Diyarbakır İlinde Yetiştirilen Hıyar Bitkilerinde Hıyar Mozayik Virüsü’nün Genetik Çeşitliliği
No Thumbnail Available
Date
2024
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Abstract
Hıyar bitkisi (Cucumis sativus L.) dünya çapında üretilen önemli bir kültür bitkisidir. Yaygın viral hastalıklarından biri olan Hıyar mozayik virüsü (Cucumber mosaic virus, CMV) hıyar bitkisinde verim ile birlilkte kaliteyi düşürerek ekonomik kayıplara neden olmaktadır. Diyarbakır ilinde 2021 yılı Eylül ayında yapılan gözlemlerde, yapraklarda mozaik, düzensiz sarımsı lekeler ve deformite gibi virüs benzeri simptomlar gösteren hıyar bitkileri gözlenmiştir. Simptom gösteren ve göstermeyen örnekler toplanarak CMV spesifik primerler kullanılarak ters transkriptaz polimeraz zincir reaksiyonu (RT-PZR)’na tabi tutulmuş ve üretilen DNA bantları agaroz jelde görüntülenmiştir. CMV infeksiyonu 15 örnekten yedisinde belirlenmiştir. Rastgele seçilen bir örneğin bakteriyel klonlanması ve dizilenmesi sonucunda, CMV kısmi kılıf proteni geninin 593 bp uzunluğunda olduğu belirlenmiş ve NCBI veri tabanına MW962979.1 erişim numarası ile kaydedilmiştir. CMV’nin farklı izolatlarıyla gerçekleştirilen filogenetik ağaca göre, Diyarbakır CMV izolatı Subgrup IA grubunu oluşturan Avustralya, İsrail, İspanya, Macaristan, Japonya ve Kore’ye ait CMV izolatları ile kümelenmiştir. Diyarbakır bölgesinde yetiştirilen hıyar bitkilerinde CMV’nin varlığı ve grup/subgrup teşhisi ilk defa bu çalışma ile doğrulanmıştır.
Description
Keywords
Biyoloji, Bahçe Bitkileri, Mikrobiyoloji, Çevre Bilimleri, Viroloji, Biyoloji Çeşitliliğinin Korunması
Turkish CoHE Thesis Center URL
WoS Q
N/A
Scopus Q
N/A
Source
Türk Doğa ve Fen Dergisi
Volume
13
Issue
1
Start Page
1
End Page
6