Characterization of Bacillus Species by Numerical Analysis of Their Sds- Page Protein Profiles

Abstract

Bu çalışmada, dokuz referans Bacillus ırkı sodyum dodesil sülfat poliakrilamid jel elektroforezi kullanılarak elde edilen toplam hücresel protein profillerine göre karakterize edildi. Protein profil sonuçları esas alınarak yapılan nümerik sınıflandırma %47 benzerlik düzeyinde iki ayrı grup (cluster) oluşturdu. Grup 1 benzerlik düzeyi %67-85 arasında değişen B. subtilis ve B. megaterium türlerine ait dört ırkı; grup 2 benzerlik seviyesi % 50-70 arasında değişen farklı Bacillus türlerine ait beş ırkı içermektedir. Nümerik analizde grup l'e ait ırklar grup 2'den açıkça ayrılmaktaydı. Bizim sonuçlarımız, SDS-PAGE yöntemiyle elde edilen hücresel protein profillerinin bilgisayar analizleriyle birleştirilmesinin Bacillus türlerinin taksonomik ilişkilerinin incelenmesinde etkili bir yaklaşım sağladığını gösterdi.