Türkiye’den Bazı Helvella Türlerinin Moleküler Tanımlanması İçin İki Dna Barkodlama Bölgesinin Karşılaştırılması

Abstract

Çalışmada iki nükleer DNA lokusu kullanılarak Türkiye‘den bazı Helvella türlerinin (Helvella acetabulum, H. arctoalpina, H. calycina, H. corium, H. crispa, H. elastica, H. lacunosa, H. leucomelaena, H. leucopus, H. solitaria) filogenetik ilişkileri değerlendirilmiştir. Transkribe edilen aralayıcı bölgeler (ITS) ve translasyon uzama faktörü 1-alfa (TEF1-α) DNA dizileri Maksimum olasılık ve Bayes çıkarım yöntemleri baz alınarak analiz edilmiştir. TEF1-α bölgesi daha az indel ve tutarlı nukleotid varyasyonları içermesine ragmen, ITS bölgesi Helvella türlerinin filogenetik ayrımında daha iyi sonuç verebilir. Fakat her iki bölge de bu cins içerisinde yer alan bazı kriptik türlerin ya da morfotürlerin ayrımında tek başına yeterli olmayabilir.