Tavuk ve Martı Kökenli Enterokok Türlerinin Antibiyotik Dirençliliğinin Fenotipik ve Genotipik Analizi

Abstract

Bu çalışmada, Van ili ve ilçelerinde halk elinde yetiştiriciliği yapılan tavuklardan ve Van Gölü Havzasının değişik noktalarında insanlarla ilişki halinde olan martı popülasyonlarından alınan dışkı örnekleri enterokok türleri açısından incelendi. Bu amaçla 500 tavuk ve 500 martı olmak üzere toplam 1000 adet dışkı örneği toplandı. Tavuk dışkı örneklerinden 192 (%38.4) ve martı dışkı örneklerinden ise 119 (%23.8) olmak üzere toplam 311 (%31.1) adet enterokok izole edildi. Tavuk orijinli izolatların 41 (%21.3)'i Enterococcus faecalis, 110 (%57.3)'u E. faecium, 9 (%4.7)'u E. casseliflavus/gallinarum, 27 (%14.1)'si E. hirae, 5 (%2.6)'i E. durans olarak identifiye edilirken; martı orijinlilerin 78 (%65.5)'i E. faecalis, 21 (%17.6)'i E. faecium, 10 (%8.4)'u E. hirae, 7 (%5.9)'si E. casseliflavus/gallinarum, 2 (%1.7)'si E. raffinosus, 1 (%0.8)'i E. durans olarak tanımlandı. Fenotipik analiz, antibiyogram testi (disk difüzyon yöntemi) ile yapıldı. Genotipik olarak ise 16S rRNA, 16S ve 23S arası bölgeler, esp, vanA, vanB ve vanC (C-1,C-2, C-3) genleri analiz edildi. Tüm izolatların antibiyotik dirençlilikleri dikkate alındığında, en fazla dirençlilik sefadroksil (%99.5) en az dirençlilik ise imipenem (%0.8) karşı saptandı. İzolatların 9 (%2.9)'u fenotipik olarak vankomisine dirençli bulunurken, 20 (%6.4)'sinde genotipik olarak vankomisin dirençlilik geni (van) belirlendi. Bunlardan 6 E. faecalis (1'i tavuk, 5'i martı orijinli) ve 3 E. faecium (martı orijinli) izolatının vanA, 6 E. casseliflavus/gallinarium izolatının vanC1 (2'si tavuk, 4'ü martı orijinli) ve 5 E. casseliflavus/gallinarium (tavuk orijinli) izolatının ise vanC2/3 geni taşıdığı tespit edildi. Martı izolatlarında vanC2/3 genlerine raslanılamazken, tavuk ve martı orijinli tüm izolatlar vanB geni açısından negatif bulundu. Sonuç olarak, bu araştırma ile bölgemizde ilk kez vankomisin dirençli enterokok türlerinin varlığı ortaya konuldu.