YYÜ GCRIS Basic veritabanının içerik oluşturulması ve kurulumu Research Ecosystems (https://www.researchecosystems.com) tarafından devam etmektedir. Bu süreçte gördüğünüz verilerde eksikler olabilir.

Doktora Tezleri

Permanent URI for this collectionhttps://hdl.handle.net/20.500.14720/12

Browse

Browsing Doktora Tezleri by Department "Fen Bilimleri Enstitüsü / Bitki Koruma Ana Bilim Dalı / Biyoteknoloji Bilim Dalı"

Filter results by typing the first few letters
Now showing 1 - 1 of 1
  • Thumbnail Image
    Doctoral Thesis
    The Survey of Some Wheat Viruses in Wheat Production Fields in Eastern Anatolia by Multiplex RT-PCR Method and the Molecular Characterization of Virus Isolates
    (2013) Usta, Mustafa; Sipahioğlu, Hikmet Murat
    Doğu Anadolu Bölgesi buğday alanlarında Arpa sarı cücelik virüsleri (Barley/Cereal yellow dwarf viruses: BYDV-PAV, BYDV-MAV, BYDV-SGV, BYDV-RMV ve CYDV-RPV), Buğday çizgi mozaik virüs (Wheat streak mosaic virus, WSMV) ve Toprak kaynaklı buğday mozaik virüslerini (Soilborne wheat mosaic virus, SBWMV) belirlemek amacı ile 2012 yılında survey çalışmaları yürütülmüştür. BYDV (PAV, MAV, SGV, RMV) ve CYDV-RPV'nin varlığını araştırmak için multipleks RT-PCR yöntemi, WSMV ve SBWMV'nin varlığını araştırmak üzere RT-PCR yöntemi kullanılmıştır. Çalışma ile aynı zamanda SBWMV'nin protozoa vektörü olarak bilinen Polymixia graminis PCR yöntemi ile araştırılmıştır. Bölgede varlığı tespit edilen virüslerin kılıf protein genlerinin moleküler karakterizasyonları da gerçekleştirilmiştir. Bölgedeki buğday tarlalarından rastgele 900 adet buğday yaprak örneği ve 78 toprak örneği toplanmıştır. Toprak örneklerindeki protozoa vektörü, tuzak bitki yöntemi ile buğday bitkileri yetiştirilerek araştırılmıştır. Testlenen 900 buğday örneğinden 50'sinin BYDV-PAV (% 5.5), 44'nün BYDV-SGV (% 4.8), 4'nün CYDV-RPV (% 0.4) ve 8'inin ise WSMV (% 0.8) ile bulaşık oldukları tespit edilmiştir. Yürütülen testler sonucunda toplanan buğday yaprak örneklerinde SBWMV, toprak örneklerinde ise vektörü P. graminis tespit edilmemiştir. Tespit edilen her virüs türünden birer izolat seçilerek kılıf protein genleri karakterize edilmiştir. BYDV-PAV (Gen bankası Ulaşım No. KC900900), CYDV-RPV (Gen bankası Ulaşım No. KC900903) ve WSMV (Gen bankası Ulaşım No. KC900901) virüslerinin kılıf protein genlerinin tamamı ve BYDV-SGV (Gen bankası Ulaşım No. KC900899) virüsünün ise kılıf protein geninin bir kısmı klonlanarak üniversal primerler ile DNA dizilemeleri gerçekleştirilmiştir. BYDV-PAV Van izolatının dünyadaki 19 farklı izolatın nükleik asitleri ile % 82-% 94.2 arasında ve amino asitleri ile % 73.5-% 93 arasında değişen oranlarda benzerlik gösterdiği belirlenmiştir. CYDV-RPV Van izolatı nükleik asit düzeyinde dünya izolatları ile % 83-95.7 arasında BYDV-SGV Van izolatı % 69.1-% 98 arasında WSMV Malatya izolatı ise % 88.5-%97 arasında benzerlik gösterdikleri belirlenmiştir. Bu çalışma ile BYDV-PAV, BYDV-SGV, CYDV-RPV ve WSMV virüsleri Doğu Anadolu Bölgesi'ndeki buğday alanlarında ilk defa rapor edilmiştir.