Browsing by Author "Kavak, Sedat"

Now showing 1 - 3 of 3

Isolation and Characterization of Methyltrophic Bacteria From Sediment Samples Collecting Van Lake
(2018) Kavak, Sedat; Öğün, Erdal
Bu araştırmada; metilotrofik bakterilerin izolasyonunda kullanılan sediment örneği Van Büyükşehir Belediyesi Atık Su Arıtma tesisinin açıldığı alandan sağlandı. Bu çalışmada metilotrofik bakterilerin izolasyonunda sadece bir izolatın % 1-5 oranında metanol içeren ortamda üredeği gözlemlendi. Halomonas S1 izolatı olarak adlandırılan bu izolatın morfolojik, fizyolojik, biyokimyasal özellikleri belirlenerek 16S rRNA gen bölgesinin dizi analizi gerçekleştirildi. İzolatlardan yalnız S1 kültürünün tek karbon ve enerji kaynağı olarak %1 metanol içeren besi yerinde üreyebildiği görüldü. Daha kesin bir sonuç elde etmek için S1 kültürü NMR tekniği kullanılarak test edildikten sonra S1 kültürürnün metanolü yegane enerji ve karbon kaynağı olarak kullanma yeteneğine sahip olduğu gözlemlendi. 16S rDNA gen bölgesi; filogenetik analizde 1202 nükleotit'lik bir bölgede kıyaslanan S1 izolatının, 16 nükleotid fark ve % 98.6 benzerlik ile Halomonas desiderata (NR 026274)'ya benzediği tespit edilmiştir. Aynı zamanda BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) programı kullanılarak Gen Bankasındaki veritabanı ile karşılaştırılması sonucu suşun %100 benzerlikle Halomonas desiderata olduğu bulunmuştur.
Kesimi Yapılan Ruminantlardan Elde Edilen Fasciola Türlerinin Morfometrik ve Moleküler Yöntemlerle İncelenmesi
(2025) Kavak, Sedat; Yılmaz, Hasan
Bu çalışmada, mezbahada kesimi yapılan sığır, koyun ve keçilerin karaciğer safra kanallarından elde edilen erişkin Fasciola türlerinin morfometrik ve moleküler yöntemlerle incelenmesi amaçlandı. Bu amaçla, kesimi yapılan 281 sığır, 529 koyun ve 218 keçi olmak üzere toplam 1028 hayvanın karaciğeri incelendi. Elde edilen 51 Fasciola türlerine ait izolattan 50 erişkin Fasciola örneği kullanıldı. Parazitlerin morfometrik ölçümleri stero mikroskop altında X8 büyütmede yapıldı. Örneklerin tür tayini için gDNA izolasyonu sonrası ITS1 bölgesi PCR ile çoğaltıldı. Çoğaltılan ITS1 bölgesinin kesimi PCR-RFLP yöntemiyle RsaI restriksiyon enzimi kullanılarak yapıldı. İncelenen sığırların 24'ünde (%8.54), koyunların 19'unda (%3.59) ve keçilerin sekizinde (%3.67) olmak üzere 51 hayvanda Fasciola türlerine rastlandı. PCR-RFLP yöntemi ile izolatların 45'inin F. hepatica, beşinin ise ara form Fasciola olduğunu göstermiştir. Vücut uzunluğu/vücut genişliği oranından faydalanılarak elde edilen ölçüm sonuçlarının ROC analizi ile değerlendirilmesi sonucunda, Fasciola hepatica ile ara form Fasciola örneklerinin birbirinden ayrılamadığı saptandı. Fasciola'nın ara formu PCR-RFLP yöntemi ile Türkiye'de ilk defa bu çalışma ile belirlendi. Fasciola türlerin kesin teşhisleri için morfometrik analizin yeterli olmadığı ve PCR-RFLP yöntemi gibi moleküler bir yöntemin kullanılması gerektiği sonucuna varıldı.
Sığırlarda Helmint Enfeksiyonları: Ağrı Bölgesinden Toplanan Dışkı Örnekleri Üzerine Bir Çalışma
(2025) Elasan, Sadi; Aydemır, Selahattın; Afşar, Milad; Kavak, Sedat
Bu çalışmanın amacı, Ağrı yöresinde sığırlarda helmintlerin görülme sıklığını araştırarak, hem yörede görev yapan veteriner hekimlerin hem de hayvancılık ile uğraşan yöre halkının helmint hastalıklarıyla mücadelesine katkı sağlayacak literatür bilgi oluşturmaktır. Çalışmaya, Ağrı merkez ve ilçelerine bağlı farklı yerleşim yerlerinde bulunan aile işletmelerine ait 438 sığır dahil edildi. Her bir sığırın rektumundan yaklaşık 30-50 g dışkı örneği alınıp modifiye sedimantasyon-santrifüjleme yöntemi ile ışık mikroskobunda incelendi. Dışkı örneği incelenen 438 sığırın 198’inde (%45.2) helmint yumurtası saptanmış olup, numunelerin 65’inde (%32.8) iki ve altısında (%3) üç türe ait helmint yumurtası saptandı. Numunelerin 63’ünde (%14.4) Fasciola spp., 11’inde (%2.5) Dicrocoelium dendriticum, 80’inde (%18.3) Toxocara vitulorum, 106’sinde (%24.2) Trichostrongylus spp. ve 15’inde (%3.4) Trichuris spp.’ye ait yumurtalar görüldü. Holştayn ve simental ırklarına göre yerli kara ırkında daha fazla helmint yumurtası saptandı (p=0.009). Sonuç olarak, Ağrı ve ilçelerinde sığırlarda görülen helmintlerin yüksek oranda olduğu görüldü. Sığırlarda önemli verim düşüklüğüne ve hatta ölümlere neden olan bu parazitlerin önemi büyük olup, özellikle mera hayvancılığının yaygın olduğu yörede hayvanların periyodik aralıklarla bağırsak parazitleri yönünden kontrollerinin yapılması ve parazitli hayvanların tedavi edilmesi son derece önem arz etmektedir.