Doktora Tezleri
Permanent URI for this collectionhttps://hdl.handle.net/20.500.14720/12
Browse
Browsing Doktora Tezleri by Author "Acar, Sümeyra"
Now showing 1 - 1 of 1
- Results Per Page
- Sort Options
Doctoral Thesis Phenetic and Molecular Methods for Characterization of Salmonella Enterica Subsp. Enterica Serovar Enteritidis(2012) Acar, Sümeyra; Atalan, EkremÇalışmamızın amacı, ülkemizin çeşitli illerinden izole edilen insan, gıda ve çevresel kaynaklı Salmonella enteritidis suşlarının neden olduğu enfeksiyonlardaki direnç sorununu öncelikle antimikrobiyal duyarlılık testi ile ortaya koymak ve izolatların fenotipik ve moleküler karakterizasyonunu yapmaktır. Çalışmamızda, Türkiye'nin 9 farklı ilinden izole edilen insan, gıda ve çevresel kaynaklı toplam 55 Salmonella enteritidis suşu üzerinde çalışıldı. Test mikroorganizmalarının moleküler karakterizasyonu için plazmit profil analizi ve PFGE (Pulsed Field Gel Electrophoresis) yöntemleri kullanıldı ve analiz sonuçları dendogram olarak sunuldu.Suşların antimikrobiyal duyarlılık paternlerini tespit etmek amacıyla 21 antibiyotik diski kullanıldı. Suşların tümü; amikasin, siprofloksasin ve gentamisin antibiyotiklerine duyarlı bulundu. Diğer antibiyotiklere karşı %1.81 ile %12.7 arasında değişen oranlarda direnç tespit edildi. Çalışmada incelediğimiz 55 Salmonella enteritidis kökeninden 50'sinin (%90.9) plazmit taşıdığı belirlendi. En sık görülen plazmit profilinin; 57,46 kb'lik plazmitin tek başına ve diğer plazmitlerle birlikte taşındığı pek çok profil olduğu belirlendi. 55 izolatın DNA profillerinin karşılaştırılması sonucunda 15 ayrı PFGE paterni elde edildi. Klonal olarak ayırt edilemez 38 izolat %95 ve üzeri benzerlik oranında 3 ayrı PFGE paterni içerisinde yer alırken, yakın ilişkili 11 izolat %85 ila 95 arasında benzerliğe sahip olup 6 ayrı PFGE paterni içerisinde yer aldı. Klonal olarak ilişkisiz 6 izolat ise 6 ayrı patern içerisinde yer aldı.Plazmit ve PFGE sonuçları bionumerik programında analiz edildi ve sonuçlar dendogram şeklinde sunuldu.Bu çalışmayla, halk sağlığı açısından önem arz eden ve zorunlu bir patojen olan S. enteritidis'in iki farklı yöntemle alt tipleri belirlendi. Ayrıca gıda, çevresel ve klinik izolatların kullanıldığı bu çalışmada, S. enteritidis bakterilerinin epidemiyolojik karakterizasyonunda plazmit profili ve PFGE tiplendirme metodlarının güvenilir olduğu belirlendi.Anahtar kelimeler: Salmonella enteritidis, Plazmit, PFGE, Antimikrobiyal duyarlılık.