Browsing by Author "Mengeş, Nurettin"

Now showing 1 - 4 of 4

Computer Aided Design of Cathepsin L Enzyme Inhibitors and Evaluation for Ovarian Cancer Treatment
(2022) Kaya, Necla; Mengeş, Nurettin
Yumurtalık kanseri kadınlarda en sık görülen ve tedavi edilmezse ölüme kadar sonuçlanan bir kanser türüdür. Bu tez kapsamında da yumurtalık kanserine alternatif bir çözüm yolu olarak Katepsin L' nin etkinliği araştırıldı.Katepsin L enziminin antikanser gibi birçok hayati fonksiyona katkı sağladığı bilindiğinden kaynaklı yumurtalık kanserinde tedavi amaçlı umut kaynağı olacağı düşünülmektedir. Son zamanlarda sanal taramanın kolay, hızlı ve maliyetinin daha az olması nedeniyle tercih edilmeye başlandı. Bu tez kapsamında da literatürde çok fazla çalışma ile temsil edilmeyen Katepsin L enzimi için sentez basamakları kolay, daha az sayıda atoma sahip kompleks bir yapıya sahip olmayan yeni moleküller önerildi ve bunlarla ilgili detaylı bir teorik hesaplama modeli çalışıldı. Moleküler docking yöntemi ile karmaşık yapıda ki enzim-ligand molekülleri hesaplandı. Bu çalışmada 13 farklı pirol moleküllerinin, Katepsin L enzimi ile olan etkileşimleri ve uygun inhibitörleri docking çalışması ile araştırıldı ve bu 13 farklı pirol moleküllerinin fonksiyonel gruplarının teorik aktivite üzerindeki etkileri ve yumurtalık kanseri konusundaki değerlendirmeler tez kapsamında ortaya çıkartıldı.
Design, Obtaining, Characterization and Antimicrobial Properties of Carbon Nano Tubes Modified With Organic Molecules
(2021) Yiğit, Aybek; Mengeş, Nurettin; Alma, Mehmet Hakkı
Son yılların populer konularından olan nanotüpler, ilaç veya molekül taşıma, tümör tedavisi, doku mühendisliğinde nano boyutta iskeletler oluşturma ve biyosensörler gibi daha birçok alanda kullanılmaya başlanmıştır. Bu çalışmada, yüzeyinde karboksilik asit ucu bulunan karbon nanotüp molekülünde uygun kimyasal dönüşümler sayesinde karboksilik asit ucu önce açil klorüre dönüştürülerek sonraki reaksiyonlarda farklı fonksiyonel gruplar haline getirilmiştir. Etilen diamin, dietilen triamin, trietilen tetraamin, gibi nükleofilik yapıların karbon nanotüp yüzeyine bağlanması sağlanmıştır. Daha sonra amin gruplarına sahip karbon nanotüp malzemesinin, borik asit ve siyanür klorürle etkileştirilmesi sağlandıktan sonra üzerinde borik asit ve siyanür klorür yapıları taşıyan karbon nanotüp molekülleri sentezlenmiştir. Elde edilen nano malzemelerin karakterizasyon ve yüzey şekillerinin bilgisi için, FT-IR, SEM, TEM, XPS, XRD kullanıldı. Nano malzemelerdeki sıcaklığa karşı kararlılığının tespiti için ise TGA kullanıldı. Elde edilen nano malzemelerin Listeria monocytogenes, Staphylococcus aureus, Escherichia coli ve Pseudomonas aeruginosa ve Klebsiella pneumoniae mikroorganizmalarına karşı antimikrobiyal aktiviteleri hem disk difüzyon yöntemi ile aktivite zonu ölçümü ile hem de MİK (Minumum İnhibisyon Konsantrasyonu) uygulanarak araştırıldı.
Gold and Iodine-Catalyzed Design of New Heterocyclization Methods for Construction of New Bicyclo Heterocyclic System
(2012) Mengeş, Nurettin; Balcı, Metin
Bu çalışmada metal katalizör kullanılmadan N-alkinil-pirol türevleri, hidrazinmonohidrat ile ısıtılarak triazepin türevlerine dönüştürüldü. Aynı pirol türevleri I2 ilereaksiyona tabi tutularak elde edilen bileşikler karakterize edildi. Triazepin türevlerininoluşumu sırasında reaksiyonun izlediği mekanizma kontrollü deneyler sonucundabelirlendi.N-alkinil-pirol türevlerinin hidrazon bileşikleri AuCl3 eşliğinde elektrofiliksiklizasyona uğratıldı. Siklizasyon sonucunda C,N-siklik azometin imin yapısına sahipsistemler elde edildi. Bu reaksiyonun izlediği mekanizma ayrıca gösterildi. N-alkinil piroltürevleri bir amin türevi ve Cs2CO3 eşliğinde siklizasyona uğratıldı. Reaksiyon sonucundaönemli bir sistem olan amino-indolizin türevi elde edildi.Terminal alkinlerin türevlendirilmesi için kullanılan Sonogashira kenetlenmereaksiyonları için uygun ve kullanışlı bir metot geliştirildi. Bu metot N-alkinil-piroltürevlerinin kenetlenme reaksiyonlarına başarıyla tatbik edildi.Çoklu bağlara sahip bileşiklerin ılıman şartlarda hidrazin monohidrat ve pirol-2-karbaldehit eşliğinde indirgenmeleri ile ilgili yeni bir yöntem geliştirildi. Bu yöntem farklıtürde çoklu bağların bulunduğu sistemlerin indirgenmesinde başarıyla sonuçlandı.Anahtar kelimeler: Altın tuzları, Sonogashira kenetlenme, iyot, indolizin, indirgenme, triazepin, elektrofilik siklizasyon,
Investigations of the Novel Reactions of Cyclic Oxalyl Compounds
(2007) Mengeş, Nurettin; Şener, Ahmet
İndol grubu ihtiva eden bileşikler büyük miktarda antimikrobiyal özellikler göstermektedirler. Üç pozisyonunda sübstitüe olmuş indoller, neurotransmitter seratonin, melatonin, the hollucinogens psilocybin gibi triptamin alkaloidlerin yapı elemanlarıdır. Çoğunun farmakolojik özellikler gösterdiği doğada bulunan bileşiklerin önemli bir ailesini simgeleyen İndol türevleri bilimsel araştırmalarda büyük bir yer oluşturmaktadır.Bu çalışmada daha önce sentezlenmemiş, indol ihtiva eden karboksilik asit türevleri ve bu asitlerin türevlerininde farklı ester ve hidrazon türevleri elde edilmiştir. 4-etoksikarbonil-5-fenil-2,3-furandion ve 4-benzoil-5-fenil 2,3-furandion'ların 2-fenil indol ile 1/1 mol reaksiyonu sonucu bazı okzalasetik asit ve pirüvik asit türevleri sentezlenmiştir.Bu bileşiklerin yapıları elementel analiz, IR, 1H-NMR, 13C-NMR spektrumları ile aydınlatıldı.