Browsing by Author "Karagenç, Tülin"

Now showing 1 - 3 of 3

Aydın Yöresinde Sığırlarda ve Kenelerde Anaplasma / Ehrlichia Türlerinin Belirlenmesi
(2015) Eren, Hasan; Bılgıc, Huseyın Bılgın; Karagenç, Tülin; Hoşgör, Murat; Bakırcı, Serkan; Ünlü, Ahmet Hakan
Amaç: Bu çalışmada, sığır ve kenelerde Anaplasma/Ehrlichia türlerinin belirlenmesi ve bu türlerin örnekleme dönemlerindeki yaygınlığı hakkında bilgi edinilmesi amaçlanmıştır. Yöntem: Aydın'a bağlı Osmanbükü, Akçaova, Dalama ve Söke'den sığırlardan toplam 679 kan ve 186 kene örneği toplanmıştır. Toplanan örneklerde Anaplasma/Ehrlichia türlerini soy düzeyinde tespit eden polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) yapılmış, ayrıca A. marginale ile A. centrale türleri, tür spesifik PZR ve A. bovis ile A. phagocytophilum türleri ise nested PZR ile belirlenmiştir. Bulgular: Söke'de sadece Eylül, Dalama ve Akçaova'da ise Mart, Haziran, Eylül ve Aralık'ta A. centrale tespit edilmiştir. A. marginale Osmanbükü'nde sadece Haziran'da, Söke'de Aralık ve Mart, Akçaova'da Haziran, Eylül ve Mart, Dalama'da ise tüm örnekleme dönemlerinde belirlenmiştir. A. phagocytophilum ise tüm bölgelerde örnekleme yapılan bütün dönemlerde tespit edilmiştir. İncelenen örneklerde A. bovis'e rastlanmamıştır. Toplam 50 kan örneğinde miks enfeksiyona rastlanmıştır. Kene havuzlarında A. marginale ve A. phagocytophilum tespit edilmiştir.Sonuç: Bu çalışmada, A. phagocytophilum türünün A. marginale ve A. centrale'ye oranla daha yüksek olarak bulunduğu belirlenmiştir. A. phagocytophilum ile A. centrale en yoğun olarak Akçaova'da tespit edilirken, A. marginale Dalama'da en yoğun olarak tespit edilmiştir. Etkenler en yoğun Eylül ve Mart'ta tespit edilmiştir. Analizler kenelerin farklı Anaplasma/Ehrlichia türleri ile enfekte olduğunu göstermiştir
Rekombinasyon Sonrası Theileria Annulata Popülasyonlarında Genetik Çeşitliliğin Belirlenmesinde Kullanılacak Markerlerın Seçimi
(2017) Bılgıc, Huseyın Bılgın; Aksulu, Ayça; Bakırcı, Serkan; Karagenç, Tülin; Hacılarlıoglu, Selın; Eren, Hasan; Ünlü, Ahmet Hakan
Amaç: Theileria annulata popülasyonlarında rekombinasyon sonrası oluşacak genetik çeşitliliğin ve rekombinasyonun yoğun olduğu kromozomalbölgelerin tespit edilmesi amacıyla kullanılacak polimorfik mini ve mikrosatellite markerlerin belirlenmesidir.Yöntemler: Markerlerin belirlenmesi amacıyla Unipro UGENE programı kullanılmıştır. T. annulata’nın rastgele karıştırılmış genomik dizilimlere göregerçek DNA diziliminde 10 kat fazla tandem tekrar (TR) belirleyen skor, eşik değer olarak belirlenmiştir. Tekrarlı motif benzerliği %96-100 arasındabulunan, minimum tekrar sayısı en az üç ve minimum tandem boyutu minisatellite bölgeler için en az üç nükleotid ve mikrosatellite bölgeler için enaz altı nükleotid olan TR’ler suffix array algoritması kullanılarak tüm genom boyunca taranmıştır.Bulgular: Tarama sonrası 359 minisatellite ve 8973 mikrosatellite bölge belirlenmiştir. TR’ler tüm genom boyunca tek tek taranarak; T. annulata’nınkromozomları üzerindeki yerleşim yerlerine, motiflerin benzerliğine (>%96), tekrar sayıları ile tek bölgeyi temsil etmesine, bölgelerin uzunluklarına(<1500 bp) ve primer tasarlanmaya uygun korunmuş bölgeler içermesine bakılarak mini ve mikrosatellite bölgeler belirlenmiştir. Belirlenen bölgeleriçoğaltmada kullanılacak primerler, korunmuş bölgelerden tasarlanmış ve her bir primer, T. annulata’nın farklı izolatları kullanılarak değerlendirilmiştir.Sonuç: Bu çalışmada, T.annulata popülasyonlarındaki çeşitliliğinin belirlenmesi amacıyla daha önce belirlenen markerlere ilave olarak kullanılabile-cek, farklı kromozomlar üzerinde bulunan toplam 13 mini ve mikrosatellite marker seçilmiştir.
Van İli Civarında Görülen Helix Lucorum (Mollusca: Pulmonata)’da Dicrocoeliidae (Digenea) Larval Dönemlerinin Yaygınlığı
(2017) Bilgiç, Hüseyin Bilgin; Eren, Hasan; Karagenç, Tülin; Ünlü, Ahmet Hakan
Amaç: Bu çalışmada, Van ili civarında görülen kara salyangozu Helix lucorum’daki Dicrocoeliidae larval dönemlerinin yaygınlığının araştırıl-ması amaçlanmıştır.Yöntemler: Helix lucorum türüne ait salyangozlar, Van ili merkez ilçelerinden Edremit ve Gevaş’tan Nisan, Mayıs ve Haziran 2017 tarihlerinde,özellikle ruminantların yoğun olarak görüldüğü doğal alanlarından toplanmıştır. Toplanan salyangozlar magnezyum klorid ile uyuşturulduk-tan sonra kabuklarından çıkartılarak sindirim bezleri diseke edilmiştir. Diseke edilen parçalar mikroskop altında incelenerek larval dönemlerbelirlenmiştir.Bulgular: Helix lucorum kara salyangozunun Van civarında %22 yaygınlıkla Dicrocoeliid trematodlara ara konaklık yaptığı belirlenmiştir. Mik-roskopta saptanan larval evreler fotoğrafla ayrıntılı olarak gösterilmiştir. Parazitin larval aşamaları ile enfeksiyon sayısı Mayıs ayında en yüksekolarak tespit edilmiştir.Sonuç: Dicrocoeliid trematodlarının bazı gelişim dönemlerine ara konaklık yapan H. lucorum kara salyangozu, aynı zamanda bazı ülkelerdeinsanlar tarafından besin maddesi olarak tüketilmektedir. Bu çalışmada elde edilen bulgulara dayanarak, sert iklime sahip ve İran ile sınırı olanVan bölgesinde bu salyangozun hayvan sağlığı üzerinde önemli etkileri olacağı sonucuna varılabilir.