Identification of Alkaliphilic Bacillus Species Isolated From Lake Van and Its Surrounings by Computerized Analysis of Extracellular Protein Profiles

Abstract

Bu çalışmada, 5 referans Bacillus türü ve Van Gölü suyu ve çevresindeki topraklardan izole edilen toplam 17 yerel alkalofilik Bacillus izolatı fenotipik özellikleri ve sodyum dodesil sülfat poliakrilamidjel elektroforez kullanılarak elde edilen ekstraselülar protein profillerine göre identifiye edilmiştir. Fenotipik özelliklerine göre, yerel izolatların tümünün Gram pozitif, aerobik, endospor oluşturan, hareketli ve fakültatif alkalofilik Bacillus cinsine ait türler olduğu belirlenmiştir. Ayrıca, yerel alkalofilik izolatların fenotipik olarak diğer referans Bacillus türlerinden farklı olduğu bulunmuştur. Ekstraselülar protein profil sonuçları esas alınarak yapılan nümerik analiz; yerel izoiatlar ve B. megaterium'u içeren benzerlik seviyesi % 69 ve % 100 arasında değişen dört grup ve benzerlik seviyesi % 70'in üzerinde diğer referans Bacillus türlerini içeren bir grup olmak üzere beş ayrı grup ortaya koymuştur. Bu araştırma, SDS-PAGE yöntemiyle elde edilen ekstraselülar protein profillerinin yerel alkalofilik Bacillus izolatları ve diğer Bacillus türlerinin taksonomik ilişkilerinin incelenmesinde etkili bir yaklaşım sağladığını göstermiştir.