Browsing by Author "Tekindal, Mustafa Agah"

Now showing 1 - 5 of 5

Cerrahide Kohort Çalışmalarının Raporlanması İçin Bir Kılavuz; Strocss Kriterlerinin Türkçe Uyarlaması
(2019) Yavuz, Yasemin; Dogan, Guvenc; Erkent, Murathan; Tekindal, Mustafa Agah; Ateş, Can; Doğan, Gül Bahar Başım; Demir, Emre
Amaç: Bu çalışmada, cerrahi alanında kohort çalışmalarının raporlama kalitesini iyileştirmek ve bir standart oluşturmak amacıyla uzmanlardan oluşanbir grup tarafından 2017 yılında yayınlanan 17 maddelik (37 alt madde) STROCSS (Cerrahide Kohort Çalışmaların Raporlanmasının Güçlendirilmesi)kriterlerinin Türkçeye uyarlanmasının yapılması amaçlanmıştır.Gereç ve Yöntem: STROCSS kriterleri, üç yazar (E.D., C.A., M.A.T.) tarafından birbirlerinden ayrı olarak Türkçeye çevrilmiş ve Y.Y.’nin liderliğindeson taslak olarak belirlenmiştir. Türkçeye uyarlanmış kontrol listesi kullanılarak 2010-2018 yılları arasında TR dizinde yayınlanan 10 cerrahi kohortaraştırmasının raporlanma kalitesi beş farklı cerrahi branştaki akademisyen hekim (İ.Ş.T., G.D., Ü.M., G.D., M.E.) tarafından değerlendirilmiştir.İstatistiksel değerlendirmelerde sınıf içi korelasyon katsayısı ve Bland-Altman grafikleri kullanılmıştır.Bulgular: Cerrahi branşlardaki ikili değerlendirmeler arasında anlamlı uyum olduğu görülmüştür (p<0,001; p<0,001; p=0,007; p=0,001). En yüksekuyum iki farklı Genel Cerrah arasında bulunmuştur; 0,963 (0,857-0,991). Tüm Akademisyen Hekimler arasında ise 0,947 (0,858-0,985) uyum düzeyibulunmuştur (p<0,001). Bland-Altman grafiklerine göre genel olarak tüm gözlemciler arasında uyuşma bulunmuştur.Sonuç: Birçok uluslararası yayıncı tarafından cerrahi alanındaki makalelerin incelemeye alınması için zorunlu hale gelen bu kılavuzun çevirilmesi ileülkemizdeki araştırmacılara çalışmalarının raporlanmasında kolaylık sağlayacağı ve ulusal yayınlarda bir standart oluşturulacağı düşünülmektedir.
Comparison of Test Statistics of Nonnormal and Unbalanced Samples for Multivariate Analysis of Variance in Terms of Type-I Error Rates
(Hindawi Ltd, 2019) Ates, Can; Kaymaz, Ozlem; Kale, H. Emre; Tekindal, Mustafa Agah
In this study, we investigate how Wilks' lambda, Pillai's trace, Hotelling's trace, and Roy's largest root test statistics can be affected when the normal and homogeneous variance assumptions of the MANOVA method are violated. In other words, in these cases, the robustness of the tests is examined. For this purpose, a simulation study is conducted in different scenarios. In different variable numbers and different sample sizes, considering the group variances are homogeneous (sigma(12) = sigma(22) == sigma(g2)) and heterogeneous (increasing) (sigma(12) < sigma(22) < ... < sigma(g2)), random numbers are generated from Gamma(4-4-4; 0.5), Gamma(4-9-36; 0.5), Student's t(2), and Normal(0; 1) distributions. Furthermore, the number of observations in the groups being balanced and unbalanced is also taken into account. After 10000 repetitions, type-I error values are calculated for each test for alpha=0.05. In the Gamma distribution, Pillai's trace test statistic gives more robust results in the case of homogeneous and heterogeneous variances for 2 variables, and in the case of 3 variables, Roy's largest root test statistic gives more robust results in balanced samples and Pillai's trace test statistic in unbalanced samples. In Student's t distribution, Pillai's trace test statistic gives more robust results in the case of homogeneous variance and Wilks' lambda test statistic in the case of heterogeneous variance. In the normal distribution, in the case of homogeneous variance for 2 variables, Roy's largest root test statistic gives relatively more robust results and Wilks' lambda test statistic for 3 variables. Also in the case of heterogeneous variance for 2 and 3 variables, Roy's largest root test statistic gives robust results in the normal distribution. The test statistics used with MANOVA are affected by the violation of homogeneity of covariance matrices and normality assumptions particularly from unbalanced number of observations.
Farklı Dağılım ve Varyansların Homojenliği Koşulları Altında Ancova'nın Sağlamlığı
(2020) Erdoğan, Beyza; Kaymaz, Ozlem; Ateş, Can; Tekindal, Mustafa Agah
Amaç: Tüm parametrik yöntemlerde olduğu gibi, ANCOVA yönteminde de hataların normal dağıldığı, varyansların homojenliği ve hata terimlerinin bağımsız olduğu varsayılmaktadır. Ancak, pratikte, değişkenlere ilişkin dağılımların sıklıkla normal dağılıma uymadığı bilinmektedir. Bu çalışmada, varyansların homojenliği ve farklı dağılım koşulları altında ANCOVA yönteminin tip I hata oranlarının incelenmesi amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: Bu amaçla farklı senaryolarda simülasyon çalışmaları yapılmıştır. üç bağımsız grup için birbirine eşit olacak şekilde farklı örneklem büyüklüklerinde Gamma, Beta ve Normal dağılımlardan veri türetimi yapılmıştır. . Simülasyon çalışmalarında, gruplar arasındaki farkın anlamlı olmadığı hipotezi altında, 10000 tekrar ile her bir senaryo için tip I hata oranları hesaplanmıştır. Bulgular: Simülasyon çalışması sonuçlarına göre, homojen varyanslı normal dağılım durumunda, örneklem büyüklüğü n = 20 ve n = 40 olan gruplarda Tip I hatanın yüksek olduğu bulunmuştur. Heterojen varyans ile normal dağılım durumunda, n = 10 ve n = 30 ve n = 40 örneklem büyüklüğündeki gruplarda sapma gözlenmiştir. Bu sonuçlar Gamma dağılımının sonuçları ile aynıdır. Beta dağılımında iki farklı senaryo incelenmiştir. Bunlar dağılım grafiklerinin \"U\" ve \"ters U\" biçimlerinde gözlendiği durumlardır ve n = 10 ve n = 20 gibi küçük örneklem büyüklüğünde sapmalar gözlemlenmiştir. Öneri: Sonuçlar, tip I hata oranının, dağılımın çarpıklığı, örneklem büyüklüğü ve varyansın homojenliği gibi faktörlerden etkilendiğini göstermiştir. Farklı dağılımlar ve parametre değerleri için gerçekleştirilecek simülasyon çalışmaları ile sonuçlar genişletilebilir.
Molecular Detection of Mycoplasma Haemocanis and Candidatus Mycoplasma Haematoparvum in Rhipicephalus Sanguine Us Tick Species Collected From Dogs in Adana Province of Turkey
(Parlar Scientific Publications (p S P), 2021) Sababoglu, Ezgi; Ayanz, Adnan; Kilinc, Ozlem Orunc; Yilmaz, Ali Bilgin; Tekindal, Mustafa Agah; Akkaya, Hayrettin; Celik, Burcak Aslan
Mlycoplasma haemocanis (Mhc) and Candidatus Mycoplasma haematoparvum (CMhp) arc hemo-tropic mycoplasma species known to be specific to dogs. Rhipicephalus sanguineus (sensu lam) ticks have been suggested to bc the main vector in transmission; but a clear relationship between tick infestation and the disease has yet to be established under field conditions. This study aimed to investigate the presence of Mhc and CMhp in R. sanguineus (s.1.) s.ticks that arc considered to be a possible vector for hemoplasma infections, Using the species -specific polymerase chain reaction (PCR) test, the presence of Mhc. and CMhp was investigated in total of 312 archived adult tick samples collected from 63 pet dogs kept in the municipal dog shelter of Adana province located in the Mediterranean region of Turkey. Although R. sanguineus (s.1.) ticks tested negative for Mhc, 2.56% (n = 8) were positive for CMhp. There was a statistically significant difference in the Mhc and CMhp detection rates in R. sanguineus (s.1.) ticks (2.56%; 95% CI: 0.81 - 4.31; P < 0.05). To our knowledge, this is the first study to reveal the presence of CAlhp in R. sanguineus (s.l.) ticks collected from dogs in Turkey.
Stard 2015 Kriterlerinin Türkçe Uyarlaması; Tanı Doğruluğu Çalışmalarının Raporlanması İçin Bir Kılavuz
(2019) Tekindal, Mustafa Agah; Yıldırım, Engin; Muslu, Ümran; Ateş, Can; Yavuz, Yasemin; Demir, Emre
Amaç: Bu araştırmada, tanı doğruluğu çalışmalarının raporlama kalitesini iyileştirmekve bir standart oluşturmak amacıyla 2003 yılında yayınlanan ve uluslararası birçok yayıncı tarafından makale yüklerken doldurulması zorunlu hale getirilen 25 maddelik STARD (the standards for the reporting of diagnostic accuracy studies) kriterlerinin 2015 yılında güncellenmiş30 maddelik yeni versiyonunun Türkçeye uyarlanması amaçlanmıştır. Araştırmanın, Türkçeyayınlanan tanı doğruluğu çalışmaları için standart oluşturulması yoluyla yayın kalitelerininarttırılmasına katkı sağlayacağı düşünülmektedir. Gereç ve Yöntemler: STARD 2015 kriterleri,üç yazar tarafından birbirlerinden bağımsız olarak Türkçeye çevrilmiş ve YY’nin liderliğindeher bir madde için görüş birliği sağlanarak son hali verilmiştir. Türkçeye uyarlanmış kontrollistesinin tekrar edilebilirlik düzeyini değerlendirmek amacı ile iki akademisyen hekim 15tanı doğruluğu çalışmasının kalitelerini değerlendirmiştir. Değerlendiriciler arasındaki uyumiçin GWET AC1 istatistiği, Sınıf İçi Korelasyon Katsayısı (SKK) ve Bland-Altman yöntemleri kullanılmıştır. Bulgular: GWET AC1 istatistiğine göre 21 kriterin değerlendirme sonuçlarıarasında tam uyuşma olduğu, 8 kriterin 0,81-1,00 aralığında, 5 kriterin 0,61-0,80 aralığındaolduğu gözlenmiştir. Hekimlerin makalelere vermiş oldukları toplam puanlar arasında SKKdeğeri 0,871 (%95 GA: 0,616-0,957) olarak bulunmuştur. Sonuç: Birçok uluslararası yayıncıtarafından makale yüklerken doldurulması zorunlu hale gelen STARD 2015 kılavuzunun ülkemizdeki dergilerde tanı doğruluğu ile ilgili çalışmalarda kalitenin arttırılması için zorunlubir kılavuz haline gelmesi yakın gelecekte öngörülmektedir.