Linking Metal Exposure to Ischaemic Heart Disease: A Bioinformatic Analysis

Abstract

Amaç: Dünya çapında en çok ölüme neden olan kardiyovasküler hastalık iskemik kalp hastalığıdır. Değiştirilebilir ve değiştirilemez risk faktörlerinin yanı sıra, özellikle ağır metaller olmak üzere çevresel faktörlerin de iskemik kalp hastalığı riskine katkıda bulunabileceği düşünülmektedir. Çalışmamızın amacı, arsenik, kadmiyum, kurşun ve cıva tarafından indüklenen iskemik kalp hastalığı ile ilişkilendirilebilecek potansiyel moleküler mekanizmaları belirlemektir. Gereç ve Yöntem: Bu çalışmada toksikogenomik verileri ve Comparative Toxicogenomic Database, ToppGene Suite, GeneMANIA, STRING, Cytoscape, ChEA3 ve MIENTURNET gibi biyoinformatik veritabanlarını ve araçları kullandık. Bulgular: Çalışılan metaller ve iskemik kalp hastalığı ile ilişkili genlerden CRP, HMOX1, PON1 ve PTGS2’nin örtüştüğünü gözlemledik. Bu örtüşen genler arasında en yaygın etkileşim fiziksel etkileşimdi (%77,64). Çalışılan metallerin etkileyebilecekleri temel moleküler mekanizmalar olarak çeşitli yolaklar tanımlandı ve bunlar, iskemik kalp hastalığının etiyolojisinde rol oynayan yolakları içeriyordu (örneğin, plazma lipoprotein parçacık seviye lerinin düzenlenmesi, inorganik maddelere yanıt, kan dolaşımı, dolaşım sistemi süreçleri ve metal iyonlarına hücresel yanıt). Bu metallerin indük lediği iskemik kalp hastalığı ile ilişkili olarak temel genler CRP ve HMOX1 iken, ATF5 ve CREB3L3 de temel transkripsiyon faktörleri olarak belirlendi. Ayrıca, iskemik kalp hastalığıyla ilişkili iki miRNA da (hsa-miR-128-3p ve hsa-miR-1273g-3p) belirledik. Sonuç: Bu gözlemler arsenik, kadmiyum, kurşun ve cıvanın neden olduğu iskemik kalp hastalığının altında yatan süreçleri anlamamıza önemli bir katkı sağlamaktadır.