1. Home
  2. Browse by Author

Browsing by Author "Karaman, Rabia Sima"

Filter results by typing the first few letters
Now showing 1 - 2 of 2
  • Results Per Page
  • Sort Options
  • Loading...
    Thumbnail Image
    Master Thesis
    The Effect of Thymoquinone on Expression Levels of Apoptotic, Oxidative and Antioxidant Genes in Nrk-52e Cells
    (2022) Karaman, Rabia Sima; Dede, Semiha
    Nigella sativa'nın aktif bileşeni olan timokinon (TQ), antioksidan ve anti-inflamatuar özellikleri başta olmak üzere pek çok yararlı etkiye sahiptir. Bu tez çalışması, pek çok yararlı etkisi son yıllarda yapılan bilimsel alışmalarla ortaya konulan yararlı etkileri pek çok araştırmada ortaya konulan timokinonun (TQ), böbrek hücrelerindeki apoptotik ve oksidatif yolaklar üzerine etkilerinin, doz ve zamana bağlı olarak gösterilmesi ve amacıyla planlanmıştır. Bu amaçla, Çalışmada materyal olarak, NRK-52E (ATCC® CRL-1571™) sıçan böbrek epitel hücre serisi kullanıldı. NRK-52E hücreleri in vitro koşullarda uygun ortamda sistemli olarak pasajları yapılarak üremesi sağlandı. TQ'un 24. ve 48. saatlerdeki IC50 değerinin tespit edilmesi için MTT hücre canlılık testi yapıldı. Çalışmada uygulanması gereken proliferatif (TQp-10µM)) ve toksik (TQIC50-60µM) dozları tespit edildi. Bu dozların 24 ve 48. saatte elde edilen örneklerde apoptotik(CASP3 (kaspaz 3), CASP8 (kaspaz 8), CASP9 (kaspaz 9), BAX (BCL2 ile X), BCL2 (BCL2 apoptozis düzenleyici) ve antioksidan (GPX1 (glutatyon peroksidaz 1), SOD1 (süperoksit dismutaz 1), oksidatif (NCF1 (nötrofilsistolik faktör 1)) gen ekspresyonları RT-qPCR ile yapıldı. Katlanma Değişimi 2^(-delta delta CT) formülü kullanılarak bulundu. Bu analiz sonuçlarına göre; Kontrol gen ile karşılaştırıldığında, TQ proliferatif dozunda 24. saatte GPX1, TQIC50 dozunda SOD1 önemli oranda up-regule oldu. Oksidatif NCF1 geni 24. saatte doza bağlı olarak değişmediği görüldü. Apoptotik genlerin 24. saatte her iki dozda sınırlı up regüle olduğu saptandı. GPX1 TQp dozunda 48. saatte up-regule olurken (7,215 kat), SOD1, TQIC50 dozunda up-regule (3,623 kat) oldu. NCF1 genin ise 48. saatte yüksek dozda önemli oranda up-regule olduğu belirlendi. Apoptotik genler, 48. saatte TQp dozunda sınırlı miktarda up-regule olurken, TQIC50 dozunda bütün genlerin önemli oranda up-regüle oldukları ortaya konuldu. Sonuç olarak, bu tez çalışmasında, 24. saatte GPx, TQIC50 dozunda ise SOD1'in önemli oranda up regüle olduğu, NCF genin önemli oranda değişmediği, 48 saatte toksik dozda oksidatif stresin arttığı ve SOD'un antioksidan olarak kullanıldığı, TQ bağımlı hücre ölümünde apoptotik yolak etkisinin 24. saatte sınırlı olduğu, 48. saatte toksik dozda hücre ölümünde dış yolak üzerinden gerçekleştiği ortaya konuldu.
  • Loading...
    Thumbnail Image
    Master Thesis
    In Vitro Evaluation of the Effect of Thymoquinone on Renal Cells Oxidative and Apoptotic Pathways
    (2022) Karaman, Rabia Sima; Dede, Semiha
    Nigella sativa'nın aktif bileşeni olan timokinon(TQ), antioksidan ve anti-inflamatuar özellikleri başta olmak üzere pek çok yararlı etkiye sahiptir. Bu tez çalışması, pek çok yararlı etkisi son yıllarda yapılan bilimsel alışmalarla ortaya konulan yararlı etkileri pek çok araştırmada ortaya konulan timokinonun (TQ), böbrek hücrelerindeki apoptotik ve oksidatif yolaklar üzerine etkilerinin, doz ve zamana bağlı olarak gösterilmesi ve amacıyla planlanmıştır. Bu amaçla, çalışmada materyal olarak, NRK-52E (ATCC® CRL-1571™) sıçan böbrek epitel hücre serisi kullanıldı. NRK-52E hücreleri in vitro koşullarda uygun ortamda sistemli olarak pasajları yapılarak üremesi sağlandı. TQ'un 24.ve 48. saatlerdeki IC50 değerinin tespit edilmesi için MTT hücre canlılık testi yapıldı. Çalışmada uygulanması gereken proliferatif (TQp-10µM)) ve toksik (TQIC50- 60µM) dozları tespit edildi. Bu dozların 24 ve 48. saatte elde edilen örneklerde apoptotik(CASP3 (kaspaz 3), CASP8 (kaspaz8), CASP9 (kaspaz9), BAX (BCL2 ile X), BCL2 (BCL2 apoptozis düzenleyici) ve antioksidan (GPX1 (glutatyon peroksidaz 1), SOD1 (süperoksit dismutaz 1), oksidatif (NCF1 (nötrofil sistolik faktör 1)) gen ekspresyonları RT-qPCR ile yapıldı. Katlanma Değişimi 2^(-delta delta CT) formülü kullanılarak bulundu. Bu analiz sonuçlarına göre; kontrol gen ile karşılaştırıldığında, TQ proliferatif dozunda 24. saatte GPX1, TQIC50 dozunda SOD1 önemli oranda up-regule oldu. Oksidatif NCF1 geni 24. saatte doza bağlı olarak değişmediği görüldü. Apoptotik genlerin 24. saatte her iki dozda sınırlı up regüle olduğu saptandı. GPX1 TQp dozunda 48. saatte up-regule olurken (7,215 kat), SOD1, TQIC50 dozunda up-regule (3,623 kat) oldu. NCF1 genin ise 48. saatte yüksek dozda önemli oranda upregule olduğu belirlendi. Apoptotik genler, 48. saatte TQp dozunda sınırlı miktarda up-regule olurken, TQIC50 dozunda bütün genlerin önemli oranda up-regüle oldukları ortaya konuldu. Sonuç olarak, bu tez çalışmasında, 24. saatte TQp dozunda GPx, TQIC50 dozunda ise SOD1'in önemli oranda up regüle olduğu, NCF genin önemli oranda değişmediği, 48 saatte toksik dozda oksidatif stresin arttığı ve SOD'un antioksidan olarak kullanıldığı, TQ bağımlı hücre ölümünde apoptotik yolak etkisinin 24. saatte sınırlı olduğu, 48. saatte toksik dozda hücre ölümünde dış yolak üzerinden gerçekleştiği ortaya konuldu. Anahtar Kelimeler: Timokinon, apoptozis, oksidatif, böbrek