Van İlinde Yoncada Saptanan Yonca Mozaik Virüs (Amv) İzolatlarının Kılıf Protein Genomunun Moleküler Karakterizasyonu

Abstract

Van ilinde yetiştiriciliği yapılan yonca (Medicago sativa L.) bitkilerinde 2019 yılında virüslerinoluşturduğu simptomlara benzer belirtiler görülmüştür. Gözlenen belirtiler arasında cüceleşme, yapraklardamozaik deseni ve sararma, rozetlenme ve küçük yaprak oluşumu yer almaktadır. Simptom gösteren vegöstermeyen bitkilerden toplanan 19 yonca yaprak örneğine, virüs genomunu tespit edebilmek için uygun primerçiftleri ile RT-PCR testi uygulanmıştır. Yonca yaprağı örneklerinden şiddetli belirtiye sahip altısı beklenenbüyüklükte 700 bp DNA band oluşturmuştur. Bunlar arasından rastgele seçilen ikisi bir plazmid vektörüneklonlanmıştır. Elde edilen rekombinant plazmidler her iki yönde dizilenmiştir. Dizi analizi sonuçlarına göreinfekteli yoncalardaki virüsün Yonca mozaik virüs olduğu açığa çıkarılmıştır. Dizi bilgileri MT210179 veMT210178 erişim numaraları ile gen bankasına yüklenmiştir ve sırasıyla Alakoy Y9 ve Alakoy Y1 olarakisimlendirilmiştir. Her iki dizi için gen bankasına kayıtlı 16 AMV dizisi ile oluşturulan filogenetik ağaca göre,her iki izolat da nükleotit düzeyinde ABD, Brezilya ve Puglia izolatları ile en yüksek benzerlik ve Güney Koreizolatı ile en düşük benzerlik oranı göstermiştir. Ayrıca her iki dizinin birbirleri arasında, 7 nükleotit değişikliğiile %98.45 oranında nükleotit benzerliği gösterdiği ortaya çıkarılmıştır. Gerçekleştirilen litaratür taramaçalışmalarına göre, bu çalışma Türkiye'nin Van ilinde yetiştirilen yonca bitkilerindeki Yonca mozaik virüsü(AMV)’ nün ilk raporu ve moleküler analizidir.