarak izole edilen bakterilerin moleküler yakınlık ve benzerlik oranları elde edildi.
Determination of Extracellular Hydrolytic Enzyme Capabilities of Some Anoxybacillus Isolated From Hot Spring Environments
(2022) Erez, Mehmet Emre; Jaf, Widad; Ertaş, Metin
The development of microbial enzymes was a crucial event in the industrial sectors as a result of the tremendous growth of biotechnology in recent years. Popularity of waste management and bioremediation processes have both made extensive use of microorganisms’ whole cells and their enzymes. The pharmaceutical, textile, food, cosmetics, leather, paper, energy, biomaterials, fine chemicals, cellulose, and detergent sectors are some of the uses area of microbial enzymes. Depending on different uses, researchers can search for novel bacterial strains that might exhibit previously unrecognized enzymatic activity. Also for searching for plasmids that could be used as cloning vectors to tackle medication resistance in thermophilic microorganisms. The Anoxybacillus flavithermus bacteria, which were isolated from a hot spring in the Turkish city of Afyon, was employed in this investigation. The ability of the identified bacteria to produce extracellular hydrolytic enzymes was tested. For this, the activities of catalase, urease, and lipase as well as the hydrolysis of starch, casein, xylan, and asparagine were researched. Additionally, tests for antibiotic resistance were studied on the isolated bacteria using four different antibiotics (erythromycin, chloramphenicol, rifamycin, and ampicillin). All identified strains fermented starch as carbon and energy sources, and after 24 hours of incubation, amylase activity was detected at 50°C and pH 7.0. All strains were determined to be catalase-positive, and with a few exceptions, the majority of A. flavithermus strains were also found to be urease and caseinase positive. Industrial products that can be obtained from bacteria found in extreme environments will be effective in the development of future technology.
Fındık Yaprağı Kullanarak Gümüş Nanopartikülerin Yeşil Sentezi ve Antibakteriyel ile Antifungal Aktiviteleri
(2024) Deris, Vida; Yönten, Vahap; Ertaş, Metin
Bitki özütleri kullanılarak metal nanopartiküllerin sentezi, toksik kimyasalların kullanımını azaltan en basit, kullanışlı, ekonomik ve çevre dostu yöntemlerden biridir. Bu çalışmada, fındığın sulu yaprak özütü kullanılarak gümüş nanopartiküllerin (Ag NPs) sentezi araştırılmıştır. Fındık yaprakları kan dolaşımını ve safra salgısını uyarır ve karaciğer ile safra kesesi şikayetleri için ilaçlarda kullanılır. Kabuğu, yaprakları, çiçekleri, ve fındıkları büzücü, yara iyileştirici, kan temizleyici, ateş düşürücü ve terletici olarak kabul edilir. Ag NP'ler UV-vis spektrofotometre, taramalı elektron mikroskobu (SEM), Elektron Dağılım X-ışığı (EDX) ve Fourier dönüşümlü kızılötesi (FTIR) ile karakterize edilmiştir. Nanomateryalin antibakteriyel ve antifungal aktivitesi mikrodilüsyon yöntemleri kullanılarak belirlenmiştir. Yoğun kırmızımsı kahverengi renklenme 0.002 Mm AgNO3 konsantrasyonundan daha yüksek olarak gözlenmiştir. Biyoaktif bileşiklerin Ag+'ın Ag NP'lere indirgenmesinden, stabilizasyonundan ve kaplanmasından sorumlu olduğu bulunmuştur. Mikroinhibisyon konsantrasyonu ile belirlenen sınır değerleri ve antibakteriyel aktivite aşağıdaki gibidir: Bacillus cereus> Escherichia coli> Bacillus subtilis=Pseudomna aeruginosa> Staphylococcus aureus> Enterococcus faecal (25 mm>21 mm>15 mm> 12 mm>11mm). AgNP'ler Candida albicans'a karşı 19 mm gibi antifungal etki gösterdi
Isolation and Characterization of Micromonospora Isolated From Some Soil Samples Collected Arround Van Lake
(2011) Ertaş, Metin; Atalan, Ekrem
Çalışmanın amacı Van Gölü havzası ve Erçek Gölü çevresinde farklı lokalitelerden alınan 24 toprak numunesinden Micromonospora cinsine ait bakterileri izole etmek, teşhis etmek ve karakterize etmektir. Toprak numunelerinin bazı fiziko-kimyasal analizleri yapıldıktan sonra selektif besi ortamına ekim yapıldı. Saflaştırılan 65 Micromonospora izolatı renk gruplandırması ve nümerik taksonomik analizi yapıldı. Ayrıca moleküler karakterizasyon çalışmaları için renk gruplarını temsilen seçilen toplam 10 Micromonospora test izolatının tüm hücre protein profilleri SDS-PAGE (Sodyum Dodesil Sülfat Poliakrilamid Jel Elektroforezi) ile belirlenerek elde edilen sonuçlar dendogram şeklinde sunuldu. Buna ek olarak aynı test mikroorganizmaları RAPD-PCR tekniği kullanılarak elde edilen DNA bantları dendogram halinde sunuldu.Toprak numunelerinin pH'ları genelde nötral değerde iken organik madde içeriği % 4,181 ila 15,248 arasında değişti. İzolasyon çalışmasında koloni sayımı 0,9x104 ile 14,3x104 cfu/gr toprak arasında değişti. Saflaştırılan Micromonospora 14 renk grubuna ayrıldı. SDS-PAGE ve RAPD-PCR teknikleri kullanılarak karakterizasyon çalışmasında renk guruplarını temsilen seçilen test organizmaları her iki verinin analizleri benzer kümelenme oluşturdular.Anahtar Kelimeler: Micromonospora, İzolasyon, Karakterizasyon, SDS-PGE, RAPD-PCR